GATA4_SHOX
CAP-SELEX sample SHOX_GATA4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCAATCGGCAATTACGTCAATTAAGATTGACAACGATAAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:f6355a4022ac
|
40 | — | — | — |
|
CAAATTAACCCGTAATTAGCGATACCATAACGAGCTAATC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:5c33a8e8c6f3
|
40 | — | — | — |
|
TGGACACCACAATCTAATTGCATTATGTGCCAATTACGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:dbd0e8f35602
|
40 | — | — | — |
|
TTATTGCCGTAATTACGCGTAATGATCTCATTAACACAAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:5dff1497d05b
|
40 | — | — | — |
|
AATGATTACGCATTAATTGCCTTATCAGTCACATCCTGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:8046d2fe736d
|
40 | — | — | — |
|
ATAATCAAATTACGCATGATTAGCGTGCGTTGATAAGCTT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:86c8f33bfb20
|
40 | — | — | — |
|
CCAATTAGCGCCAATCAGCCTTATCAATTACCATTATCAC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:96699f53c9fa
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGCATAATTGAATTATCGGCTAACACGTGCTGATAAC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:cc5d37ed3e10
|
40 | — | — | — |
|
ATAATGAACGCGATAATCCCGTAATAGCATTTACCTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:fd627b83559f
|
40 | — | — | — |
|
AGTACCTAATAGCATGTAATTGAGCTAATGATGCGTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:6627b055a81d
|
40 | — | — | — |
|
AATTATCGTACTAATAATGCTAATTACGATAATTACGCGA
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:2b8d65607390
|
40 | — | — | — |
|
ATAAGCCTTAATCTAATTAAGATAATGTCATTAGCGCGCC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:c4cd4896022f
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGATAATCTCGTTTGCACAATAACGTCTAATTAACGA
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:dd25e8076fe9
|
40 | — | — | — |
|
ATAACTTAATTAGCCCCTAATTAGCGTCGTTACCGCCACT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:0c7a97ac7d54
|
40 | — | — | — |
|
CACCTAATTAGCCTCCAATTACGCCTAATTACGCACTAAC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:c3dab3c76df6
|
40 | — | — | — |
|
GATGCCTTATCTTAATTGCCTAATTATCTACGCTCATAAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:dcb0d770a225
|
40 | — | — | — |
|
CTAGTGATATGCTGATTAACGCTAATTAGTCACTGGTGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:57bfb492683c
|
40 | — | — | — |
|
ATAAACGTAATCAACGCAAAGATAACGTAATGAGACAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:d9eceb2fd6a7
|
40 | — | — | — |
|
TAGCATTGCGTGTATCGCCAATTAATTAAATTATCCTGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:32341dfaeba4
|
40 | — | — | — |
|
CACGTTATTCTAACGCGATATCTTAATTGAATTATCGGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:311225031c3a
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCGTAATCATATTAGTGAACGTAATCATTGCCTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:0ba7136510f4
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAACGCCATTAATGCGTAATTTACGCTAATGAGATC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:d46281fcefb5
|
40 | — | — | — |
|
TCAACGATAACTTATGATTAAATTATCGTTATCAGCTGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:fadcd5683b9f
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTTAATTGGTGCTAATTAGGCGATAATTTGGGCGATA
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:405ed8e0827e
|
40 | — | — | — |
|
CGTCATTATCACCGCGCGTTAATTCGATTATGTATGCGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:ed018cb0ae40
|
40 | — | — | — |
|
ATACCCTAATTCAATTAGCGTCATCACCCTTATCGCCCTA
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:9db12e6858c0
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGTAATTATGTTAATGCGTGGTAGATAGTGTTAATC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:08b417c2f8d3
|
40 | — | — | — |
|
TGATAATTCACTATGTTATTAAGGCAATTAAGATAATGGT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:8d98ff971d3e
|
40 | — | — | — |
|
CTATCATAATCAGGCTAATTAGCCACACAGATACGTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:ba94f09c8826
|
40 | — | — | — |
|
GTCATTATGCCCCAATTAGCAGAGATAACGTAACCAAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:4250cfc9ee23
|
40 | — | — | — |
|
CACGTCTAATTGGCGTAAATTGACTGATATTAATTATGGT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:c0190a9279ca
|
40 | — | — | — |
|
CATGTGTACTGTTATCTTTCCCTAATTATGTAATTAAGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:d784aea01763
|
40 | — | — | — |
|
TACGAATTAACGCAAATTGCACTAATTGTCTTATCCAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:57a1cf4ed87f
|
40 | — | — | — |
|
CAATTAGCCTTATCTTCCGTCCTTAATTAATCCGATAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:156e094a6a3d
|
40 | — | — | — |
|
TAATTATATTAACGTTCGTTGTTACGCAATTATCGTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:805c99e02222
|
40 | — | — | — |
|
CAGATAAGCTGATAATAGGCAATTACCACTGATTACCGCT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:174d10bffb65
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGACGAGATAAGCGTAATATCCTAATTAAGTACCGT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:7a228d0d54af
|
40 | — | — | — |
|
TCCTAATTAACGTAATTGAGTTAATGCAATCAATCTCAAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:0adee5782ba8
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTGGTAATTAGCTCAATCACGCGTAATGATGGAGC
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:cb8c8f6a1769
|
40 | — | — | — |
|
ATAATGTGCGTAATTAAGATGTCATAATTAACGGTAGATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:1bb093ba4abc
|
40 | — | — | — |
|
ATCTATCTGCTATCTCGTATCGGAACGCACTAATTAAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:e4b6ebb48a6c
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACTTAATTACCGATTACCTCGCAATTAGTTCTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:f0f16c6af64a
|
40 | — | — | — |
|
CTGACATGTGCGTAATTGATCGTAATTACCCTAACAAGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:5b15e7294f23
|
40 | — | — | — |
|
GACCGATAATCTCATTACGCTAATTGCTAAATGAGTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:0079b352849f
|
40 | — | — | — |
|
TGATAAGCTTATACTAATTGACGTAATCACGTTACCAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:8550d819feb9
|
40 | — | — | — |
|
GCACTAATTAGTAATAATGATATGCGTACTTAATCGCATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:b8cb77fe2e42
|
40 | — | — | — |
|
TTACAATTAACGCAAATTGCCTGATTACACTAAGCTAATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:a61d3c76c06c
|
40 | — | — | — |
|
CTTCATGGCGTAACGCGTTATCTTAATTGCTAGTTACGAT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:3bdea0d75e1c
|
40 | — | — | — |
|
TATCGCTAATCTGATTAACATAATCTGATGAATGCTGATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:5b4f1f8d3add
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAACGATTCGTGCGGTAATAAGGGGCTAATTGGATT
PANAPTA:P43694:GATA4_SHOX:PRJEB66722:R3:8a86cf4bb0df
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final