HOXA2_TBX4
CAP-SELEX sample HOXA2_TBX4; CAP-SELEX sample TBX4_HOXA2 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGCACGCGTACCTCCCAAAAGGTGACGTGTAAAAAGTAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:5793890d8bc3
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGTGAAAAGCACCACCTCACCTCGTGGACGCCAAGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:072f1f384bc9
|
40 | — | — | — |
|
TTATTAGGTGACGTGTGAAAAGTCACACTTGCAAACTCGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:64ebf947db8e
|
40 | — | — | — |
|
TCTTACGTGGCGATATAATAGGTGTGGTGTGAAATGCCAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:41aa94b75459
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGTATAACGCGGGCCGAGGTGACGCGTGAAATGCGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:b7e96109a1d4
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGCGTGAGAAAGTGTTCACACCTCACCTTCCCGCGAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:a616a490161e
|
40 | — | — | — |
|
GTAAGTGTGAAAAAGTTTTCACACTTAGGTGGACGGCAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:2579f6df46f6
|
40 | — | — | — |
|
TCAGGATCGATGGCCTGTGAGGTGTGAAAACTCACGCGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:984924d63cd9
|
40 | — | — | — |
|
GCAGAAGGTGAGGCGATATGTAACACCTCACCTATCTAGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:9ea90b6e6827
|
40 | — | — | — |
|
TTGGGTGTGAAAAACAACACGTCACCTGCTACTACGTGCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:cff06982a26a
|
40 | — | — | — |
|
AAACTGAGGTGATGAGCTGGCGGTAAGGCCACACAGAGTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:c692321be0f6
|
40 | — | — | — |
|
AAAGGTGACGTGTTAGATTAACACCTTGATCGTGCGCAAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:3da5631d47e5
|
40 | — | — | — |
|
CTTGAAGGTGTCATTCACAACACGTCACCTTAGGTCCCAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:497195de08b2
|
40 | — | — | — |
|
ATGGATCGCTACGTCTCGCAACACCTTAGTGAAAGGTGTG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:d4216bc9bca8
|
40 | — | — | — |
|
CACTTAACACCTCACCTTGCAACAGGTGTCGCAGTGCCTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:e2e11db18795
|
40 | — | — | — |
|
AACACCTCACCTAAGGCGAGGTGACGCCTATACTCCAGCC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:7619d6bb8aed
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCCTAACAGAAGTGTAGTGTGAAAAATCACGCCTATC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:55d69d37304a
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGAGGTGTTGTGTCAGAACTCACACCTGTTCTTAATG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:802d0d9438a8
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTGCTAGGTGTGGTGGGATCTGCGACACCTTGGCCTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:69e5fc3b1642
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGAGGTGTTAGTTCCACAATGCAACTAACACCTCTA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:ac765a32d400
|
40 | — | — | — |
|
GCATAACACCTCGCCCAAGGTGACGTGTGTAGTATCGCAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:a20d2080e9b6
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTAGGTGAGGTGTGATTGTTGGAAGACACAGCCCAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:565e01f3c466
|
40 | — | — | — |
|
GCATCCCACCTTCCGCGGAAGGTGACGTGACAAATGCGTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:a42e332743be
|
40 | — | — | — |
|
ACAATAGGTGTGAAGAAAGTTTCACACCTAAATCAATAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:353288d07236
|
40 | — | — | — |
|
AGACTAACACGACACCTAATTAGTCCTCTCACACCTGGCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:17162caf5183
|
40 | — | — | — |
|
ACGGCGCACTAGATGCTAGAGGTGACGCGTCACAAGTAAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:f4de2ad0f39b
|
40 | — | — | — |
|
CCTGAAAATGGCTTTTTCACACCTCACAAAAGGTGTCGAG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:171a73cf5618
|
40 | — | — | — |
|
ATTGAGGAATAAGGCTAGAGGGTGACGTGTGACAATTGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:4127e783a134
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACACGTCACCTCATTAAGCACCATCCTACCTACCCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:014db729952c
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTGAACCCACGACCACACGTTGAGGTGAGGTGTCG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:b72556b9bc97
|
40 | — | — | — |
|
TTTCTTCACACGTCTTGATGAGGTGTTATGTGCAGTCCGG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:e109e92d5b1e
|
40 | — | — | — |
|
AGAGACGAGGCTAAGGTGAGGTGTTAAAATTAACACCTGT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:99f010b47720
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGGTCCTGCACCTAACACTTCGTTAACGAGGTGCGAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:ac1e278e803f
|
40 | — | — | — |
|
GTCATGTGGTAACGTCCGTAGGTGTTGCAAATAACGCGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:25cc9f598663
|
40 | — | — | — |
|
CACTCATCACACCTCGCCTCCCAACCGAATATCACACCTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:e9c1f6fa8cce
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTCGGCTTTCCAACACCCTCGCCACTTCACACGTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:d615c22a4334
|
40 | — | — | — |
|
TCTTCACACCTCCAATAAGGTGTTAAGATGCTAATTAACG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:e4331c785f54
|
40 | — | — | — |
|
TGACAATGTCACACCTCCCTAATGAGGTGTCTACATACGA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:09dac6d126b0
|
40 | — | — | — |
|
CTAAACAACGCCCCCTCCGAGGTGACGTGTGAGTTATACC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:ffeadcf79d9b
|
40 | — | — | — |
|
CTAGATGACAGCTGCGTGTAGGTGAGGTGACGTTTTTGTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:a1affa0d7e72
|
40 | — | — | — |
|
TGCCAGCCTTATACAGCTTAACACCTCATTAACACCTATG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:9283248631b5
|
40 | — | — | — |
|
AACATTTCGCACTAGAGTAAGGTGACGTGTGAGACGCGCC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:285af6e78c4e
|
40 | — | — | — |
|
TTCCTAGCACAGTAACAAGAGGTGTGATAAACAACACGTC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:efa958aadaef
|
40 | — | — | — |
|
GTGCACAAAGGTTGATGATAAGTGACGTGTGAACTGCGAC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:8147dc13f92f
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGTGTGGCTGTAAGGTGGCGCGTGATTATCACACCCA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:364d413bba97
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGACGGGTCCCACACCTAGGAGTAAGGTGTGACCTT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:4ae7aa470e2d
|
40 | — | — | — |
|
TAGGTGTTAATTAGGTGTGATGTGTACTTAGTGGATAGAT
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:5371d2ec68f3
|
40 | — | — | — |
|
CAGGATAGTGCTCAATTAACACCTTTAGTGTAGGTGACAA
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:b49d04b4685b
|
40 | — | — | — |
|
ATTCAACATAAGACACCTGCTAATTAGGTGTGACTTAATG
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:d994770c3b0f
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTGTCACACGAAGAACAGGTGTCGCGTGAAATGTAGC
PANAPTA:O43364:HOXA2_TBX4:PRJEB66722:R3:f030f6efb640
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final