HOXA4_ISL2
CAP-SELEX sample HOXA4_ISL2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CAATCACACACATTCCCCCACCTCACCCCCTGATACGACG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:083633d62734
|
40 | — | — | — |
|
CTCGGCGATGTTGACCTAGAATATCATTAAAGGCGAGGAT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:c2a714030bf8
|
40 | — | — | — |
|
ACTAGGACACCTTTTGCGTGTGGTTCATACACACCTTCGA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:10e44e991712
|
40 | — | — | — |
|
AATGTCGGACCACTTAGCGACCTGTCACGCTAATGGTCGG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:90992c70cda9
|
40 | — | — | — |
|
CGCCAGTATTGTTACTTAAACAAATCGATGCAATGCCTAC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:c8011399243e
|
40 | — | — | — |
|
TTGTCGTTACCAATTACAAATAAACGATGTTCAGTAGTGC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:7f8205efaf79
|
40 | — | — | — |
|
TACTTAATGTTCTACTGCGAACATCACTACTGCCCATTAA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:604b5d1bfeea
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTAGGCAGCGCGGTGATACACGTATGCTCAGGTGGTG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:698f826fbc53
|
40 | — | — | — |
|
CTATGCATCGCATTCGCGTAACGCGATACAAAGTAGAGCT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:81bf0f75eb3f
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGCATCATTAGGCCGTAGTCCTAATGATGATCACGA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:190a782bde44
|
40 | — | — | — |
|
CGGCATGTCTAAGTGAATGCTAATTGCTAGCCATACTTAG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:9c65398abbd8
|
40 | — | — | — |
|
TCGACAGCCGTTGATACCATTAGTTATACGACCCGTTTGA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:3bb5ff035a74
|
40 | — | — | — |
|
AGCAGACATGGACCCGCGATCCACTTAATGACGAGTGCGC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:5da7ed987d73
|
40 | — | — | — |
|
TACCATTTAGATACGCGTTACCCTTCGGAGAAAGCATCGT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:582871f77e56
|
40 | — | — | — |
|
ATCATCGTGCTGTACAAAACGTAATGTGTTAATTGCGTTC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:e7cc91c7bc94
|
40 | — | — | — |
|
GATGCACGTATGAACGTTGCGTGATTAGATGTGCATTACC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:bf88b3492a9b
|
40 | — | — | — |
|
CGTAATCAGGGTATCATTATGCCGGTACACGTCGGCCACC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:57ea877dc3be
|
40 | — | — | — |
|
TAGTAATTAGCGGTGAGTTTGCGTCATTAGGTAATAGGAC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:3bec42ec89e3
|
40 | — | — | — |
|
GCGGAGCGTGCTCCGTATGCGTGAGTACGATTAATGCTAA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:900ed09691ee
|
40 | — | — | — |
|
CGTAATGTGAGAACTTAACATTTACCTGATCACGAGTAAC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:8a13511e5103
|
40 | — | — | — |
|
ACGATCACATTATGGACCAGGGTCGTCGCTAAACGTAATC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:8c3d9b8491e0
|
40 | — | — | — |
|
ACCACACAACGTTGTATGGGAGTACGATTACGTTGATAGA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:1c7df2c04777
|
40 | — | — | — |
|
GGTGACAATTAGGCAGACAACAGCTTGCTGGCAAGCGTCA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:7dd83cc15d52
|
40 | — | — | — |
|
TTATGTGGTCACGTGTGATGACATTTCAATTGCATGGTTA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:a1e021932de5
|
40 | — | — | — |
|
GACTATCGTGTAGATCAGTCGCTGGTCTATAATGATCACC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:410d6056e33e
|
40 | — | — | — |
|
TCACTTAATTGACGCATGATGCGAGGCGTTAATGGGTCCC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:a6f57cfce878
|
40 | — | — | — |
|
CGAAGTGACCATTAGCTAAAACGGTTTGTACGCATCGCGC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:da2539eec272
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGGTTAGCGACGCTAAAGCACCACAAGATATGCTTTA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:8fe49212bd60
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGTATTGTATTAGCGACTCATTAAGCCTTAAATGTA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:624b60a4d46c
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGATACTTGTTGCAGGCTGCTTAGCGTCCACCGTCAC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:36c12a17b819
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATCGCTAATGAATGATATGCAGACATTAGCAATTGT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:416185163ffb
|
40 | — | — | — |
|
CAAGATCGATCATCTTAAGAACGATCGATAGTGACGAATT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:03553d6661ed
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTTCTGCGGCCACGGTGCGCATCAACCTGTCATTGAA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:3de67ffbbf8a
|
40 | — | — | — |
|
AATTGCTCATTAGCTTGCTTGCAGCCTACGTAGTAATTGC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:38ed161a2915
|
40 | — | — | — |
|
TCCATTGTGTAATTAGCACCATAATTACGCTATTTGTTCC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:250a06e4c6ad
|
40 | — | — | — |
|
CCTTTCGTACACGGCCGATCAGGAGAAATTCCATGTCATC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:31718be94015
|
40 | — | — | — |
|
GTGATTATCTCTACCGCAACGACACCCATCCTCACGAACT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:8c20f0001cfc
|
40 | — | — | — |
|
AGACTACTAAACTATACGTGAAAGGTTAAGGGCGTCGAGA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:26cd8a1ae5d4
|
40 | — | — | — |
|
AGTCTTGGGCATCATTAGCATAATGTTGTGACACCAATAT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:426be7ff8833
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTACACCAAACATACAGCGACAACCGCGAAGATAATC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:c2583075f9f0
|
40 | — | — | — |
|
GTGATTACGCCTTATCGCTGCTGTAGGCGATTTGCGTAAT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:8f1e2a6dd41a
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCCATTACATTAAGCACATTGTGATTCACCACCCGCG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:d6c7162e9ecd
|
40 | — | — | — |
|
GCCCTTAATGCGGACAAGTTGTTAAAAACGCATTAAGCAG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:1f229dbe1f65
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGATAATGCATGCCATTTAACTCTTACCCCACTTTGA
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:85f2024ca173
|
40 | — | — | — |
|
CGAACACCGACATGTACGTTAATGACTAATGGCCACTAAT
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:e23451f82d9b
|
40 | — | — | — |
|
AATCATCGTTCCTGCCATTACAGGTGTAATGTTTCAGCCC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:cf57bce28058
|
40 | — | — | — |
|
GAACGATTAACATTAAGGCTTATGGCTAAAGGACGTAAGC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:65410ee1cb5f
|
40 | — | — | — |
|
TGAACACCTTATGCTCACGCGGACCCGCTAATTGCTCGAG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:3ecdc6852103
|
40 | — | — | — |
|
CGGCGGATAGCGCGATAATATCGCCTTAGCTGCGTGGACG
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:a7d5b0eb48ab
|
40 | — | — | — |
|
GAGAGTGTTCTTAGAACGATACACGCCTCAGCATATTACC
PANAPTA:Q00056:HOXA4_ISL2:PRJEB66722:R3:1bdb56dc51e3
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final