GABPA_GLI3
CAP-SELEX sample GLI3_GABPA · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCTTCACGTGTACTTCCGGCGGAAACGCTTGGACCACACA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:88709e75ab29
|
40 | — | — | — |
|
CCAAATAACCGATCACCGGAAGTGCACCACTTCCGGTGTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:1c0c59686766
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGCATCCGGCCCACCCAAGAAGCCGCACCGGAAGGTA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:9c59d75331fb
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGTCGCTAGCCGTAGATACGACCGGGACCACCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:c041b3d4a1a7
|
40 | — | — | — |
|
GAGAACGCTACCGGATGCTGGCTTCCGGTAGTAACAGTTG
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:0da3a7c0788e
|
40 | — | — | — |
|
CGCGACGATGTGCACCTGCTTCCGGTGCCTAGACCACCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:1463bc42d25a
|
40 | — | — | — |
|
ATCCTCTTTATGGAACACCGGAAGTGACGACCACACACGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:a21cef1cad62
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTTACAGACGCGCAACCGGAAAGGCGTTCGACCACC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:7864526d7f71
|
40 | — | — | — |
|
ATCTAGCGGTTAGACCACACACAATGCAGAACCGGATATC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:9796c5236554
|
40 | — | — | — |
|
ACCAGGATAACGGGGCCGGAAGTTGATGGTACTTCCGGTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:f5166c3818cd
|
40 | — | — | — |
|
GGCAATTGCCGTAAGCAGTGCGTTCCGGTATTGCAAGCGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:570480295690
|
40 | — | — | — |
|
GCACGGCCGGACCACCCACTACGCCGGATATCCTGCCCCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:7d77e64baa7b
|
40 | — | — | — |
|
ACTCGTAGACCGGAAATCAAGAAAAATTTACGAGTCACGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:024fcd967aa8
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGCTCTAAACCGGACCACACACGATGCGACAAGAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:0defbf19e0be
|
40 | — | — | — |
|
CACCGCCGGAAGTCTTACTTACTGCGGTCCCTTCGCGCGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:88797857ca17
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTCGACCCCACACATACCGGAAGATTCGCCATCCGGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:8f72a142b374
|
40 | — | — | — |
|
CCAACTTCCGGTAAACACACCAATCACCGGAAGTACCTTG
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:c8348256a3de
|
40 | — | — | — |
|
CTTCTCTGACGCGTAAGTGTGTACTTCCGGTCGTCCGTGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:132072a5f258
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTAAGTAACATTACTTCCGGCATCGAGAGGAACCATA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:4203357262b3
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTCTGCGTAGGCATAGTTCCGTTGATAAGGACCACA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:8a385e35932f
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGGGTGGCCTAGCTGGTCCGATTCGCCCTTCCGGTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:b5e1fa03ae8e
|
40 | — | — | — |
|
TTGCAGGACCACACACGACGTGCGACGGAAGTTCCGGTGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:cd47e5a96640
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTGTCCCCAACAAACTTCCGCCGCACGGAGACCACC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:6740e547bb29
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCTGGATACAACACGGAAGTACGTTAACTTCCGGTGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:092984030e2b
|
40 | — | — | — |
|
TACTTACGGTCTCACCGGAAGCAACTGGTTCCGCCTGGCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:269988639f67
|
40 | — | — | — |
|
GCCTACGAAACCAAGACTTCCGGGCCACCCACGTTGCGCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:f2632e7eb81f
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGGAAGTCACTTCGACTTCCTGCACTAGCAGGGAGCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:eaeb65e7d50c
|
40 | — | — | — |
|
GTTGGACGCACAACTTCCGGTACTTAGGCCGTAAGTTCGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:03d894de2933
|
40 | — | — | — |
|
TTACCACATAGAACTTCCGGGTGTGCCGGAAGTAGCTTTG
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:8d70592109fb
|
40 | — | — | — |
|
AAATGAGTATAAGCATCGTGTGTGGCCTTGTTTCCGGTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:52a804f79862
|
40 | — | — | — |
|
TACCGGAAACGCTGAACCGTCGTTTCCGGTGCCCTCCGCT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:90e56e36ea8c
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGTGTACCGTAAATAGTAGATACTTCCGGTTCACAGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:39e8eaa50a7c
|
40 | — | — | — |
|
TTACTTCCGGTTCAACACGTAAGTATTCATCATAAAGCGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:18a1b5cfd030
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTTGCGTTGGACCTCCCAGACACAGGAAGCGTCATT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:5576b5c8db66
|
40 | — | — | — |
|
TATTTCCGGAAGCTAATGTTACGGAACTCACCTTTTATTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:f74ad525d3a6
|
40 | — | — | — |
|
GCCTTCCGGCCGAGCACGTAAGGTATAACAATCGACGCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:da34c9728803
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTGCTCGAGCAGGAAATGATAATTGTAGGGACCACC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:9567ad2678a0
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTCCAAACCCGCCCCAGCCGGATATCCGGACCACCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:593ae74d7876
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGCTTGAATACAAGGCCGTAACTCGCAAGTTCCGGTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:20a80fef7e66
|
40 | — | — | — |
|
CGCAAAGTTGCCTCCTTGTCCCTAACTTCCGGGCCACCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:a78cb8c191dc
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGAAAAAGGCCCACCCACAGACCGGAAGTTCTACATC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:113bf3f60f23
|
40 | — | — | — |
|
ACGATATGCATATCCTGTGTTTCGCCGGATGTGCACGCGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:59a9ee32d67f
|
40 | — | — | — |
|
GATCATTACCCAACTTCCGGTCCAGCCGGAAGTCCCACCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:9b92cdd8fba7
|
40 | — | — | — |
|
AACGCAACGAGGTGTGTGGCCAGGATATCCGGAATAACTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:7b07687f021b
|
40 | — | — | — |
|
ATTGTTGCTGACCGGAAATAGGAATTTACGGCCTCAGCCT
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:2fbac27fc4bb
|
40 | — | — | — |
|
GTTCCTATAAAGTACGGCCATGCATGATGTTGAGGTTGGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:56350cdd199f
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGTGGATATACTCCTACCGGAAGTCGACCACACACGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:23f9b188a34b
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGCCGGACGTGCTTCACTTCTCGGCGAAACGGCAGGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:68a9923fdca4
|
40 | — | — | — |
|
GTAACAAGGAAGTCAATTAACGTGCAACTTCCGGACCACC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:7b8977836bf8
|
40 | — | — | — |
|
GCACTTTCCCGGTACCTGCACCGGAAGTGTGTGCCGAAGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_GLI3:PRJEB66722:R3:99d961b3bdad
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final