FOXO1_HOXD10
CAP-SELEX sample HOXD10_FOXO1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
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GCATTACACGATCTATGTCATAAGCGTTTTCTTTGTATGA
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:649761d669a8
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40 | — | — | — |
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TTGTTGACAACTGCTCTGTAACTTTAACGACCTGTTGTGC
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40 | — | — | — |
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ACTCGCCGCTCGCGATGGGGTGTTATCCCACACACTCCCC
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40 | — | — | — |
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ATAGCGCTTTACGATCTACTAGCGATCGTAAAGGCGTTAC
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40 | — | — | — |
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ACATCATCATAGTTGGCCATTCTATTTTACGATGTTTGCG
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40 | — | — | — |
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ACGTCCCCGACCCCTGCCCGCCCCCGGACAACGCTCCCAC
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40 | — | — | — |
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CACCTGTCATTAACAAGGCCGCCCTTAACTCTTGGCACTA
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40 | — | — | — |
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GATGTTAATCGTGCTCGGTAAGTTTTTACGACCTTGTTTA
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40 | — | — | — |
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AGTATGAGCCGCCCCCCACCCCGTCCACCCACCTGTCCAA
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40 | — | — | — |
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CTACAGTTTATAAATAACATCTTTATTGCCCTGTTATTGC
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40 | — | — | — |
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ACCAAAGAGGATGAGACCTGTTACGCAATTAAGTAACGCG
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40 | — | — | — |
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TTTTATGACCTTGTTGACGCGCCTATTATTTACGGGAGGG
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40 | — | — | — |
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TTAGTGCAGAAGGCTGTCAACATCATTATTGTTTTACGAT
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40 | — | — | — |
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GCGATACGGGTATACAAGTTTTTATGACCTTATTGATCAT
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ee249f659b61
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40 | — | — | — |
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CGCATGTGCGTTTTATTACCTTGTTGACTAGGGCCTTCCA
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40 | — | — | — |
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ACCTTTTTATGTCAGTGTTGATCTATTTATTCCATATTAC
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40 | — | — | — |
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TACAGTCTCGTTGGGTTTACGATGCAGCTTTATTATGCAT
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:fd33993d5568
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40 | — | — | — |
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ATCGCAATGTCTCAACAACGAGTTTTACGACCTTGTTTGC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:afad9e8c3976
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40 | — | — | — |
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GTCGGTATCAACAACTTCGATTGTTAATGCAGTTTGTTGC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:87c7aec0999c
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40 | — | — | — |
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TTATTAATGTTTTATTACCTTGTTGGTGATTGTACTGATG
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:a681563e93df
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40 | — | — | — |
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TTAATTACCCAGGTTCTTCCGGTGATTAAAAGATCCTTCT
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:b258da6ff831
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40 | — | — | — |
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CTTACGTAAACAAGCACACAGGTAGGACACCATAAAAAGG
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:5da7b02668a8
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40 | — | — | — |
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TTATGTGTACTTACGTCATTACGCAATTGCTATACGCATC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:8332e5f691cc
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40 | — | — | — |
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TGCTGGGTGAGCAACATGTTTTACGGCTTGTTTCCTCTAC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:f0e5bdbe4f93
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40 | — | — | — |
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AATCCTCTAATTACCACATTATGTTGCCCTTTTAATGACC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:64c5698de288
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40 | — | — | — |
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CATACCACTTTCCGTTTTACGACCTTATTGACATGCCGGC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:134a002260ff
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40 | — | — | — |
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TTGAGTGGGCTGAAATTTTATTACCTGATGTGATCCACCA
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:d0fc09feedd1
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40 | — | — | — |
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CGGAATAACATTTTTTTACGACTCTACTGATACGACGTGC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:d1f31230c25d
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40 | — | — | — |
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CTTATGCGTGCAAGATAATAGTGTTTAATGTGTCCGTGTG
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:8ade5a03a235
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40 | — | — | — |
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GCACACGGTCTCCCCATAAAACGGTAAGTACCCTGTTGCC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:92e98a95d99e
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40 | — | — | — |
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ATCAACCATTGTCTCGTTAAACTGACATGTTCCATGCGTA
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:783c86696390
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40 | — | — | — |
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CGCGCTTCTGCATAAATCACCCATTAAACCCCGAACAGCA
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:cf1ba534a652
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40 | — | — | — |
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AATATGGTCGTAAAACTAACGAGATGTTGTTGTTATACGT
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:af0afd69891c
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40 | — | — | — |
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TTGACGACATACTTAATGTAGACCATTAAATCGATCGATC
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:a18a11648adf
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40 | — | — | — |
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GACATTTTTATTACCATATTTATGCCCTTATCCTGTTTGA
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40 | — | — | — |
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ATTTTTATGTCCTTGTTGTTTCGACACTGTGTATTGGACG
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40 | — | — | — |
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TTATGCGCGGTTAGTTATATTACCCTTTACGTCATTACGA
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TAAACAGGGTAATAAAACCGCCTGTTAGTCCGTCACGCTG
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:31ffef3a09a1
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TCCCGACGGTAATGCCATGGTCGTAAAACGGACCCACCAG
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40 | — | — | — |
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TTTGCCAAATATCAACAACATGTACGTTTTACGACCTTTG
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ea2e4cee760d
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40 | — | — | — |
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TTTCTCCGTTTTTATTACGTTATGTGGTCACCTTCCAACA
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CGCTGCGATAATTGCTGTTCATTAGCAATAACTCGATCCC
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TGATCATGAGCGGCCGAATCCGTCAACATCGTAAAACGTA
PANAPTA:Q12778:FOXO1_HOXD10:PRJEB66722:R3:7de34c3e14a7
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40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final