HOXA2_TBX20
CAP-SELEX sample HOXA2_TBX20; CAP-SELEX sample TBX20_HOXA2 · 3 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGACGACACGGATACCTCCATTTACACCTCATCAACACCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:489eddfecaf4
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCTCGCAATTAACACCTCATTATCACAGGGTAACCAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:6d3e8553b7be
|
40 | — | — | — |
|
GCTCTTTCCAACGACGTGTTCACACCTCATCAACACCTCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:6d34085f261a
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGTGCTAATGTCCACACATTAACACCCTTACGCCAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:4f11a2e005e2
|
40 | — | — | — |
|
GCACCTCCGCTAATGAGGTGCTAATTAGCACTCGCCCTGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:d3fef91f637a
|
40 | — | — | — |
|
TAATGATCGCGTAATTACATTGAGTCATCATTGTTAATGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:9a10bab79626
|
40 | — | — | — |
|
AGTGTGAGCAATTAGCACTTAATTAGAATATGGGGTTGAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:5ed300bbf90f
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGTGACGCCTTAATGATACGGTAATTAAGCGTAATT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:925fda3ea3b8
|
40 | — | — | — |
|
ACCAAAACTAGATTAATTAGCACATCGTTATCACCTTTGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:4ebf03207345
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGCACTTACTGCTAATGACGTGTTAATTGACATTGCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:67aa13e7f930
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACCGCGCTAATTACATCATTAGCAACCCAACACCCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:bd93820c1c04
|
40 | — | — | — |
|
ACGATTAAAAAGTCATTATGTTCCTTGATGACGTTTTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:bb95ab73dbea
|
40 | — | — | — |
|
AAATCAGCAATTAACACATTAACACCTCCCTTTCTCACAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:dc82edbd7502
|
40 | — | — | — |
|
ACATTAAATGATAATGTATGATCATTAATATGTCATTAGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:f161b665462c
|
40 | — | — | — |
|
CTACTCCTTAATGTCGTCACATTAACACCTCTGATTCCAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:7fb2e6b723ab
|
40 | — | — | — |
|
ACAATTAGTATTCATTAATTAGCAATTAGGCACGCATTAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:e508e639e1d9
|
40 | — | — | — |
|
TCCATAATGGTCGCTGATTGAGTGCTAATGTGTGACACCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:579b4f3944bf
|
40 | — | — | — |
|
TACCGCCTCCTCTATAACACCTAATTATCACCTCGTCGAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:f57f9528c4c7
|
40 | — | — | — |
|
GAATGCAGCATCGTTACATAAAGTGTGAACATTAACACCC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:0bcad2e283c7
|
40 | — | — | — |
|
TTTCAACTACATGTGTGAACGATTAACACCTTTCTAATGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:fb45e10578e1
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGCGCTCGCACCTGTTGGCTTGGTGAATGCGCATATC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:8e7f5c1f90a4
|
40 | — | — | — |
|
ATATCCGGCTGACATCGTTAGCACGTAATCGACACCTTAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:9d60568e37b5
|
40 | — | — | — |
|
AGAGACGTTAACACCTCGTTAACACCTACTATCCATGCCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:59f9ea616548
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATTTCCCTGTAAGATCGCACCTAATCAACACCTCCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:4cc6f6347965
|
40 | — | — | — |
|
TAATGATAATCACGTTAATGATAATCGCTTTTTAACGACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:62d450d03a84
|
40 | — | — | — |
|
AGCAACCTAGTGTTAATGATGTGATAATTGATGAACAACG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:4d8c9b6e281e
|
40 | — | — | — |
|
AATTAATCGATTAAAGCGTTAATTAGCCTCATTAGCGACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:48d906807707
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGGGTTCACTAATGATGTGATAATTACGACTAATTAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:ba89cfb9206c
|
40 | — | — | — |
|
GTGGCATTAACACATAATTATCACCCTTTCACTTACAAGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:eb3aff561df5
|
40 | — | — | — |
|
CACGGGACCGAAAACGTGTTAATTAACTGTTAATGCACCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:70dd2bb27fc8
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGCCTGCCTAATTAGGTGCTAATTGCCTAATAGTGCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:4114ec7e95a5
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCTGGTAATTAGGAATACTAATGATCATTCTAATGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:0cc064dfd90b
|
40 | — | — | — |
|
TAGAGAAGCTGTTAATTACCTCGTTAACGCTATCTCGCCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:f3474586c1ef
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGCTAATCATCATTAAATGGTCATTATCTGGTAAAGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:62e33b1bf364
|
40 | — | — | — |
|
CTTATGGCAACATCACCCTTCCCGCTAATTACCTGTTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:6830853e5e18
|
40 | — | — | — |
|
TCTAATTAGGTCAGTTTATCACCTAATTAACACTTGCGTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:ddd971d53bd3
|
40 | — | — | — |
|
CAGAGTCGATTAAAACTACATTAGCATGCAATTAGGTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:dcdd3212cc2b
|
40 | — | — | — |
|
TTCAAGGTGTTAATGCTCACACTTCGTCCTGCGACACGCT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:0fc7abfc81cf
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGCTAATTACGCAATTATCACTATCGTCGGCTTGTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:5a18e910807c
|
40 | — | — | — |
|
TCAAGCACCGGAGAAGGGTGTTAATTATTAACACCTTGTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:ba7370517c23
|
40 | — | — | — |
|
TTGATGACGTGGTAATGTTTCACACCTAACGCTGAAGCGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:d55b7f9192e9
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTGCTAAATAATGAGCGTCATTACGCTCATTATAAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:5f7409d304f6
|
40 | — | — | — |
|
CTATCAAGATGTTAACGATGTGTTAATTACGGCGAGACCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:b1102f57bf62
|
40 | — | — | — |
|
TGGAGAGTGGCACTTAACACCTCATTGTCACATCCTCACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:6fd0408f356b
|
40 | — | — | — |
|
ATAAAATGACATTGTAATTAGCGTCTAATTGATTATTAAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:07d8887c883c
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGTATTGCCATAATGACCTGCTAATGACCTGCTAATT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:eeb710f38128
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGAGTTGTGATGTGAAGTCATTAAGAGGTAATTAAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:71cdfd1292b9
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAACCTTAATTACTGCAATTAATCGCGTTAAGAACA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:d2908a157aa6
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTATGCAATAAAGAACGCATTAAAAACGTATTAAGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:6d8c6ee7a90b
|
40 | — | — | — |
|
AGCGGCTAATGATCATTAGACTTAGATAATGACATAATGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX20:PRJEB66722:R3:ed7747e533cf
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final