GSC_NKX6-1
CAP-SELEX sample GSC_NKX6-1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TAGGCAATTAAAAAGCAATTAACTGTCACCGATGTCAAAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:053d163e50dc
|
40 | — | — | — |
|
AATTAAAAAGCAATTAGGCAAGCACACCTCAGGACCTGAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:aec2df78cee1
|
40 | — | — | — |
|
GCAATTAAAAAGCAATTAATGTGCACGAAGATGGGCGCGG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:213e2d3e7f4f
|
40 | — | — | — |
|
CCGACACTAATTGGAAAATAATGACCTAACTCGATGCACG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:d4901eebae7b
|
40 | — | — | — |
|
CTACTCGTTTACCTCATTAAAAACCCATTAGTGCGTGTTT
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:288127715d7f
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAGTACCTAATGAGGCTTTAATTGCTTATTAATGACC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:2867790e28f4
|
40 | — | — | — |
|
GAGTACTTCTTACCTTGCTAATTACTTTTTAATGACTCGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:83142bf2a2a3
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGTGTTAATGACAATTTAATTACCGATTAACCGGTG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:24131b45db5d
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAATTGCAATTTAATTGGTTTATGGTAGATATTCAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:04de208cc884
|
40 | — | — | — |
|
ATCAGTTGTGCATCTGCGCTAATTAAATAGCAATTAGCGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:99f5ca392d27
|
40 | — | — | — |
|
AGCTCTAATTGCTTTTTAATTACCGCTACGTTCCGATCAA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:3dc0b58c6d93
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATGCGAAATTAATTGATTGCGATCAGTTAGTCCGTC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:641ae1397b8b
|
40 | — | — | — |
|
TCTGCCCGTGAGACAGTCTCATTAAATAGCAATTAGGACG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:0b7eb84c47fd
|
40 | — | — | — |
|
GTTACGGGAACGTTAATGACTTTTTAATCACCGTTGCAGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b9617fcbe6d6
|
40 | — | — | — |
|
ACTGCGCCTCACAGTACAATTAAAAAGCAATTAGGTGACG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:07fd2290efda
|
40 | — | — | — |
|
AGGCTGCTAATGGGTTTTTAATTACTGCATAAATGAGGGA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:f57731bd7cbb
|
40 | — | — | — |
|
AGCAAAGTCATTAAAAAGCGATTAACAGCACTTCAGCGCT
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:adaf58b8298b
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCGCTGCCTTAAGTACTAATTGCTTTTTGATTACCTC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:6379dcf7433c
|
40 | — | — | — |
|
TCGACCCATTATGCGTAATACTAATTACTTTTTAATGAGG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:af9e271e88ff
|
40 | — | — | — |
|
AACGGCTACGCTAGCTAAGGGCAATTAAAATGCAATTATC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:62963ec0b310
|
40 | — | — | — |
|
TTAGGCAACGGGTAATTAAAAGGTCATTAAGTGCCTGCGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:3443230a2c7d
|
40 | — | — | — |
|
ACACAGTAACGGTGTTGACCGCTAATGACATTTTAATTAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:cc4b87bf9928
|
40 | — | — | — |
|
TATGGAGCAGGAACGTAATTAAATTCGCATTAATTGCGTA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:2636c9532447
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATCACCTCATTAAATACCAATTAGCGCGCCATTCTT
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:c0db1f15d121
|
40 | — | — | — |
|
CATTAATTAGTCATTAACGGCGACCTAACGTGTTGATTAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:64bdf3aa84fc
|
40 | — | — | — |
|
TTACATGCTCATTAAATCGCAATTAACTAATTCAGGATGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:71253fad868a
|
40 | — | — | — |
|
CATTAATTTCCCATTAATGCACTAGGCAATGCTATCAGCA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:7047b2d5ca03
|
40 | — | — | — |
|
TACAGATCGAGGAAATAGACTAATTGCTTTTTAATTGCCG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:2cfd33bc0d4f
|
40 | — | — | — |
|
CCGATCACTCATCCACCGCGTTAATTGGTATTTAATGACC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:18a7c0260110
|
40 | — | — | — |
|
CAGTCCTAAGTAATTAAAAACCAATTAACTTGACTGATGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:8280e42d7d3c
|
40 | — | — | — |
|
CATTAAAAAGTCATTAGCGGCGCCCATCCAAACTGATTAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:3460f3dfad02
|
40 | — | — | — |
|
TCGACCCCATTAAAAAGCAATTAACTGGGTCGCCCACTCC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:b7ccea2aac38
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAATTACTAATTAATGACTTTACGATACTCGCGTGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:85adedf01c19
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGCACGCCAATAACGGGTTAATGACTTTTTAATTACG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:fea630724da5
|
40 | — | — | — |
|
GATGTGACTAATTGCTTTTTGATTACTCGCGACCTGACCT
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:6e6c6d60b13d
|
40 | — | — | — |
|
TCGACAGAACAAGCAATTAATACGCAATTAAGAAGGTCAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:cfb0a15730a1
|
40 | — | — | — |
|
TAATCGATAATTAATTGGCCCTCTTGCGCCACGTCGTGTC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:5d9528e5aadf
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGGAGTTACCATCCTTTAATTGCAATTTAATTGCCAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:4a7f9c95781e
|
40 | — | — | — |
|
GGCCTAATGCGTTTTTAATGACCATACACCCCACATAACA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:d3c45c04e5c8
|
40 | — | — | — |
|
CCTACACGGGTAGCGTGTCATTAAAACGTAATTAACCGCA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:390c0feff5b4
|
40 | — | — | — |
|
GCACCCCGAACAGACCTAATCAAATCGCAATTAACTCCCG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:88e79435085e
|
40 | — | — | — |
|
GGTGACGTTAATCGATAATTAATTGGTCTCGAATACTTAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:4e694ba6e905
|
40 | — | — | — |
|
CGGTATAACCGGTCACTAATCGATATTTGATGACCCTTCT
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:181f45d9e443
|
40 | — | — | — |
|
GGTCAAACGAGCAGTTAATTACAATTTAATGAGGTACGAC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:e8eca839ac47
|
40 | — | — | — |
|
AATTAAATAGTCATTAAGTTCAGGAGCGTCGCGGCAGCGC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:bf157ea6df4f
|
40 | — | — | — |
|
AGCCAATCTACGTTAATCGCTTTTTAATAACCCATCGACT
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:1755dddea8c8
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCTAATGGCTTATTAATTGACGTAACACCAAATATCA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:1a2d08b903e3
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGTCCGTTAATTGCGATTTAATTGAGGAGGAACTTTC
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:fbf23c6d4e24
|
40 | — | — | — |
|
GCAAACCACTTTCAATTAGGTCATTAAAAACACATTAACA
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:cc6e5ceb211d
|
40 | — | — | — |
|
CATGCCACTTAAGGTATAATTAAAAAGCCATTAGTCATCG
PANAPTA:P56915:GSC_NKX6-1:PRJEB66722:R3:03b22ec89cd2
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final