GATA4_IRX1
CAP-SELEX sample IRX1_GATA4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCAGCAGTCAAAATGTCACTTAGCCGACACCTGTCAACTA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:7890c3858ecf
|
40 | — | — | — |
|
TCGGATCGTGACCACTGATAACAACGTTATCACGGTCATA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:d424c3d0a862
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGACAACCACAACACGACAAATGACAGCTGACGCGTG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:eadd6c427901
|
40 | — | — | — |
|
AACTACGACCGATAAGGTTACTTATCGCTACAACGTGTAG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:8565720843f8
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACCCACCCAACCCACCACGATAACCTCGTTATCGAG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:f99e0e624c87
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCTTGCCTTATCAGCGGGCTGATAAGAGGAAGACAGA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:6befcce1fddc
|
40 | — | — | — |
|
GAACACGTTATCTGCCACGCTGTAGATAACGCGACTAAGG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:022bee1d8ae4
|
40 | — | — | — |
|
TCGCACAAGCTGATAACGCGCTATCGTTATCAATTACCGA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:7bbf9b835e14
|
40 | — | — | — |
|
CATCTTATCTCTGGAGAGATAAGACATGCAGTCATACCAC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:334a3042c4f4
|
40 | — | — | — |
|
TCTAGTGTGTTGCGATAAGATGTCTTATCGCAGATGGATC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:e9bac7fc8cbd
|
40 | — | — | — |
|
GTCGGAAGAGTGTTGCGTTATCGCGCGGAAGAGATAACTA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:5215191c6e41
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGATAACACGGTTATCTCGTATAATCCACTTGGCTTA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:c764b26e68b6
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGATCTTGATAAGATCTTATCAAGATTCTGTTTACGT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:14c7bd9459d6
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGTGATAACGTCAGTTATCTCAAGGTAAAGTATGATC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:e6fb2bc2a935
|
40 | — | — | — |
|
TTCCAAACTGATAACGTCGCGACGGGCGTTATCACAGTTG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:65b53ac6bdd3
|
40 | — | — | — |
|
CGTGTTCCAATATCATGCTGCAGATAACGCGTTATCTGCG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:ea9917409f67
|
40 | — | — | — |
|
GCCGATCTACACTTATCTGCGCAGACAGATAAGAAGGATA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:ca2f7c9fa018
|
40 | — | — | — |
|
GACTTATCGCAATGCATGCGATAAGACGGATATGATACCA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:e9ba5cf58b29
|
40 | — | — | — |
|
TCTTATCTACATGGTAGATAAGGTTGTGACAACCTGAGAC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:2a40a8d1ad60
|
40 | — | — | — |
|
TCAGTTTAAGATAAGTAATCTTATCTTACTTGATAGTGGT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:75b41a20d153
|
40 | — | — | — |
|
GAGCTGATAAGCTAAACCGTTATCAGCACTTAGATAACGT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:b9265da29fcc
|
40 | — | — | — |
|
GCACCGTTACAAGATAAAAACATTTTATCTCTGTCCCTCG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:614652c380ea
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTAATAGGTATGATAAGGATCTTATCACTACTGATGA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:cac9fa409453
|
40 | — | — | — |
|
TGCTGTGAGATAAGCGAGCTTATCTGTGATATGTACCCGC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:38d3ce475348
|
40 | — | — | — |
|
ACTGATTTGTTGCCCAACTTATCTCCGATGAGATAAGGTA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:5f5f5bb98988
|
40 | — | — | — |
|
GCGACTTATCAGTAATACATGATAAGCATAAGTAGGGCTG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:76fab94048c6
|
40 | — | — | — |
|
GGCCTAATCGTACCATACCTTATCAATTACTGATAAGTAC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:2be066c68efe
|
40 | — | — | — |
|
CGCGATAACGCGTAACGTTATCGCAACTAGAACAGATCAA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:faba690e4e02
|
40 | — | — | — |
|
TCGACTTTCGAAGTAACACGATAACGGTGTTATCGCATAA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:4cb037c880de
|
40 | — | — | — |
|
TTCTTTGATAAGATAAGTGCCATATCTTATCGTGCTTGAA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:a51395f8ca3f
|
40 | — | — | — |
|
TCCAACATGATAAGTTAGCTTATCAGGTATGCTCCGTTAT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:2c43a84ab6d7
|
40 | — | — | — |
|
TCACGTCCTTATCTATTTATCGCAGCTAGATAAGGATTTC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:bc1955af884f
|
40 | — | — | — |
|
TCTCTGCCTACACGATAAGCGGGCTTATCGACACTTGACA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:13cab5eb49de
|
40 | — | — | — |
|
GGACAAGCTTATCGCACAGGACCGCCTGGTGCGATAAGGC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:34e639a9952f
|
40 | — | — | — |
|
ATCAAAGATAAGATAATAAGGCCGGCTTATCTTATCGATA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:e5a75eb0e1e9
|
40 | — | — | — |
|
TTCTTGAGACCTTATCAAGATTGCATATTGATAAGCTTGA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:064d9af9ea49
|
40 | — | — | — |
|
CCAGATAACGTGTACGATAGCGTACTATACGTTATCACCG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:5316f591fa7d
|
40 | — | — | — |
|
TCAATTGATGTCAATTAGATAACGATAAATCGTTATCTCC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:fcc0bc3a2250
|
40 | — | — | — |
|
TGAAACGAGATAAGCTATCCTTATCTCGTAGCTTCATGGT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:2108d948c03a
|
40 | — | — | — |
|
TCAAATCGGACATGATAAGCCCCTTATCCTGCAACGTTAG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:f25bf2cc50dd
|
40 | — | — | — |
|
TGGAGCGTGATAACAGATATGTTATCACTATACAACGTAA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:ce273410a43b
|
40 | — | — | — |
|
GATCGGACGATAAGACGTACTTACTCTTATCGTTATGTTA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:ff8d7ea26956
|
40 | — | — | — |
|
CGTTATCACCATGGTCCGCTCACATAGTGATAACGCATCT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:82ae6d87e465
|
40 | — | — | — |
|
TCACGGAAACGACGTTATCTCACCTTCCCGAGATAACTAC
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:0ac7ce66b058
|
40 | — | — | — |
|
TGCTTATCAATACTGTGGTGTTGATAAGACGGTGACATCG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:0d2470cf54ea
|
40 | — | — | — |
|
TGCACGCGTTATCTATTTAACCAAAGGAAGAGATAACCAG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:d34ff629005d
|
40 | — | — | — |
|
TGGGCCTGATAACAATCCTTATCGCTGAGTGATAAGTCCT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:4f26d6f453b5
|
40 | — | — | — |
|
GGTATAAGATAACGTGCTGATACGTTATCTGCGACGAAAA
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:8fd720bc15e8
|
40 | — | — | — |
|
ACTACCTTATCATGTTGTGATAAGGCGAAGCATTGAATTG
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:b2a0f6900fd9
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAGATAATGACGCATTATCTTGGTTGTGTACGGGGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_IRX1:PRJEB66722:R3:99acfdd1fc7d
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final