GSC_HOXA7
CAP-SELEX sample HOXA7_GSC · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TAATCACACTAATCTAGATTTATTAGCGTAATTAGCGGCA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:bbbeb69d1a83
|
40 | — | — | — |
|
ACGGATTAGCTACGCGCTAATCCGTACCCTTACATCAGCG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:bdf31d337621
|
40 | — | — | — |
|
GTACAATTAGACAATAGCTAATGCGTAGAGGTACACGGGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:5e937b4b9372
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCAACAAATCGAGGACAATTTGGGCATCACGGGCCAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:dbe91ccd1c5e
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGTACCCGATTAGACTGACCTAATCGGATTCGGGGAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:56ec4dedbba0
|
40 | — | — | — |
|
AGATTAGACGATGCTAATCTACTCTACCAACACCGCTCCA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:d13364a6a164
|
40 | — | — | — |
|
GATGGTATTAGTACCACTAATCCCACGCTGTCAAATCGGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:29e30fdf35e7
|
40 | — | — | — |
|
GGATTATCCCTCATGACACGCTGTGTGATAATCCGCGATG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:1476f9be9818
|
40 | — | — | — |
|
GTGAATTAGAGGATTAGGTGGCTACTAATCTCAGTAATCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:70258b2e7d80
|
40 | — | — | — |
|
GTATCGCGCAGATTAAGCTAAACTGATGCGTTAATCCGCA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:b9a406dabeaf
|
40 | — | — | — |
|
GTGAAACCTCGAGGTGTATTACCGGGCGTAATCCACACAG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:999679514299
|
40 | — | — | — |
|
GGCGTGGATTATGGAATTACAGTGTAATCCCATAACGCTA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:665e02b65451
|
40 | — | — | — |
|
AGAAATGTGGACTAATCGCCTTGGATTAGCCGTGTTGCCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:247453c04dc5
|
40 | — | — | — |
|
GGCGTATTATGCAGATTAGAGTTATAGCTAATACTGCACG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:c116ee6b3c8f
|
40 | — | — | — |
|
GGACGGGATTAGCATTATGCTAATCCACGCTGCATAGGCG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:51a4d98d8715
|
40 | — | — | — |
|
TCACCGCCTAATCCGATTATTGCACATAATCCCACGGCAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:693affcfe2e8
|
40 | — | — | — |
|
AGGGATTAGGGGATAATCGAGTGTCAAAGCAATTATCGTC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:1c0fbf967295
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGATTATACGCATAATCCATCCTAGTGATAATCCAAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:2cc855414b43
|
40 | — | — | — |
|
GGATTACGAAGTGTATGGATTATGCCCAGCATAATCCCTT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:e8c8a9eb5519
|
40 | — | — | — |
|
CGTCAGTAATCCATTCTAATACACATGCGATTACCAAGCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:2c66ec341347
|
40 | — | — | — |
|
CAATTTGGTGGTGATAATGCACACAAATCGCGTTTAGGGG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:ecc2414c1178
|
40 | — | — | — |
|
GGATTAACTCATTAATTGGTGCCGATTCGCGTTCGCCACA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:cd95e8f6b2ee
|
40 | — | — | — |
|
TCGGCGCGAATTAGGCCCCCCTAATCCGTTACGGCTGAAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:9bf9f2b17c29
|
40 | — | — | — |
|
AGGGATTATTCATTCTAATGGCATAATCCGGATCGTGGTA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:ada0d91261a0
|
40 | — | — | — |
|
TAATCCGATCAACAGATTAGTGCAGCGCATAGTTAGGTGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:bd3fee0afb67
|
40 | — | — | — |
|
CATATCACGGAATTACTGTTCTGTTAATTCGCTAATCGAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:67b75f324311
|
40 | — | — | — |
|
TGATCGCAGCGTACAAATCCATACAGGAATTTGCCGGCGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:855dd18c0faf
|
40 | — | — | — |
|
AGTCAGTGATGAGGTTGCAAAATCGCAATGCAATTTGAAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:c472c60483aa
|
40 | — | — | — |
|
TATGCGGGAAACAACAGGATTAGCGGCGTCTAATCCTCTT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:221473fb59d7
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCAGCAATAAGGTATTAGAAGTGCTAATCCTGTAGGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:62581c7d26c9
|
40 | — | — | — |
|
AGCTAACGACCAATTATTGAACGATAAATCGAGTTAGCCA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:0bbf680b4311
|
40 | — | — | — |
|
TTGACGGAGGACTCCTACTAATCACCAGGGATTAGTGGAA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:33dd2ed4bbf5
|
40 | — | — | — |
|
AGGATTAGTGCTAACACCGCCTAATTCGTTTAGTACCACC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:f828863b4080
|
40 | — | — | — |
|
CGCCCGAACGGATTAGACTAATCACTAATCCGTGGATGCT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:d1fe10dca521
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCTTCTACAGGTTCGGATTAGTCGCTACTAATCCGGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:9eecf86c7b97
|
40 | — | — | — |
|
CAATCGCCACGATTACCACCTAAATCCAATGGTAATTCGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:c6ba35f9b9d2
|
40 | — | — | — |
|
TAAAGCAGACGCAATTACGCGCGTGCAGGTGTAATCGCTC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:292442fcf83d
|
40 | — | — | — |
|
CAAGGTCACGGGATTAGCAGTTCCCATTGCTAATCCATCT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:1e8a5955cc97
|
40 | — | — | — |
|
GGTTAAGAAGCATGATCCGTCTGACGGTATCATCTTCAAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:2b2a3b8e3122
|
40 | — | — | — |
|
GTAACACATGGGATAATCCAAACCGAATTATCCCTGAAGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:c1e99ed21480
|
40 | — | — | — |
|
TCGGATTATCGCTCATAATCTGCTTGAAATACGCGCGTAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:7878492a1dfc
|
40 | — | — | — |
|
TGACGGATTAACGCTGCTAATCCGCTCTCCGACACATCGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:663968601671
|
40 | — | — | — |
|
ACTACGAAGCCCGATAATCCACGGGGATTATCGATAGGTC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:aa68af8b2cd1
|
40 | — | — | — |
|
CGGATTAGCATGCAAACCGCTAATCCCATAGTAACCACTT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:47ebf2274236
|
40 | — | — | — |
|
AGTAGGGGATTAGTATTCACTAATCCGGATGCGAACACCG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:323503ad1367
|
40 | — | — | — |
|
TCGGTAAGGTGAAGGATTAGCGTTCATTCTAATCCTTCAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:07e54d892a58
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTGCAAGCGCAAGTTAATGCCGACGAATTAATCGCGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:d62b3206c5f9
|
40 | — | — | — |
|
CGGGAGTTAACGAATTACCTGTAATACCGTTAATCCGCAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:9c926551a833
|
40 | — | — | — |
|
TACCTCTAATCCAGGAGGATTAGAGTATGCCATGCGACAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:320f012961f6
|
40 | — | — | — |
|
GTAATCGGATTATATAGGCATAATAATCCCGCATTACGTG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXA7:PRJEB66722:R3:38ae4691481b
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final