GSC_LHX1
CAP-SELEX sample LHX1_GSC · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GACAAAGCGGATCATACGACTCATAAATTTATGACGTTAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:f24e5460ff91
|
40 | — | — | — |
|
AACTGATATGTTAATCCGCGACCGTGGCGACGTGCGCTAG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:f9afcfb49620
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCTTAATATTGCGTAAAACCACTAGAATTACTGGGGT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:04d7076db674
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGATCAATAAGTTGGCGCGCCCCTAAACGCCAAATTA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:d15a05114353
|
40 | — | — | — |
|
GATTAAGGAGTACGGTAATCTTAAATTACTTCTATAGCAA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:0ecd17757136
|
40 | — | — | — |
|
ATCCCACTTATCGAGATCCTTGTTAAGGGAGGCAAATTTG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:eec5a45d3282
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTCTTAAGCTGAGTTCTTGTGAACTTTGATCCTGATT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:b5edc2bcb996
|
40 | — | — | — |
|
GGTTAAGACTTTTCATCGGAGTAATTCGCATGCGTCAGTG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:0c8135f79ee0
|
40 | — | — | — |
|
GTTAGGTCAACAGATCAATGCGAGGGCGCCAACGCGAGCC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:331a243442af
|
40 | — | — | — |
|
CACGTTTAAGCGCCCCACTAAACCATAATTCAGCCACACG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:c76e06f1d5f5
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTAAGAGGCCCTGTGGTTTGTAGTCTATGTTATACTG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:d8fe6cea35f8
|
40 | — | — | — |
|
TATACCACCTTCATTCTTAAGCACTGTCTGCCCATGTTGA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:60961493e027
|
40 | — | — | — |
|
TCTATGGGGTAATAGCTGTTTACGTCGGTTTAGGCAATAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:b546cd25e6af
|
40 | — | — | — |
|
TTTATTGAACAATCTCCCCATCCCTTAATTCTGTCGACGA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:0d85e6a46c15
|
40 | — | — | — |
|
CGAACGCCCACTAGTGTAGGATTCGCGAAACGAGAGAAAG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:591a8b6124c6
|
40 | — | — | — |
|
ACTAGATAGAATGTATGCATTATGAAAAATGACTTGTGCC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:bb2996972976
|
40 | — | — | — |
|
AAGCTCCACTTTGCCGACCAGACAAATATCGTGACCTTAA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:48036386cfd3
|
40 | — | — | — |
|
ATTAACGTAGATTGTGTATATAACGCGGGGACGCGTAAAC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:9c8d3101f9b9
|
40 | — | — | — |
|
CAGAACCTACCCTATCGAAGTCATCGATTTTCGGCTTTAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:8224d04997c5
|
40 | — | — | — |
|
GGCTTGGCCTGAAACCTAATACGCAAGTTAGCTCTGTATT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:701cf8c748cd
|
40 | — | — | — |
|
CGAAATTAAAGAGCCTTCATTAATGCACTCCGACCCACCT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:e6576b0c53da
|
40 | — | — | — |
|
CTACGCGACAGGGCTCAGAGCCCTTGATTAACCACCAAAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:568e9777ba0f
|
40 | — | — | — |
|
TCTGACTTGACATTCAAGGTGCTTAACTAGAGACTTAATA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:67b5ab6cc514
|
40 | — | — | — |
|
AGTTCACGTTTAAAAGCCGACCGATAACTTATACTGCATA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:f372a37b7ac9
|
40 | — | — | — |
|
CGATGCAGAGGCCGCACACTAAGCATTCCAAGACGTATCC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:d642174b5e6d
|
40 | — | — | — |
|
GTGATCCCTTATGTATGTAGCGAGGGTGTGCGCTCTGACG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:537813a74b01
|
40 | — | — | — |
|
TGTACTTTTCTTCCAGGCTTAATCATGCTTGCTGTTCCCC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:3b7637236c4f
|
40 | — | — | — |
|
GACGTAGAGGACTGCAGCCACCCATTTAGGACAAAAACTC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:1b387e64638d
|
40 | — | — | — |
|
TCAAAGTTCACCGCATGTCGAACTCTACCCCTAAAATTGG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:00b874e35835
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGCGAGACAACGTTTTGACACATACCGTGTGCGCAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:458c0e3ba146
|
40 | — | — | — |
|
AGCTAAGGCTAGCTTGCCGTTGGGCTAGGATCCACACACG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:d1e8d8674a11
|
40 | — | — | — |
|
CTGCACCACTTAGCGCAACGAACAACTTATCCGCCATACG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:27fd761cc119
|
40 | — | — | — |
|
GGTCAAGAGCTGACGGCAATAGAGTTACTGCTGTGTCGAA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:27179a0d8fa0
|
40 | — | — | — |
|
GAGTGTTAAAACTGTCTTTTAAATCGGAGTTAGAACCTCC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:6a86c87bd519
|
40 | — | — | — |
|
TGGGGTCCGTGGCCGATCACTTCTGAGATGTGTTCGTCGC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:53acd07208bd
|
40 | — | — | — |
|
TCTACCACAGGAGGCTTGGAATCACTGAAAAGAAGACACG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:5eaed5871087
|
40 | — | — | — |
|
GGGCGCGGAGAAAAGTATCGCTAACCCGGCCGCCCAATGC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:d0bfdf55c219
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGGTACGGCGCCGAGGAGATATAAGCGTAAGACAATA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:4d901bfb54d2
|
40 | — | — | — |
|
TGTAGGAATTGAGAAGTTTAATCTGCATTCCCCAGCTCGC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:5b6c381dbe4e
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCACACACAAGCGTCGGCGGACGGAAACCAATTCTAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:c2e87568e70e
|
40 | — | — | — |
|
CAGACTCCATCGCCATCATTGATGCTAGTCAAAAAAGACC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:ab0a3819325c
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGAGAGAAGTTTTCCTGAGAATTTGCAATACAAACC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:106bca003dfd
|
40 | — | — | — |
|
AACTGATATGTTAATCCGCGACCGTGGCGACGTGCGGTAG
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:ee3c24f89fc2
|
40 | — | — | — |
|
GACAAAGCGGATCATACGACTCATAAATTTATGACGGTAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:1eca50297ba7
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGTCTTCCGGAGGGGCCGGGCGCTTATTTTTAACCGA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:c7bd9104249c
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCGGTTTCCACCTGACTAACGCGGCGCAAAATACATA
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:a2f53fb31df7
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTCACAAAGAGCGCGTAGTTATGTGTCTTAAAACCAC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:ee59c3df98b5
|
40 | — | — | — |
|
GACACCACCGCCTCTTTCGGTCACGACAACCGCCCAAACC
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:0148b6730530
|
40 | — | — | — |
|
TCCATAAGAGTAAGATCTTACCTGAAACTATCACCCCAAT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:2e684727b6ce
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTGGAATGAAAGGAAAATAATGATGGCAGAGCCCTGT
PANAPTA:P56915:GSC_LHX1:PRJEB66722:R3:a3151a06c2d2
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final