GCM1_HOXA2
CAP-SELEX sample GCM1_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAACTGATTAGATAACCACTTCCGTAATGATACGGGTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1050fccf86ff
|
40 | — | — | — |
|
CCGCATTCAATAATTGCCTAACGACTTACTAATTGCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a0030c40f433
|
40 | — | — | — |
|
CATAACATAATGACGGTCATTAATTCCTCATTACCGTTAG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:958b2d88ee68
|
40 | — | — | — |
|
TAATTACTAATTAATTACGTTGCCATTACCCGCGCCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:f78dd6a966bf
|
40 | — | — | — |
|
CGATAATGTACTCGTCATTACGCATTAATGACTAGCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:05087b72931e
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCGTCAAGTACGCTCATTAAAGGCTAATTAACCTGCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:10022d6d4d00
|
40 | — | — | — |
|
CATTATCGCGCCCGACCTAATTACTACCAGCATACATTAA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0f06caa2d017
|
40 | — | — | — |
|
GCCCATGCATCATCGTTAATTGCAGTTAATGAGCCCAACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:db17c73b8c37
|
40 | — | — | — |
|
GCACTCGCCACCCCACGCTAATGAGAACGTAATTACTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:53cc212520ad
|
40 | — | — | — |
|
ATGTTACTCGGTGATCATTAACACGGCTTAATGACATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:fe4a25b85a3c
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTGACGTAATTACCGATTAGCATCTCATTAAGGAA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:4ae463d9b4dc
|
40 | — | — | — |
|
AGTGATGATCATAATCACGTATAATTAAGGTAATTAGCAG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:7ab42adb9a1f
|
40 | — | — | — |
|
ACACAGCACATAATTACCCACCCGTATCATTAGTGGCTAA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:68809de9f54d
|
40 | — | — | — |
|
GCTCACGTCTAGACAACCTAATGAGAAGATAATTACCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:bcd5f15e880d
|
40 | — | — | — |
|
TCCTTCCATTATATGCTCATTAACTAGGCCTGCTGGCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:061758035f1c
|
40 | — | — | — |
|
ACTAATTGATTCTTAATTGCTGCCCGTATGTTACCCCTGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0dc42c3defb2
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTATCGTACACCGTGAGCCTAATAGTATGCGGGCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:350f96dc55ba
|
40 | — | — | — |
|
ACCCACCACTACACGTCATTAACTGCTAATTACCACTGCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:51859d9b5a41
|
40 | — | — | — |
|
CATAATTAATTCACCATTAGCGCGACACAATCTGCGTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:c82f3b2c1a0e
|
40 | — | — | — |
|
CGTGGACTTAGGCCTAATTGCTGTCATTACCAGCAATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1d0c328ee636
|
40 | — | — | — |
|
CATGAGAAGACGAGTTAATTACATTCACCTTAATGATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:c673f837c0d4
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATCACCAAACCCTAATGGCGGTCATTAACGACTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a543b58031ba
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTTCAGCATCACGGTAATTAACGGTTAATGAGTTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:75f3a21e4b44
|
40 | — | — | — |
|
GTAATTAGCATTCTAATTACGGCCTACTATAATTAAACGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:62666a89b9bb
|
40 | — | — | — |
|
GAGCGTTGTCTTACCTAATGACTATCGTGCTAATGATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:dc704add8579
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCCGCATAATTAACGCGTAATTACGTCTGGAACACTT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:e60888abb0a8
|
40 | — | — | — |
|
GCTGATGCTAATGAGTTGAACTGTTAATTAGCTTGCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:e8e85699fa59
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATTGGTTTTTAATGACGTTCCGCGTATTACGAGTTG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:86b15f6cb4dc
|
40 | — | — | — |
|
CATCATCAATTCACACTTAAAACGCGCGCTAATTGCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:e4f5f2652fcb
|
40 | — | — | — |
|
TTCACAATCCGGGTCGTAATTACACCACAATTACGCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:f11b8332cba7
|
40 | — | — | — |
|
GTAATTAGCAGCTTTAAGACAGTACCCGCATCATTAGCGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:245451825baa
|
40 | — | — | — |
|
TGAAAAGTACAACGTAATTAACATCCTAATGACAACCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:562979f2a30e
|
40 | — | — | — |
|
CGAACAATACAATAACACGTAATTACAACCTCATTACGCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0f20d414d504
|
40 | — | — | — |
|
AGTACGCACTAATTAGGTGATTAATGACACACTAACTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:069b067ef04d
|
40 | — | — | — |
|
AATGGAGTGCCTGCCCGTTAATTATGACGCTAATGATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:04cf72ee1f2f
|
40 | — | — | — |
|
ATGATTATTATCCAATTAGCACTAAATGCGCAGCACTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:874b316ebabf
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTACCCGCATGAATTATCGCCTTAATTATCATATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:5169c9affe26
|
40 | — | — | — |
|
AGCATGGCCATATCAATTAATCCGCAATTAACACCCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:bfb719979d0e
|
40 | — | — | — |
|
CAAACGGTCCAGCATAATTAGGATGTGATAATTACCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:52ecb23a9c2b
|
40 | — | — | — |
|
GCAGACCCAGACACGTCATTAATCAATGCTAATGACTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:74d2284bbbb3
|
40 | — | — | — |
|
CATCACTTTACAGGCTAATTAGGGATCATTACGCCACACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:142df524c713
|
40 | — | — | — |
|
GCGAGAGAGGTCGTTAATGAGCGCTAATGAGCATGATGCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:4e6ed2895f4d
|
40 | — | — | — |
|
CTTATCCGTTAAAAGGTGATTATCAGCTAATTACACTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a5bf246d5792
|
40 | — | — | — |
|
CAATTAATTACCCACTAATTAGGCTTGATGACCTACCTGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:913018d52a7e
|
40 | — | — | — |
|
CAATTACGCCCCTTGCACGGTACTAACCACCCGCATGACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:e6fce3d8f394
|
40 | — | — | — |
|
ACATACCGCCTAGTCATTAACGGCTTATCATTAGTCTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:e6132dccfc0a
|
40 | — | — | — |
|
GCTAACGATGTAGTAATTAGTCCGCTAATGGGACGTGACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ca36951c6175
|
40 | — | — | — |
|
CTACTCGAGCCGTCTACGCCTAATGAGATTATAATGGACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b05a41395fc2
|
40 | — | — | — |
|
CCACGGCACATACCGTAATTAAAATCTAATTAGCTCACTA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0daf2fffc5ba
|
40 | — | — | — |
|
GCAATGGACTCGTGTCATCATCTTAATCGCTGCGGGTACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_HOXA2:PRJEB66722:R3:f58c45b67dc6
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final