GABPA_HOXC10

CAP-SELEX sample HOXC10_GABPA · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
GACTCGTGACCGGATGCGCTAGCCGGAAGTGTATTCATAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:693bbcea5136
40
CCGCTACTTCCGCTTCCGCTTTCAGTTGCACGCGTGTCGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:3c392dc38034
40
CCCTGACTGCTGTGCTCCTTCCGGCGTACTCTTCTGCTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:6e78e86ff2c3
40
ACACCGGAAGTACCACTTGGCCGGTGTCCGCCGCTGACAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:9953ab0a34a6
40
CAGGACCTTCGAGACCATTCCACGCTTCACTGGTCCAGTG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:d02d4611e1d0
40
TGCAGACAACAGCCCTGTTCTGGAACATTCTGGACGGCAT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:19b1d75f6ebb
40
GCATGGCGACTGCCGCCAACAGCTAATCTACTTCCGCCTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:e594c0b039ca
40
TATCCGCATGTATCGAATGTTCTCGAAAACTGTCCACAAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:53bdd7b8f4ec
40
GACCACCACCTACCATAGACCGTTACCTCCCCTCCCACGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:cfa348323b70
40
TTTAGGTAACCACCCCCTTTTGGGCGGCTTTACAGAATAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:55a0204a417f
40
CTCCAAGTGCTATGCAATTCATCTTCGTTACCTAACCCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:74ce44f2af31
40
ACCACCTTCCCGTTCGCACCCTACCTGCCTTTCACCCTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:f42c9e2e3ff6
40
CCCACCACCGCATAGGTGGCCGTCGTGGCATTTCCGTTAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:5b77b055e7f1
40
CCCCACCGCGTGTATTACCCCACTTCCCCCACCCTGTCCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:465265b9b8aa
40
TTCCTACACTTTCCTGAACCTTCGAAGCGCTTGCAGGTAG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:0fbdd1ef405b
40
CGGGTCCCATAACATGCGCCCATCGTTCTACAGCCATTAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:b1e6eab04f15
40
ATATCGTCTTTTCCTGTTCATTCTCCTATGAATCGCGCCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:9fb41ae3df98
40
TGCCTTACACCACACTCTCCCCCTATCGCGACGTGGCACG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:0502acd23700
40
GAACGACGCACTAACTCGCGTCCATGGAAGTCACGTCCCG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:e8b14853a464
40
CACGCCCTGATGTCTAGAACATTCTAACCGCGATACGCCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:731b3766fa0f
40
CTATTGCGCACCCCGCGCAGAACATCGTGCTCCGTTTGCG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:6fe64de22578
40
AACGATACTCATGGAACGTTCTAGATAACGTACAACTAAG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:498b17ac55a3
40
TTGTTGTGAGGTATGTTTCTCCCATCTAGTGGGCTGTCGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:40e36a827d65
40
CTGGTACATCGCTCACGGTAAGTGTGTTCCTTGTCACTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:a358440655ee
40
CCCCTATATCATACAACGCACCCCTACCGATACGCCGTCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:68077ec4ae75
40
CCTCTGCCACCGCTTATCCCACAAAAATCCAACCCCCCTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:7c6d56c9b32c
40
ACAAACCACCGCATCCCCACTACACCTCCACCTCCCCCAT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:2412b6e773ab
40
GCGTCGACGTGTAGTCCATGCGGCCCCCCCGGAAACGTAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:5f30d2cfafd0
40
CCGAATGCTACTCCCCACCTACCGTCCACTGACACCTCGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:121993be0f64
40
TTCTGCTAAAATGCTATCGTACCCTCGTAGCGCCACGCGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:c7cbbdb36efb
40
CTCCCCCCATGTTCTATCCAGAACGTTCGACCACATATGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:4a3fbf6392d6
40
AATAATCGGAGTAATAGCGCTCTACTGATTCGAGAACATT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:7e60493d2c7a
40
TCATTCTGGAACATTCTGCCGACGAATATACGCGCGTGAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:ebfdfaeba940
40
AAAATGACGTTTCTCATGTCATGCTAAATCTAAAAGTGCG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:b489a613b162
40
TCATTAACAAAGCACTTCCGGTGCAACTAATGTACTTGGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:a4754e034660
40
CTCCTAGTTTATCGTCATGCTTCCGCTGGGACACCGGAAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:50bfa20a197a
40
GCGCACCTAGTTCGACCAGCTTCCGGTCTTACTCTCGCAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:0b94560150b9
40
GCCACACATACCGCATCTCCTCCACCCACCCACTTGCTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:85d384b00a2e
40
AAAACCCGACGACCTACCCGCCACTGGTATCACCGGTATC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:083265905a2e
40
CCTGCGATGGACCGTTAAATAGCATTTCCGGTCCGTCGTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:667690cdbb26
40
ACCCGTCGTAAATCTACTGCGCGTCGCCGCTGTCCGTCCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:81d7c2d69043
40
CCAATCCGGTGGCCCCTGCACCCTCTTCCCCATGCCACAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:6ef2bae5208e
40
CCCTTGTGTGTCGGTGACAACGGACGTCGTAACTTTATCT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:5482458ba0b3
40
CACCTAAGCTCAACACATTTAGCTCAGTCAATTAATCTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:15d7f93990d2
40
CTCCACATGAGCGCGCTGAGCAAGCACCGCCCCCACGCAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:6224cc1d61f3
40
TTTTCGTCAAACTACTTGCACCACACGCTTTATTGCCCTA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:83c049ba249c
40
TACCGCCACACCCTCCTTCCGTCTGGCCTCACGATTGCGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:f2e09acfee9f
40
CCTCCTGCGCCCACAACTTGCTCGAACGTTCCGCCGTTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:04064e295306
40
TCCCCCCCGTACCCTTCCCAGCGACCTCAGCGATCACAGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:9edd7380f415
40
CCGATATGTCCTAAGCTAAGATTTTTCTTCCGGTATCGGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXC10:PRJEB66722:R3:3089c0247910
40

SELEX rounds

R3 ·final