GCM1_PITX1
CAP-SELEX sample PITX1_GCM1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTAATGCCCGTGAGGCCCGGCCGCGACCCTCAGGTCGGTC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:65cf39dfdaee
|
40 | — | — | — |
|
ATGAAAAATGATGACTCTTGTCGGGCCCCACCGGTCCTTT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:fcc00c6408b8
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCGTCTCTCACGGCACACATGTCAGACTCGATTGTA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:55958bb5cd28
|
40 | — | — | — |
|
TTGATAATCCGGCGTACACCAGACTTGTCCGTTGCCGCGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:d8aeca0693b4
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGACGTGATGTCTCGCGAATTTTACCAGTAATCTTTC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:83a03c121929
|
40 | — | — | — |
|
TTGCATAAGCTAAGGCATTTAGAGAATGCATCGGTAACGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:75cc76e9a780
|
40 | — | — | — |
|
GGGCCTTTGCCCCCGGATCCCCTTGCATTTCTGACATTCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:4c29f27f9203
|
40 | — | — | — |
|
CAACTCGATACAAGCATAACTTGGGCTGATGACATCTTAA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:f1a7888c8c88
|
40 | — | — | — |
|
CGGAGTGCCTCAGGGCACCCGGCGCCCACAAGGCCCACAC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:fd2aa7bd6e01
|
40 | — | — | — |
|
GGGGGCACCTGACATTCCTGACATTCACACCTTCTCATGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:44f84e347df9
|
40 | — | — | — |
|
AAGAGGAGCACATACCAGTTGCGTCACCCTCTTCCCACAT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:a56d9d6ed672
|
40 | — | — | — |
|
ATATGGGCGCTGAGGGCCAAACGGACCCACAGTGCCCACG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:d1162116382c
|
40 | — | — | — |
|
CACATCCCGCGGGTTGCCCTTATCACCCGCAGGTTACCGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:3650039c4429
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGGTACGCCATTGCCTGTCACCAATCACGCCCCCTAC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:baaa4dee4759
|
40 | — | — | — |
|
CACTGCTGGTACTGCTGACAAGTCGGTGCTACCCATCAGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:e5f23fd30b12
|
40 | — | — | — |
|
CACTCGCGCTCATAACCCATATCCAGCAGTGCCAGCACGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:322eef2cb4ec
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTGCGCGTGGGTGCGGGCGCCTCCCGCCCCGCATACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:e3cbbc12ec0e
|
40 | — | — | — |
|
GCCGACGTACGTGGCCAGGCTTGCCCTTACGTCCGCTGCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:c2e80b972fc6
|
40 | — | — | — |
|
AGTGTGCTGGTGAAGAACCAGCACATCCCTTATTGTGTTT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:e411dd44cebb
|
40 | — | — | — |
|
ACCAGGGCTGCCCGGTCATCATCCATTTAGCTGCATGTGG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:195aeef14892
|
40 | — | — | — |
|
CAACCCGCACTGCTTGGTCGTGTAGAGTGCGGGCCTGATG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:672e2062cdf3
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCGCATCTACCATTTGTATCATGGCTATGCTATGATG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:74e35b84b751
|
40 | — | — | — |
|
TGGCCTAGCGTGGGTGTGGGCACCTGCATCCACGCCGACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:aee6936923e6
|
40 | — | — | — |
|
GTAGTCGCGTACGAATCGGAGCTCTCCGACAGAATCCGGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:947d4ff74c9a
|
40 | — | — | — |
|
CATGTTGTGATGCGGGTACCCTTCCCCGCATGCAACTCAT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:8d1508203dac
|
40 | — | — | — |
|
ATACGGTCAAGTCATATTAAATTCCTAGCATTAGCGGGTC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:5effeb4b84cd
|
40 | — | — | — |
|
CACCCATCGCTAATCCAGGACTCTACAGGATTAGCACCGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:6fd5e6fb77f3
|
40 | — | — | — |
|
TAATGATGCCACTAGTACCGCCTCACCCTCACGCCCACAC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:60e0d3e3c2d7
|
40 | — | — | — |
|
ATCCCATCTCGAGACGCCCACCACTATGTCCCTTAGCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:feba01d067cb
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTACCACCCACCACGACGCATTGCCCTGATGTAAAAG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:191c40547eeb
|
40 | — | — | — |
|
AATTAATCGTTAATTAGAATAGACTAATCGCCGATTAACG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:30d48d3f5a8b
|
40 | — | — | — |
|
TAAAGTGTGAATCTCAATTACGCGCGGCCACATTCCTCAA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:3987e8591173
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGCCCGTGAGGCCCGGCCGCGACCCTCAGGGCGGTC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:37706351cda2
|
40 | — | — | — |
|
TGCTGCACTGCCCACATCCCCAAAGGATGCGGGTGGCACT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:0f120263d0bf
|
40 | — | — | — |
|
GCCGACGCGCTATGCCTGCCACCCGCACCCAGCACGCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:865c676982b6
|
40 | — | — | — |
|
TATACGCCCCGATGATCTCGTGAAATAATGCGGGATCACG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:b080096695a5
|
40 | — | — | — |
|
CTCACGTTTGGCCGCGTGTATCCGAAACGTTAGACTACTG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:f65b24288de3
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTGACCTCCCATATGTACCGCACCTATCCTCCTACTG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:86fcb0f19853
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCCACCCTGTATAATCGCATGATACGGGCTCATGCCG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:b86d8b177505
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCAACACGGTGCACTCCCACCGCGTTAGGCCCGCACC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:1cc1ba8e5a73
|
40 | — | — | — |
|
ACCCAAAACCTGCTGCTCCCGTATCGCCAGCATAACCCGC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:44c7a1ebb1e8
|
40 | — | — | — |
|
CACACACAGATGAATTATCCCCGCATGCCCTCCTACCAGT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:0e073ea8a188
|
40 | — | — | — |
|
ACCTCAGCCCTCACTCCACCGTCATACCCGCACTGCATTA
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:f0cdc362ae40
|
40 | — | — | — |
|
CTAGCGCGGACCCGGGTCGTACTTGCCCGTGGCCACCATC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:8efb1f1ea8a9
|
40 | — | — | — |
|
TTACCATTACCACTCCTTCCTTGACCCGCTTCACCGACCC
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:3c87bdd5e946
|
40 | — | — | — |
|
TTACCTGCATATGCCGTCAGGTTGATGCTAGAACGCGCTG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:3a99854a1c73
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGCCGCTTTCACCCCCACTTGCCCACATCCCCCACCT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:b89afeffe1aa
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCGCATACGGATCACCGCTATGGGTCCCTCATAGCCG
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:ab6706ff9077
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCGTCTATGGAGCACCACGTTACTGCTTCTCCTGGCT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:fc638b86911d
|
40 | — | — | — |
|
GTTAACGGCGTAACGGTAGCGGAGCCACGAGAACCAACAT
PANAPTA:Q9NP62:GCM1_PITX1:PRJEB66722:R3:af508868c24e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final