HOXA2_IRX5
CAP-SELEX sample IRX5_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACTGCGCGTTAATGATTACGCTAATTATGGGTAATTACGG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:9f0a8353c5fd
|
40 | — | — | — |
|
CCAGCTAATTACACTAATTAACACGGCACACTAACATTAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:e627366eb2b7
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCAACTAATTACACATACATTGTGTAATCAGCGTACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:401c3c65df0d
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTATGTTTACACTAATGACCGTAATTACGATAGTTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:e1b07c536c83
|
40 | — | — | — |
|
CACTAATTATCCCCCTAATTACAGCATCTGACACGCCATT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:57d175db553e
|
40 | — | — | — |
|
GTTACACAATTAATGACATTTTAATGACGCAGCACACGCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:cffea36d11c2
|
40 | — | — | — |
|
GCATGGCATGTTAATTACGTAACATATTGTCACTAATTAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:5905c55d802a
|
40 | — | — | — |
|
AGGGATGTCCTTAATTGCAGGCGTAATTAGCATAATTAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:8b5e3659c92d
|
40 | — | — | — |
|
CACTGCTAATTACAAGTCGATTATGTACCGACAATGATCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:ff3f1417673f
|
40 | — | — | — |
|
TGACAACCTAATTAAGAACTCATTATGTCCTCACGACATT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:5cf5bb659801
|
40 | — | — | — |
|
AACACGCGTAAACACTAATTAGCGTAAGCTGTACGCAATT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:97ae27f95fa9
|
40 | — | — | — |
|
TATGTCATTAAGATGTCATTAAGACTGACAGCTGATACAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:9f85e61bb5fd
|
40 | — | — | — |
|
TGTAGTTAACATGCATCGTTAAATTCACATTACCATCGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:9f757f0379af
|
40 | — | — | — |
|
ACTCATCTACCACGCCTAATTAACATGCTAATGACACGAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:3f1760ff7f05
|
40 | — | — | — |
|
ACATTACATGGTAATTAGTACTTACATGTATCTCCCGACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:83dafb407d26
|
40 | — | — | — |
|
CACGTAATGACATGTCATTAGCAAGCTCTGATCCGTCGTT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:4953029408ee
|
40 | — | — | — |
|
ACGAACATATGTAATTAGTATTTGTCTAATTACAATAACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:0c210eece5be
|
40 | — | — | — |
|
TGACACTAATTACTTGTAATTACCCATACGAACGTTTGTT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:61a25b499d28
|
40 | — | — | — |
|
TTAGACGCAATTCACCTAATTACATATTGACGACATTGTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:dfa8e3d0060c
|
40 | — | — | — |
|
AGAATGAGGTAATTAGTCGCCACTAATTAGTACAAGCGTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:a760e9bcbc2b
|
40 | — | — | — |
|
CCTACCTAATTACCATAATGACGTACGTGTACACAACAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:72663885c29d
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTCATTAGGGAGTAATTAGCTTAGTCGAACACGGCCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:9be835435188
|
40 | — | — | — |
|
TACATGTATTGTACATGACATTAATTGCATCAATTAGCTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:af41ac482225
|
40 | — | — | — |
|
CATGTATACACACGGACGATTGTGTAATTAACATAATTGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:350395b3eb07
|
40 | — | — | — |
|
TACGTTAATTACACATGTAATTATCACACCGTATGACTCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:7422698eefc2
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCTAATAACGTACATAATTACTGTTGTAACATACTGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:c1ca315ec334
|
40 | — | — | — |
|
TACTTGTGGTAATTACCCTTGCACTAATTAGTGCGTGACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:c58659d8e7a3
|
40 | — | — | — |
|
CAAATGTGTTAACATAATTAACTGGCAATTATCACCCGTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:0fe41303e168
|
40 | — | — | — |
|
CATATGTAATTAGTTGCTCATTACATACTTAATAGGCATA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:4f66aeaaefff
|
40 | — | — | — |
|
CGCAATTAATGATCCCTAATCTGTTTACACGCGTACTGCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:ee9f6d4fe533
|
40 | — | — | — |
|
CACTAATTGCAGCTAATTACATAATCAATCATGATTCCTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:bb72d8f65ea1
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTACGCTCTTAATTATGTCCACTACACTTGCTAACG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:9b93400c91de
|
40 | — | — | — |
|
CGACACCACTGTTAGGTACACGCTAATTATGACCCTAATG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:bd5197ee9085
|
40 | — | — | — |
|
TGGAAGATAGTAATTAGCGTGTCATTAAGGCGATAACAAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:a1db68716cbf
|
40 | — | — | — |
|
CGAACCCGATAATTAACCCTAATTACCTCATTATGTCTAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:1fe350f3504d
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGGACCTTAATTACGCTAATACGACATAAGCACTCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:16331339b635
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATTACCACTAATGTACCTATACTAAACATTCGTACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:59fcac82bdb1
|
40 | — | — | — |
|
AACACGCGTTCTAATTGCATAATTAGACTCATTACATGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:94c64791f99e
|
40 | — | — | — |
|
TTCTGTCAATTATCGCACTAATTACCGTACACGTATATGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:7cc206261587
|
40 | — | — | — |
|
CACGGACAAAATGTCATTACACGGAACCTAATGGCTTACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:3d9e84c24991
|
40 | — | — | — |
|
TAACATAACTACAACACAATTACAGGTAATTAGGCGTGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:88c26bec87b9
|
40 | — | — | — |
|
ACAACGGTAATTACCGATAACACGTTACATACGCTAATGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:2e91d988e3ff
|
40 | — | — | — |
|
GACACCTTAATTACGGTCATTAGGTGCATCCGTACGGACT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:ee0afad728b6
|
40 | — | — | — |
|
AAGTAATCTAATTACACGCTAACGATAATTATCTACTTGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:0fba6a390659
|
40 | — | — | — |
|
CACCAATAATTTGCGTTAATGAGCAGTAATTAGTGTCAAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:53433cdff573
|
40 | — | — | — |
|
TCGTGTTAATTATACTAATTACCTACATGACCTATCTCCC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:8ccb36374a1b
|
40 | — | — | — |
|
ACATAACACTAATTATAAGCTAATTAGGACCGTCATTTTT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:ff038f7155d4
|
40 | — | — | — |
|
CACTTAATGACCCTCGTTGACACCTAATTACATGTCGCAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:9ca62ecb48c1
|
40 | — | — | — |
|
GGAAACAACGACTAATTACACAAATTACCCATGTCATCGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:6eb43ae9eb04
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTGTAGCTATGTTAATTACCTATTAATTGGACAAACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_IRX5:PRJEB66722:R3:561246aaf5ab
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final