GABPA_HOXD4
CAP-SELEX sample HOXD4_GABPA · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGTTCGAGCACGATGGGACTTCCGGTTCATTCACCGTAAG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:15d19e9d0881
|
40 | — | — | — |
|
ACGGGATGACATTGCTCGATAAGTATGACTTCCGGTAATG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:126c9166fbfa
|
40 | — | — | — |
|
CAAGGCCAGCCGCGTAAATTGGTATCCTTCCAATTTCCGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:9fa08dd8be27
|
40 | — | — | — |
|
CAGAAGGCGATAAGTATCCCTACTTCCGCTTCGGGCAACG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:bb5c10dc87b3
|
40 | — | — | — |
|
CGTAACGCTTCCGGTTCAGGGTATCCCGTAAGCACAGGTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:f484ad46dbac
|
40 | — | — | — |
|
CCCCAAACCGGAAGTAAACTCACTTACGGCCGTCCGTCAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:d3ebf3b4f32a
|
40 | — | — | — |
|
GGCGGACAGCCGGAAGTCTCACTTACGGCACCGGAAGTTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:db7bcf7d683a
|
40 | — | — | — |
|
CTACACTTAACGGAACAGAGGTACCGGAAGTCGAACCCAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:f78606128c69
|
40 | — | — | — |
|
GCAACAACACATTTAACCGGAAGTGGGTCGACTTCCGGTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:db94619da771
|
40 | — | — | — |
|
GGGTTTAGACTTACTTCCGGTAGGCAGGCAACACCGGAAG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:eb87ed2a79b1
|
40 | — | — | — |
|
GCAAGCTTAGCTTCCGGTTGAACACGTAAGTTATTCTCGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:21c19e62992d
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCGGCACCGGAAATCTATTTCCGGTGGGAGCACAAGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:b63fffb6dc89
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACATTTCCGGTGTAGGACCGTAAATTTAGACGAAGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:497ea056f9c9
|
40 | — | — | — |
|
CGAACCGGAAACGTACCCGGAACACGCACGCCGTTAATGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:4a967dfec087
|
40 | — | — | — |
|
AAGGAAGTGACGGACCGGAAACCAAGATGTACTAATGATG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:c63d880e2237
|
40 | — | — | — |
|
AGATGACAACACCGGATGTAGAAAACATATCGCCGTGTTG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:1b800cdde10f
|
40 | — | — | — |
|
GCGGAAATAAAAGCTATTATCGTAGGCGGAAGGAAGTGTC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:0d544def18ac
|
40 | — | — | — |
|
AAGTGAGGCTAATTGCTTTCCCTTCCGGTCTGACACTAAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:b949355dc5a2
|
40 | — | — | — |
|
CACCGGAAACAACCACAATTAGGGAACGCTAAACTTCCGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:50e52242cb76
|
40 | — | — | — |
|
ATGGACACGGACCGGAAATGACCATTGCATCCGGCGGATA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:3677cdfab351
|
40 | — | — | — |
|
ACATAATGATCGATGTTTCCGGCCACCTTCCGCTTCCTGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:c084d6ec3223
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGTAAGCAAACTTCCGGTAAGAGCATAGGAGACGCAT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:1c171f8eaa87
|
40 | — | — | — |
|
CGATCTGCCGTAAGCGGTGGCTGCCGGCAGTAATCAAACT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:5c861a45ea1c
|
40 | — | — | — |
|
AACCGAACACCGGCACTCCGTTTCCGGAAGTTACGGTGTA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:109f07d35d00
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGTATTGACCGATAGGAACCGTAAGCTGTACTTCCGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:04d7c3d4880f
|
40 | — | — | — |
|
CTAATCCATTAATGAATCGAACATCCGGTACCGGAAGTCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:3702b76d5c34
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGAAGGCCTAGTCATTACCACACCTAGCTTCCGCTAG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:1034e4d21485
|
40 | — | — | — |
|
CGTCAGGCTTCCGGTGGCGACCGTAAACTCTGTGACACGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:e6d838387c0f
|
40 | — | — | — |
|
GGAAACGCGTAAGCTTGATATCTTCCGGTTACGAGTGTCC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:895f88aa7091
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAAACCGGATGTTCCTATCATTAACCTGGCCACCAGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:3091acfbbdda
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCACTTCCGCTTGTGGAACGGAAGTCAGTGCGATTAT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:99d09cbc41e7
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGAAATGGCGACACTAATGACGTCTACGCCCTCATCT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:a4d79a7701a0
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGTTGACAGTGGCCAAACACGTAAGTGAGCGCAT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:c8c18a0cecec
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCGCCGGAAGTCCCACTTCCTGCTGATGTAGCTTCAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:8e0017cc6043
|
40 | — | — | — |
|
CAACGGACGAGGCTGAACCGGATGTCCGGTCCACTAATGA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:c169e08fe953
|
40 | — | — | — |
|
AAAACGGAAATGCAAAAACCGTAAGTGAAACACTTCCGGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:14ddf74b261c
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTATCCGGCGTCACACAACTTCCACCGGAAGTTCCGG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:4212b478ca59
|
40 | — | — | — |
|
ACGACTGCCGGAAGCGGAAGTCAATCCGCCTAATCGACGT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:ffc57b4c0201
|
40 | — | — | — |
|
GAGTGATAGTTAGCGGCTTGCTTGCGAGCCGGAACTACCG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:04935f186fcb
|
40 | — | — | — |
|
TGGGCATGCAGTCTGACTTCCGGCGCAATGTCCGTAAGTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:f3f84fd5541e
|
40 | — | — | — |
|
TGTACACACCGGAAGTCCGGCAACACTAATGATTCGCCGC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:9357e3acdae4
|
40 | — | — | — |
|
ACAGAGTGAAACATTAAGTCATGACTTCCTGTTTGACAAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:0a5e8a2ea857
|
40 | — | — | — |
|
TGTAGCACCGGAAGCAACTACAATTAGAGGTAATATTGTT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:579d9c81fbd4
|
40 | — | — | — |
|
GACGGAACTAAAAGCAATTAACGAGCAGGCCTTCCGGTCA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:d0547c8ba386
|
40 | — | — | — |
|
GCTTACGTGTTGCACCGGAAGCACGCGAGAGATCTACAAC
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:e6101429619d
|
40 | — | — | — |
|
AAACGTGACTTCCGTTAGAAAAGTAAGTCTGTACTCGTCT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:38938fb93c38
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAACAACACCCATTACGGCGCAAGAAAGATCGGATG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:c1d45c7b75a1
|
40 | — | — | — |
|
AGGGGACACGTATGTAAAACATCCGGTCCGGATACGCATT
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:0e6e18b44a7c
|
40 | — | — | — |
|
TCTTCTGACACGGTGAAGTAGATCACTTCCGGTCAGGGCG
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:82ef6e86dcb5
|
40 | — | — | — |
|
TTCACTTCCGGCTAATCACGTAAGTGGAGATGATTAAGAA
PANAPTA:Q06546:GABPA_HOXD4:PRJEB66722:R3:2faadac8678c
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final