GSC_MSX1
CAP-SELEX sample MSX1_GSC · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGAAACCACCTGTTATTTACCAAAGGTGACAGGCGCTCTA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:64442934abc4
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTAGCGCGGGATTACGTAGGTAATCCGCAAGGACGAC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:12535d622b31
|
40 | — | — | — |
|
TGCTAATCTGAACACTAAGCAGATTAGCTGCAATCAGGAT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:bc2e12493aed
|
40 | — | — | — |
|
AGGGGATTAGCTGCTCGACTAATCCTACCTCGTCATGCTG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:2fe81347ff3e
|
40 | — | — | — |
|
GGACAATGAGATTATATTCAACTAATCCTATGCTTGATGC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:201d8da2a387
|
40 | — | — | — |
|
GCAGATTAACGCTGTTTAATCTCCCACCCCCGCCGCCTAC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:ab571fc7f0fd
|
40 | — | — | — |
|
TTAATCGCGTTGGCGATTAAAGCATTGTCGCGTGTTTTCC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:0a01957ce23f
|
40 | — | — | — |
|
ACTGATTAGGACATAAAGGTCACTAATCCGGTGATTAGGG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:853254ca2e3f
|
40 | — | — | — |
|
TCCGATTATCATTGGAGCCAATAATAATCGTAACCGACAC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:f8de8c195894
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTGGAAATTATTGATAATGGAGTATGATAATCTCTCC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:9a25d45344af
|
40 | — | — | — |
|
GCAAATCCGCTAATCGGATTTGACGGAACGTAAGACTGTG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:f3b6496a4565
|
40 | — | — | — |
|
CCGATTAGTGACCGCAGAACTAATTACAAGATACGGTCAA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:347816e92fb0
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCAAGCCGAATTACCGTAACCGTGTAATCGCGCGCAG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:92887e8c72c6
|
40 | — | — | — |
|
GCTGTTCACGTTCGATAATCCAGCTCGTGATTATCGGCGA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:54d35374d51a
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTCCAAAATCGAATTAGTTGTGTGAATCGGAAACGC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:d84b6f86aedc
|
40 | — | — | — |
|
CATAGCATCCTAATCCTACAGAAGGATTAGGCACATCCTG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:1f1be57f92e1
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGCCTAATCCAACCAGCGGATTAGCACCACAACCCGG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:8d576a690cde
|
40 | — | — | — |
|
TTAAATGGATTAAAAACGATAATCCGTGTACTGAGCGTTC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:267acf80ed6f
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGAATCGCGATTAACTGTGTGTACAGCTTAATCGCAT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:524a2b2f110a
|
40 | — | — | — |
|
GATGTCTGATCCTATAACGAATCAGACGAGAGGGTTGAGA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:6694c1173a20
|
40 | — | — | — |
|
TGATATGGCTTCTAACTCCTGATGGATTAGACTAATCCGG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:5bbb4a9ebf78
|
40 | — | — | — |
|
GATTAAGCCATATGGTTAATCTGCCCCACATCATAACCCG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:764ac2a203a2
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTTAAGCACGTAATACGATTTGCGTATTATTCGCGT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:9199a6ff4d95
|
40 | — | — | — |
|
TGATGCGATTACGCTCTATGCGTACAGTAATCGCTTCCGC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:30ee021b2059
|
40 | — | — | — |
|
CCACTTCCACTTTAATGCGATGCGTCATCGCATTAAGCCT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:b4168f1517a6
|
40 | — | — | — |
|
CATATATAATCGGATTATACAATGGGAATGTTAATCCACG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:35beac7efe9f
|
40 | — | — | — |
|
CGACCTAATCGTGCAATTGCACGCATTAGCGGAGTTACAG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:a08a4e235bba
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTTGTGATAATTCATACCAGGTCGATGGATTATTAGC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:efb09025418c
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCAAAATAAACCGAACTTAATTTGCACCCATTAACTC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:e6d923f723f2
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCCTCTGACGCTAATCCAGGCTGGGCGGATTAGACGT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:71ddfe602a97
|
40 | — | — | — |
|
TTGCGATAGCCTAATCCATTCCGAATTAGCCTATACGCGA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:41ad27bb17a3
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGTGGATAAGGGGATAATCGCTATCGATTATCTTGTC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:4ccc40576288
|
40 | — | — | — |
|
GCAGGATTATGAACGGAATTAGCGAACCTAATTGCCGTTG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:ffe7c6fd26f2
|
40 | — | — | — |
|
CGACTAATCCTGTATTGCAATGAACACACAGATTAGTCAT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:f25ce2d144f1
|
40 | — | — | — |
|
ATACGGAATTACGTTATTATAGAGGCGTAATCCGATCGTG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:2534d5e86ef5
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATCCGATAAATAGGCCATTAATCGGATTAGTAAACG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:372b63ec6540
|
40 | — | — | — |
|
CGAATTAGGCGGTATCACGCTAATCCGTTTGGAATCGATG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:88c02c0e6ee7
|
40 | — | — | — |
|
GATCAAGGATTACGACACTCACGGCGTAATACCGCATGGA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:5facf5032eaf
|
40 | — | — | — |
|
GACCGAATTAGCCCACTAATGCGGTAAGTGCTTCATGAGA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:3b655f6819ff
|
40 | — | — | — |
|
CCTGGATTAGCCGTGCACCCAATACGACTAATCCGCAGGG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:3d72afe21ce8
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGAATTGGTTTATAATTCCTTACCGAATTATAATTCG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:30189aecd842
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGGATTAATTACGACCGTAGTCGAGTTAACTCCGAG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:e5c589d45c2c
|
40 | — | — | — |
|
TGTAAGAACTCGGATCTAAGGATTAGCGAAGCTAATTCCG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:e7f079661c01
|
40 | — | — | — |
|
GCTTACCTCCCGTGATTAAGCTCATTGTGAACTTAATCCG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:69562fdfa316
|
40 | — | — | — |
|
GGGGGAGGAGACGGATTATGCTCATGATAATCCGTTACAC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:9bf5f361c681
|
40 | — | — | — |
|
GGAGATTAACGCGTAGTTACGTCGAGATTAATCCCTGGAT
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:ded1fb045fd5
|
40 | — | — | — |
|
TCGATCAGCAATTGTCTAATTAGGCTGGCTAATCAGGCAC
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:94f20969f143
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCTAATTCCTAAGATGTAACCTAATCTTCGAATTAGG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:d43791680e03
|
40 | — | — | — |
|
GGACTGTGAACACTCTAATCCAAATTATAACGGATTAGTA
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:866ee2b78cb0
|
40 | — | — | — |
|
TGTTACGCGAATTAGACCAATGTACTAATCCGGACGGGTG
PANAPTA:P56915:GSC_MSX1:PRJEB66722:R3:ebb470b39568
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final