FOXD3_PITX2
CAP-SELEX sample PITX2_FOXD3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCACCCCAACTCGCTCGCGCGGCGTAAACGATCACATATG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:e81bc71a52b1
|
40 | — | — | — |
|
CGTACACGCACAAACGCTTACTCTGATGTTGAGTTCGCGA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:5f44494eab63
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTAGAACATGTTGCATCACCATGCGTACCGGGCCGCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:aef418851d08
|
40 | — | — | — |
|
CAATCCTCATGTCAACATTATCCTTAAGGCTTACTAACGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:e6875d2c7d97
|
40 | — | — | — |
|
TACTGGTCCAAGATCCTGATCCTGTGCAACCGCCAACGTG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:789a4a7dc00c
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCAAGAAGTACACCTGGCCCCCGCCGCGGCCCAAACC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7754aaffc65e
|
40 | — | — | — |
|
CACTCACATTGGCGTGAACAAGGGCGACAGAGCCGTTACC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:aae88c29c5e0
|
40 | — | — | — |
|
TATTCCTGCTCTCTCTCTACGCCCTTATTACTATTCCTTA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:1c41928a2106
|
40 | — | — | — |
|
CGATTGCACCCTCACACGCTTTCGGTCACACCTACCCCGG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:09d97d4a7fa6
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCACAGCCGGACCGTTGTCGACCTTCCGTTAATGTCT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:bcace72cb018
|
40 | — | — | — |
|
CCGTGTCTTTCTCCCGTCTTATCAGCTGCCCCTGCTCGCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:2af909323ec3
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCGTTAATCCCTAAGCTAATAATTACGATGCCTTTGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:a2d82dfd6913
|
40 | — | — | — |
|
CCCACTACCTCCCCAAGCAGCTCGCTCCCCCACCCTCCAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:5766d80c2e29
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTAAGCCAAGATAATGTTAGCATAGACCCTATTAGAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7f881bad9ae4
|
40 | — | — | — |
|
CTCCTCCCCTGCCCCTCACTTGCCCCCCTTCATTACCTTG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:0a90e1974b70
|
40 | — | — | — |
|
CTTACCTTTTGACCGTGACAACGCGTCACCCGTATTTCAG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:28125c367449
|
40 | — | — | — |
|
CTTAGTAACGTAAACAATCAGATAAGCTATTGAGACGTGA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:38dd62aa7ae5
|
40 | — | — | — |
|
GCACCATCGCTAATCCTTAATACAACATTCGCCAAGCACA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:2f30a7d69ce6
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCAAGCTTATTCTAAGGATCAACGATTTGTTGACGCT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:445d1ce0e3d2
|
40 | — | — | — |
|
ATTATTCTATCATAATGTTATTGCATGTCCTTTCGACGAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:e8ea1abce079
|
40 | — | — | — |
|
TCACTAATCCTTACACAATCTCTACACATTCGCTTATACA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:e8ed55fb0653
|
40 | — | — | — |
|
TTAATCCGTTATGTAAACATAGTAACCATTGCCTCCTGGC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:853060cd7aa7
|
40 | — | — | — |
|
CCAAATCCCATTAACCCCAACGATAACATTATCCTGACGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:0cc54b7d9375
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCGCCTTAAGCCTTAAACCCTAAACTAACGATGCACA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:d1c0e6b270d1
|
40 | — | — | — |
|
ACGGCAACTAATGCATAAATCAATGTTATCCTAAGTGCAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:0d35ae5dd475
|
40 | — | — | — |
|
TGGCTCCTTATGTCAACGTCCATTAACCCTAAAACTAACA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:6d7cb751be3e
|
40 | — | — | — |
|
CCTTATAGCGCTAATCCAAAGGTAAACATACATTAGCGCA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:b046b6990fec
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTATTAACGTGCGTCGAAACGCATAAATATTGACATA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:85a78075c253
|
40 | — | — | — |
|
AAGATGCTATGCATAATGTTATTGATACTAATCGCCGAAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:93d86a7b0530
|
40 | — | — | — |
|
TTGCACTAATCCCTATGTCAACAACCATACGTATGCGCAA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7a8afb74b05a
|
40 | — | — | — |
|
CGAATAACACAAATAAACAGCGTAATTCCTAAGCTAACGA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7e9b033b1ac4
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAATGTGGCAGGGTGTAAGACAATTTGATCGAGTCT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7f3e5561c716
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTTCATGGGCTAATCCCAAACACAAATGTTAGTGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:cf00bf55a9e6
|
40 | — | — | — |
|
CCTACACCCCAGCTAATCGCAACAATAACAGTGCAACAAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:2e1cf0260bbc
|
40 | — | — | — |
|
ATTAACAGGGTAAACACACTCCATAACTAACCGTGTGTTT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7df08945be03
|
40 | — | — | — |
|
TAAATGTTTGCTTAGTATGGGATAATCCTCCATGCGCAAG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7178a9828437
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCAAAGCAACGTCCCATCTCCCACCTTCCCTGCATGC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:794aec6b7667
|
40 | — | — | — |
|
CTTATAATCCACGTTGCACGTTATTTCCTGTGTTTGTTTT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:62fe013a9dd8
|
40 | — | — | — |
|
GACCGATCCCCGTTAAGCCTTAGAATAACAAGCACGCCTA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:99c7d07e05b4
|
40 | — | — | — |
|
GCGTACCATGACGTGTCGACATAAGGGATTAACGTGCGAA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:e84a0edb3e0c
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGGGAACGGCTCATACAACACGCTTTCGCTTAGCCAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:7e5a7a60f86f
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCTTTCAGCGTGCTTACAGGCTTAGCAACGTAAACAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:96efbc41132c
|
40 | — | — | — |
|
CATATTGCGCAAACATTACGCTAAGACCTTAGCAAAATAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:c13976fe7d35
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTACGTATCAGCTATATTCCTTATCCCCCTTAGGTAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:884e763591b0
|
40 | — | — | — |
|
TAAACGAACAGTAAGCCCTAAACAAATCCTGCGACGCGCA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:53f89188b26f
|
40 | — | — | — |
|
CTTAAGTCTTAGGAAGCTGTACACGTCCTCAGCTTACATG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:3fb65a6f564e
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCCAAGAAACGCCCCATCCACCAGACCTACCCATCC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:b124f9105fe0
|
40 | — | — | — |
|
TATGATCGCGAATGGATTAACAAGGGAATGACGTGAGGGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:039e46754c07
|
40 | — | — | — |
|
GTAAATATTGGTTTATGCATTAGGGTCTCGCATGTCATAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:e3508e59ff2e
|
40 | — | — | — |
|
TACCACAAGACCGCATACACAAACATACAAGACCATTCGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_PITX2:PRJEB66722:R3:874995e6716e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final