HOXA2_NPAS2
CAP-SELEX sample NPAS2_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACTAATTGGAGTTTAATGACCTTACCCCTAATGAGGGTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:6eb9ef53f93c
|
40 | — | — | — |
|
GTTCATTAGGCAGTAATTACGCATAATTAGCAATTACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:5bf9dbbe56ba
|
40 | — | — | — |
|
GATATGATAATGAGTTATTAATTGCCCTATTTTCCCTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:2b988603e4e3
|
40 | — | — | — |
|
AATAACCAATTAAACGTAATTACCCGCACATTAGCTCATA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:f1b0c8fdc36e
|
40 | — | — | — |
|
TACGCGCACATTAGCGATAATTAGCACCCTTAATTACCGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:d0b162e23785
|
40 | — | — | — |
|
GATTAGCTGTCCTAATGAGGAAATAATCACGCTATGTTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:7de41019f299
|
40 | — | — | — |
|
ATTCATTAGTGAGGCTAATTAGTTCCTAACGATTTAGTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:394fa5ad5717
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCATTAATTAGACCCTAATGACACGATAATGGCCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:e2e8b7910875
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGTTAATTACCTTTTAGTACATCATAATTACCATTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:2185082e4d1b
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGAAGACCATTAAGTACCCATTAATAAGGCCACTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:dd5a80347c2e
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTCATTAATGGGTGTCATTATTTTGACATTACGCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:f92026d5ac10
|
40 | — | — | — |
|
AAGGCAATTAGCCCTAATGGCTGGTAATTACTCCTTATAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:22db4fddb241
|
40 | — | — | — |
|
TGACTCAATGAACAGTCATTAACGGTAATTACAGATAATG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:5fcf60eaaf00
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTAGCCTACTCCAACACTAATTACCACTCATTAACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:773ab44c2f66
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGGTATTAATGTGTCTAATTGCAACATAATGAGTATG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:28b0a7236b92
|
40 | — | — | — |
|
ATTAACGTGATAATGACTACACTAACGCGTTTATAATTGG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:0f34d45a1dbc
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATTGCCTTAATGACAGATACATAATGATGCCATAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:b768705fe22e
|
40 | — | — | — |
|
TGCTTAATGATGTAATTACGCTAATTAAGTAGCAACAAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:1244f37f11f2
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGTAATTAGTGTTCCTCTAATTATATCCTAATTATGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:5f87ec62fced
|
40 | — | — | — |
|
AATACGCCTAATTGCGCGGAACCCCTTAATTAACGCTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:d600e01db27c
|
40 | — | — | — |
|
ATCGTCACTAAACTGGCCTAATTACCCACTAATTACTCAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:6e783b21f36d
|
40 | — | — | — |
|
ATCATTAGCACTGGTGATTAATGGCTAGCCTAATGATGGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:a7dc70e116b9
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCTTAATGACCTCCCATTAACTATTAATCACCACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:cee45cd6145b
|
40 | — | — | — |
|
GCGCTAATTACTGTGGTTAATGAGCGTAATTACCGGATAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:c45caa5e4abd
|
40 | — | — | — |
|
ATCATCAGCATTAATACCTCGTTAATAGCAATTATGTTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:cc9310d9ee37
|
40 | — | — | — |
|
AATCGAATACTAATTAATAACTAATTCGAAATCGATTAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:31f4a348a83b
|
40 | — | — | — |
|
ATTACTAAAGCAATTGCGAACTAATGACTTATTAACGACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:cd19609c4d7b
|
40 | — | — | — |
|
AACCCTCTTAATGAGATAATAATTGATGCAGTGGTAATGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:88ef12f6a733
|
40 | — | — | — |
|
TGTGCTAATGATACTTACTAATTGGAACAATTAGGCCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:221c81fec711
|
40 | — | — | — |
|
ACCAAACATTAATTGCCTCTCGCTAATTGCGCCTCATTAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:260279a60c18
|
40 | — | — | — |
|
CACCGAACTTATCGATTAACGATCATTAACGACGTGCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:0f1d59e673a4
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTGAAATTAATTATCCTAAAGAACGTTAATGACCCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:7b38c96060f1
|
40 | — | — | — |
|
CACACACTGACAACACCACTAATCGCTTTTTAATTGCTCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:37be9ec71339
|
40 | — | — | — |
|
CGGCTAATGGCACATTAATTACCGTTGCCGTACCGCCTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:e797b3dbe91c
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGAGTTTTTAATAGTCAGTTAATGGGTGCAACGCAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:5eec0008bf99
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTTAATTACCCATCATTAGCGCTTGCGTACAAGGTTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:0c6edf233435
|
40 | — | — | — |
|
ACCAATTGTGTAAATCATTAAATACTCATTAAGGTGATGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:95b4df1f017f
|
40 | — | — | — |
|
CGAAAATTACCATTAATTACGCTTCATAATGTTTTTTTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:00bd11c961c9
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATTACATCCTAATGAGCTGGAATATTATTACACTAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:45ea7f3d8ea9
|
40 | — | — | — |
|
TATTCATTAGTGAAATTACTTATTAATTGCCACTAATGAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:a30dea6d9d12
|
40 | — | — | — |
|
AATTAATTAGTAATTAACGCGAATTACCATGCAAACTGAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:f76ae26b5a55
|
40 | — | — | — |
|
GCGCTAATTAAAAACTAATCAGCAGGGCAATTAGGTAACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:4ccc247e6028
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTGCCCCCTAATTTACGTTAATGACCATAATTGTTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:a30327d55a55
|
40 | — | — | — |
|
GAAAGTAATTAGTGTTAATTACTATTTCGCAAGTTATCAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:407cbace9b1f
|
40 | — | — | — |
|
ACCGAATCACAGGATGATAATTAGTGTCGTTAATGACCCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:708b3d172a28
|
40 | — | — | — |
|
ATCATCATTACGGCATAATTACATTCCCAGTCTATGATAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:7aa8ff332de5
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAACAAACCTTAATTGCATGTAATTAGAGGAATTAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:bbafb73690c7
|
40 | — | — | — |
|
AAGTAGTGCTAATTAAGACTTAATTAGGTCGTTACTTAAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:bd2891c98de6
|
40 | — | — | — |
|
AAAGAGCAATTAACATTTTCATTAGTAGTCATTAGTGTCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:f02638625b16
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTTAAGTGACTTGCTAATTACTCATTAATGAGCCGTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_NPAS2:PRJEB66722:R3:77967071c688
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final