HOXA2_MEIS3
CAP-SELEX sample MEIS3_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTCTCATTACCGCTAATTAAGTCGCCTTAATGTGTGCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:69db05498c31
|
40 | — | — | — |
|
AACGAGGCATCCACCGTAATTAACCCCTAATTAACCCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:b7063f3ed1fb
|
40 | — | — | — |
|
TCCATCCATTAGCAAGCTAATTAACTACTCATTAAGCCAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:04ea20491d29
|
40 | — | — | — |
|
ATCATAATTAATTGCTCATTAAACGTCATCAATTAAATAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:7cd08497bfd2
|
40 | — | — | — |
|
ATTACATGTCGTTACCTTCTCATTAGCTGTTAATTACGCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:ab9f48603662
|
40 | — | — | — |
|
TCATTAACTGTCACGTTAATGGACACTAATGGTCCGATAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:9141c848bc1a
|
40 | — | — | — |
|
GACACTAATTGCTCGCGTAATTAACAGTAATCACCGTTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:b478565a2ca4
|
40 | — | — | — |
|
TCATTAATATCCAATTAGCTTAACGTGTAAACGCCCCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:044cf1ced5f6
|
40 | — | — | — |
|
ATAATCATTATCTCCTAATGATCGGCCTAATAGCACATTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:434c4f1ca0d1
|
40 | — | — | — |
|
CATTAATATCGCATTAGCACCATGAAACGTATTACGCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:aa0cd1332483
|
40 | — | — | — |
|
ATTACTAACGAGAAACCAATTAAAAACCCATTAGTGCACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:2ff0d34316fb
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCGCTAATGACCCTTAATTACCCTACCGCCCAGCCTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:5955ce78368b
|
40 | — | — | — |
|
AAGCACATGACGTAATGACACTCATTATTTACTCATTAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:36859bca8bde
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCTTTAATGTATCCGCTAATTGCCATCTAATTGCTT
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:2f1717969ce2
|
40 | — | — | — |
|
ATTATCTAGTCATTAATCTTCCCTCATAATGGTTTTTTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:afb404b853cb
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTATCATCATTAAAGCCATTAAACTTCAATTAAGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:f9a4a93c375d
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCCATTTATGACAGGTAATTAGTCAGCTAATGGGCAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:98396b5ff135
|
40 | — | — | — |
|
TAGCTAATTACCCTCGTTAATGATGATTATGTTCCGCACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:9ebb3c0c7ea3
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGCCTTCATCAGCACCGTCATTAGGAGTCATTAGTT
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:b0eb54f95ca3
|
40 | — | — | — |
|
CCCAGCATTCACTAATGGGGTAATTAAGGATAATTACTTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:3b7eec680c2f
|
40 | — | — | — |
|
ATTAACCATAGCTTAAAATCTCATTATCGACAATTAGCCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:db059c57707a
|
40 | — | — | — |
|
AGTCATTACATGAACTAATTAACGCTAATGACCTATTCCC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:8f8ac682735b
|
40 | — | — | — |
|
TTAAAAGGGCGTAATTATCGATGCTAATGATGATTGCATA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:5e22a9b076a5
|
40 | — | — | — |
|
AATGACATACGTGACGCACCTAATTAATGCCTAATGATGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:2f1786b7ee50
|
40 | — | — | — |
|
CCCATTAACGTTTGCCATAATTACTGGTTAATTGCACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:160862586487
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGCGCTAATTAGTATGTACGGTTGATGACGGCTAAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:2a0a9cf2f7ae
|
40 | — | — | — |
|
TCTTAATTACATGTAATTAGCATCCTATTAAGTGATTAAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:09c2d9d81a01
|
40 | — | — | — |
|
ACACAGCCTAATTGCTACTAATGACCCCTCATTAGAACTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:72a932c1e7bb
|
40 | — | — | — |
|
TAATCATCATTACCGCATGCCATTAATTAAAACTAATCAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:6028ea0af114
|
40 | — | — | — |
|
ATCTGTTCAAACACGCGCACTAATTAGTCGTAATTAGCGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:6462b24e051f
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGCTGATAATTACTTATTAACGACCAGGCCCACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:6db65e70b6f0
|
40 | — | — | — |
|
TTGAGGGGTAAACGCTAATGACGCCTCATTAGCGTCGTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:5ee2de3d3abf
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGCATGACCTAATTACACTTTAATTAGTTACCCATCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:5e20950082d9
|
40 | — | — | — |
|
AATTACTAGATAATGATGAACCTCAATTAATTTTCGATTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:9e86e410c523
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTACCGTAATTACCGCCGCCTACCACAGTGCCGTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:7dcf91f63358
|
40 | — | — | — |
|
CACCCAGAGGCCATTAGCCATTACCCTTAATTACCCTTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:1db54af66dfe
|
40 | — | — | — |
|
AGGTCATCATTAAATGCCCATTAGGCGCGTGACGCACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:22f0547c9d40
|
40 | — | — | — |
|
GTCCCATTACATAATTACGATAATTACGCTTAATTACAAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:e34c16c26d45
|
40 | — | — | — |
|
TCTAACTAGTAATTAAGTGATAATTACCGTACATTAACAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:7cdc0cf37c00
|
40 | — | — | — |
|
TAATTATTTCCTCATCAACCGATCTAATTACTCAAGCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:7e43ee04a4a5
|
40 | — | — | — |
|
GCTGAACCCACCGTTAATTACCTCCTAATTACCTTAGCCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:7cd313b25893
|
40 | — | — | — |
|
AACGCTAATGATAGCAATTAATTCCCGCCTTAATTACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:b56a7042edbd
|
40 | — | — | — |
|
TTACGGGGCTAATTACGCGTAATTACAATAACGCATTTGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:30b895a5039b
|
40 | — | — | — |
|
CGATAATTACATTTTAATGAGGCTTAAATGGGGAGTCACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:f943b60e3b48
|
40 | — | — | — |
|
ATAGCTCGTTAGTGCCTAACCCTAATTAGTGTAATTATCC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:df0a641077ec
|
40 | — | — | — |
|
GGACCGCGTTAATGCCCTGTTAATTGCTTTTTAATCAGCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:c6eeb8f07455
|
40 | — | — | — |
|
TAACATTAGGCCCACGTAATTAACAGCTAATTAGGCCTCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:dcff509702a4
|
40 | — | — | — |
|
TGTCATTAAAATGCAATTAGTTCGCACTCACCTGCTCCGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:87d1b51fd40b
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCTAATTACACATAATTACCTGTACTTACGCGCACAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:cc52a6706f32
|
40 | — | — | — |
|
TCAATTATCATTAATTATAGCTCATTAGTATGGCCTGCCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_MEIS3:PRJEB66722:R3:ec4dfd66b260
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final