FOXD3_POU3F4
CAP-SELEX sample POU3F4_FOXD3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATAGACACAAAGAGTGTAATAGACATTACTAGCACGCTAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:82441978a751
|
40 | — | — | — |
|
AACTAGTGACGGTGAAGTGCAAACTGATGACAGACCTGTT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:41d451a28b1b
|
40 | — | — | — |
|
TACTGCATAGCAAGAAATTGTAACATTACAAAACTAAGAA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:e264f47a9428
|
40 | — | — | — |
|
CGTAACACACTGGGCGTAAAAAGTAACAATGGGCAACATT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:99e28bc2b82b
|
40 | — | — | — |
|
GTAACAAGCACTTACGATGAGAAAAACTTACAAGGACGCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:3889446695e5
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGGGTTATCAACGCGTCGCGCTAATGATATGCGCGGC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:99cedd64ee9f
|
40 | — | — | — |
|
AGTACGCCACTGCATAACTATGGTAATTCCTCGCACTTAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:604db3255e3e
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCGTACGACATAAGCATGCTGACTGTAGACATGGCCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:310ad5c826ef
|
40 | — | — | — |
|
CCAGTTCGCGCGGCGCATCGTTCTTACTCGCCACTTGACT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:2e303eecc452
|
40 | — | — | — |
|
CGGTAATCGCATGGGGGGGATGTTACAATGAAACCGCATT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:4f45d4eab901
|
40 | — | — | — |
|
CCACTATAAGATCCACCTTCCCCACCGCGTAACCAAAGAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:a67edd7c765c
|
40 | — | — | — |
|
TATTTGCCCGCATGTCGCGACGCAAACGGGCCACGCCGCC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:61af726c4e76
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTCACGACGCACGGCCTAACACACGCGGCCTACTGCT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:ec7e1882c333
|
40 | — | — | — |
|
CGAATGAGAGCAGTCGTTACATTCCCTGTAAACCAAGGAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:1f745d985c09
|
40 | — | — | — |
|
ATAGCACAATCAATGCGCGACAGTTATAAGCCGACACCCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:574d9e3006d5
|
40 | — | — | — |
|
CCACGAATGTTTACAAATAATGCTAAGTCAACGCACTAAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:b3206a45fa9a
|
40 | — | — | — |
|
CTTATGTATGTGTATCCCAAATCAGTCGTCGCAGCATTAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:5bfa0ba544c2
|
40 | — | — | — |
|
ATCAGTATGACACCTCGCCTCTTGACAATACAAACGCGCT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:00e3b469f0f5
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCTATTTAAAAGAGTGCACGACCACGATCCAGGTAAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:511411174b7a
|
40 | — | — | — |
|
GTCCGTACTCAAAATAAACATAAACCTATTTACTCTTACA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:aad76ae96a0a
|
40 | — | — | — |
|
CTACCCGATTCTCACGGTTCCCTCCACCGACATAGCGCAA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:594a7d9b0177
|
40 | — | — | — |
|
CTAAATGGCCTCCACTATGAACATAACTACGGGCATTACC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:56ca37a37f50
|
40 | — | — | — |
|
TCCTAACATCCCAAGGAATTACGCAGGCTTGGATTTAACG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:8140f1997d7b
|
40 | — | — | — |
|
TACCGGAAGCACCACACGATCAACTCCGCTCTTAGAAAAG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:af191d2eeaf7
|
40 | — | — | — |
|
AGCACCGAACCAGCACCAAAACCCTCAGTACAGTCCCCGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:a32726ee86e3
|
40 | — | — | — |
|
ACGAAGGTACGGTGTAGAGGTGACGTACACTTAGCGTGTG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:e516a7ebadd2
|
40 | — | — | — |
|
TGCATTACCTATACTTATCCTCCTTGGTCCTCATTTGCAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:963791b59c86
|
40 | — | — | — |
|
CTGTTGATGACGTGGTAGGACCGTTACTCCCTTATCTGCC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:98ea34c18d3f
|
40 | — | — | — |
|
CATAGTAGCGTTACAGCAACTTTGCTCACGTTCTCAGGCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:2eecd0e554a3
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCCTTACCACCACCTTAACGCATTAATCAATGCCGAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:3333e22d76fd
|
40 | — | — | — |
|
CTATCAAGCGGTCCCACCAGCATCTCCCCTCATCCCAGGC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:ca3b0cadf2ae
|
40 | — | — | — |
|
CAAACCTCCCCCACATATAGACGCGGTTGCAACGCCAGCG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:73fe76b312c0
|
40 | — | — | — |
|
ACTGCATACGAATCCATTGTTTGTTTGCATTAGCATAACT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:a8ed3d44279a
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGCTATTTGCCGCATTTTGTAACGACAATGCCGCAGA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:8d0cd7f783ea
|
40 | — | — | — |
|
GAATCTCAGACCATTAGTGTCCCCCTGCCCTCACCCTAAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:0b061980e707
|
40 | — | — | — |
|
GGACGGCGGCTTTAAACAGGTATAACGGATTAGCAAGCAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:9a6662e57c3d
|
40 | — | — | — |
|
TGGCCGCGGTAGTGGGACCCCGAGGCAAAGGCGCATGTAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:325b3143fda6
|
40 | — | — | — |
|
GTTGGCGCATAGGAGGGTATAGGCACCAGCCAATACTCAT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:960a2b3142c5
|
40 | — | — | — |
|
AGATAGGTGTCCCAGAACGTGAGGGGCAGTGGAGAAGAGC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:6763176e61e0
|
40 | — | — | — |
|
TATATAACCTACTCTGACACTAAGCACAGGGATACAATAA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:8a1194032738
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGTGTAGCACCCTCCACGTCACGACGTGACAATGCGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:ed88da92db77
|
40 | — | — | — |
|
TGAAGGTGAACGACCAATTCCGACATGCTTACCTTCCCCC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:b95c15fe08f7
|
40 | — | — | — |
|
CCAACCACAAGTGGTGTTAAAAGGCTCACAGCCCCCTGCC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:c9ebf3f4b6d7
|
40 | — | — | — |
|
GACTAACACGCCGTTTGGATGGTCATTTTACAATTGTTGC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:f395b4576cd6
|
40 | — | — | — |
|
TAACATTTGACTCTACATGCGATAATTATGTTAACACTGT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:55f9daf9fa1b
|
40 | — | — | — |
|
ACTTTAATTAGATCTACGTCTACTAGCTGGGTTAAGTAAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:c0677cfc365d
|
40 | — | — | — |
|
CATTACACCCTCACATTAAGTGTTAGCAAGTTGGAAATAC
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:e8ddd7681c83
|
40 | — | — | — |
|
TGTAAAAAGCATGTAATCGGTAGCAGCATTTCTTGTCTCT
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:780f80b57602
|
40 | — | — | — |
|
CGGTGTAACACTTTTCCTCTACGCTGGACAATATGAATAG
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:0219bc282cb4
|
40 | — | — | — |
|
TTACCTACACAATCATGCATCTCTACCCCGTGCTATGTTA
PANAPTA:Q9UJU5:FOXD3_POU3F4:PRJEB66722:R3:b756cc1dbcfb
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final