GSC_HOXB4
CAP-SELEX sample HOXB4_GSC · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACCCGGCAAGAATGTGGACGCGATGAACCAGATCTTTAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:6290153073d6
|
40 | — | — | — |
|
CGCAATGCAGCTCTCCACTTGCTGCCGGGGAACTGTAACC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:066400063448
|
40 | — | — | — |
|
CAGCAACACACGATTAGCTAGCCACCTAATCGGGATCCAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:e7b7b5d2ad82
|
40 | — | — | — |
|
TGAAACGTCCAAGCAGACCCTACGATTGGCAATGCTACCA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:45e99826b99b
|
40 | — | — | — |
|
GACTAAGACATAACTCACATTATCTGGTTCAAGATAATAG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:f34b842155fb
|
40 | — | — | — |
|
GGAACAAATAAGAATAGAACGCATCGAACTAATAACGCTG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:7e166399385b
|
40 | — | — | — |
|
GATCTGCCACACGAAGTAATCACCGCCCCGTAATTACCGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:5f4bec738af9
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTAAACTCAAGTAACTGATTTAGCGAGCTCAACAGAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:f301519a426f
|
40 | — | — | — |
|
TTCAGTGCGCTTAACGATTAATCCCCACGTGAATGCATCT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:b8a2f23a357d
|
40 | — | — | — |
|
CCACACCGACCTAGGATTACTTTAAGGTAATCCCCCCACA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:ff19abdb8d0d
|
40 | — | — | — |
|
TGAATTAAGGTTACAAACTTAATCCACGATACATGAACGA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:8932ab088024
|
40 | — | — | — |
|
TTCATCCCCAATTATATGATAATCGAGGACCTCTTGACAG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:a8152c55b6c6
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGCAAAACAGATTAACACAATCAGCTTAATCTGATGG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:009acbe5d084
|
40 | — | — | — |
|
GGAGGATTAAAGGTAATAATCCAACGGGTGATCGATATGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:e3f92065db5a
|
40 | — | — | — |
|
CCATACCGCATAGGATTAGCTTTATTCGCTAATCCACGAT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:8a48bf07a4e5
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTTACCCCGATTATTCGCCAAATCGGATAATCCCTCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:100748b90de0
|
40 | — | — | — |
|
CATGAACAGCGGATAATCGCAAAAGGAGATTATCCATCCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:a48275546cf8
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCAAGAAGCGCAACCGCTATGCCCACGCTGATGGCAG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:fc7f26583bbc
|
40 | — | — | — |
|
CTGACTGATCCGTCGAGCAGACCGCGCCGAAATCAGTGAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:cf6ccc026dec
|
40 | — | — | — |
|
ATATCCTAACTTAATCTGTCTTAAGATCCATGATTAAGGA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:be7ffd2058bd
|
40 | — | — | — |
|
GTGGATTATGATTCCCTGTCCCCATAATCCGAACGTACGG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:8f7ca30f3b15
|
40 | — | — | — |
|
AAACAATTATACAAACAAATCGTGGACACAAGTTAATGAG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:0c514a265375
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCATTCGGCTAATACCTCAGATCACTCTAATCCTTCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:2490afc3821c
|
40 | — | — | — |
|
CGATAGTCACGGAATTAGCGTAATCCCTAAGAGTTACTGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:b6d87588c21e
|
40 | — | — | — |
|
CAGGGGCTAATCATAAGTCAAATGGACTGAAAATTAACAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:187adcb77372
|
40 | — | — | — |
|
TTAGTACTTAATTCATAGTCATATGCAAATTCGAGGGGTG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:e976bb7e70a1
|
40 | — | — | — |
|
ACGATTAGTGGGACTAATCGATAATGATAGTGCATGAGTT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:1de65feb7e15
|
40 | — | — | — |
|
GGGATTACCGTGAACCGGTAAATCCAAGCGTTATAGTTTG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:9409ab658d70
|
40 | — | — | — |
|
TTCCACAGTGGAAATCGAATTACACACACATAATCCGACT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:678d3b52da4b
|
40 | — | — | — |
|
ACTGTTAATCCCGTGGAAACACGGATTATCTCGTATCCTC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:ebe4906643d6
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCGTGGGACGGATTAATCCCTCCGATGAGTTAATCCG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:a73ae7cb4040
|
40 | — | — | — |
|
AATGGTAGAAGGCTCAATCCGTGACCTGCACGAATTAGGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:563ca141c152
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAATTATCAGTGGATATAATCGTATAAGGTGATTAGA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:f00c5db76a77
|
40 | — | — | — |
|
GGCAAATGCGTGGTTAATCTGTGGAAGATTAAATTCACGC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:21ff8a0c473e
|
40 | — | — | — |
|
TAATCAATTACAAAAGTAATCGGACCTCTGAGGGTAAGGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:6fc83d9c4417
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCCCTTGTAATCCGTTAATGCACAATTAGTAATTAAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:1998f7d37f39
|
40 | — | — | — |
|
CAACACACCATGGATGATCCATCCCGATATCATCCGCATT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:9388af9b5162
|
40 | — | — | — |
|
TGGGGATTAGTAGGATTGCTCTCGTCAAGTCCTAATCTAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:78753ab50ae8
|
40 | — | — | — |
|
AGACCAGACCGAAGCAATTAGAGGAGGTCTAATCGATACG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:fa8eb6ff7ad7
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAAAAGGATTAGCGACAATCGCCTAATCCCAACCGCT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:b5b682d16dda
|
40 | — | — | — |
|
TTTGAGTGATTCTTAAATGAGCCAGCGTTTAAGTGTAAAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:3e0d4921d65b
|
40 | — | — | — |
|
GGATTACCCATGTCTTTTCAGGTAATCCCTGGATAAACGG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:a99b307c281e
|
40 | — | — | — |
|
GTAATTACAGTGTAATCACAACTATCTATGCGTGGCTCAA
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:11f8a2553c2d
|
40 | — | — | — |
|
GCAAATGCTAATACTTATTTCGAAAACAAGATTAAATTTG
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:8fb24875fab8
|
40 | — | — | — |
|
ATCCGCACGTAACACCGGGGATTACCCAGCACTCAATTAC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:7eec1f0f2399
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATCGAGAGGGCTGATGAAGTGAAATCTCGATTAGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:20204cbf3781
|
40 | — | — | — |
|
AAGGGTACCGCCTTAGAGGAGTACTAAGAGGCGGAGATGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:2fae3b219bf7
|
40 | — | — | — |
|
GCTATTCCGAACTAATTAGGGAGGAAGCTAATTAGTGAGT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:29a411060bdf
|
40 | — | — | — |
|
GATCAGGACGTAATGCGCTGTAGGAGTACATGGCATCCCC
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:e2b0382c4f7a
|
40 | — | — | — |
|
ACCAAAACCGATCATGTCGATTCCATATACGTATCAAACT
PANAPTA:P56915:GSC_HOXB4:PRJEB66722:R3:e3320e5a8b98
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final