HOXB4_ISL2
CAP-SELEX sample HOXB4_ISL2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTTATCACTAATAGGTTCCGTGTCAGTGGTTATTAATGTC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:92ddfa379fd2
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGCGGCACTTAATGGAGGCACTTTCCAGTGATAAACT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:0aa55785db5c
|
40 | — | — | — |
|
CAACATCAATTAGCAGCAAACGACCATTACGCTAATTGAT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:9262a12f48d4
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGGGCGCAATTAGCGCTGTCTAATTGATGCCCAACGC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:fb30c9f24111
|
40 | — | — | — |
|
GCTGTGTTAACTGACGTTGATGCACTTAAGGCACATTAAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:8da19bd8f832
|
40 | — | — | — |
|
TGGGCAATTGATCCACAAGCACACTTAAGTGCACGTTAAT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:88aeeded51a1
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGCGCATCAGAGCGCCATTAGCGTTAAGTGCACTCGT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:c0b727b62066
|
40 | — | — | — |
|
CTTAGCCCTAATTGCATGACAGCTAGTACCTGCCGGACTC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:bc40ee21d296
|
40 | — | — | — |
|
ACAGGTTCATAACGAGGAAGGCCGCGCTACCTGACGTGGC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:3b3127c7fe92
|
40 | — | — | — |
|
GTCGTTAAGTGCTGTTAATGCAGTTGTGGCGTCGTGGTAT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:471168cdb11c
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATGGCGATACCGCCAGAAAGTGGAAAGGAATGGAAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:cd7994c1b827
|
40 | — | — | — |
|
TAAGGATGAGCACTTACTCCATTAAGTGGCCATTTCTGCT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:b9652aab809c
|
40 | — | — | — |
|
AACACAATTACGTCCCATTAACGCACTTAAACAGCTTTGT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:1b857e1fb28a
|
40 | — | — | — |
|
CTTAAGTACGCATTAAGTACACCATTACTAACGTCAGTTC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:8b6bd18972f2
|
40 | — | — | — |
|
GCTCACTTCGCGTGCTAATGCACTCTTCATGTAGAGGAAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:61c17b228277
|
40 | — | — | — |
|
AGCCCTAATTAGCGTCCATTAACGGAGATTGGCCTCACCT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:9d38bbb197f3
|
40 | — | — | — |
|
TCAGAGTGGATGCATTAACGCTAATTGTACCTTACACGTT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:dcd0f46f7d50
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTATTAATGGGAACTATGATTTGTCCCATTATAGCTA
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:4ebdd225b9e8
|
40 | — | — | — |
|
ACATTAGAAGCACTTAACGGTAATGTACCAAACGGCAAAT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:1fc14f61272b
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGACCACTTAATGCCCATCTCGAACTCCATCACACGC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:a62ccca29ba0
|
40 | — | — | — |
|
CGCGGAAAGCACTTAATTGCCCATTAACGTAACACTCGAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:dd9f9812c851
|
40 | — | — | — |
|
TACTAATTGATAATTAATGCAGTCACTGGCAAAACAGCCT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:0b878d6a4d86
|
40 | — | — | — |
|
CTTAAAAAACACTTAATACCCGATACCTTCCGTCGTCAAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:ee6edaf3950f
|
40 | — | — | — |
|
TCAATTAAGCATGCTATAAGCCATTAACTAGCTCTAATGG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:20f42c6e1b19
|
40 | — | — | — |
|
CTTTAAAATGCATTAGGCCAATGACAATAATTGACGCACG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:4317641bd27f
|
40 | — | — | — |
|
TCAATTATGCTAATTGAATTAGATCGTTAATGGACGCGCC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:63e77100b782
|
40 | — | — | — |
|
TAAAAGGCAATTAACCTTCCATTAGGCAACAAGATGTAAT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:880615ee05ae
|
40 | — | — | — |
|
AATAAACAAGGGCACTTAATGCTAATTGCTATGCGCTCAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:c3abcbd07a61
|
40 | — | — | — |
|
TTAATGCTGCTAATGGATGTACTTAACTACGGATGCTTTT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:fcf6c92b98e5
|
40 | — | — | — |
|
CAGTCAAACATCCAATTAACATCGCTAATGACGTTCCGCG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:e8accc08c327
|
40 | — | — | — |
|
TGCCAGGTTGCACTTAGCGCTAATGGAATAACGCCCCGCC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:4310a7182b95
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCGCTAATGGAAATTAGAGTGCACATCGCGCCGGGAG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:82da0a185e57
|
40 | — | — | — |
|
TGTACTTAACACTAAGTGCTTTCACATTGTCCCGGCGTGT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:7932a4e401c7
|
40 | — | — | — |
|
CGAGTGCAAAGCCACCCCAATTATGACACCAATTAGTGAG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:fb072ac01084
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCGCTGAGCTTAATGGAATGCCATTACTGGCGTCGTC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:521f9688f34d
|
40 | — | — | — |
|
GGACTAATGAGCCTAGATAATTGATGATGACACATTAATG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:35e12e86150e
|
40 | — | — | — |
|
AGCGGGCATAAGTACCACTTAAACGGTGATAATGCACCAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:2900b9a06356
|
40 | — | — | — |
|
AGCACAGACCTGTCACTGCGGCTGATTCATACACACTCAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:c302c85a9ad1
|
40 | — | — | — |
|
TACAGCACTGACACAATGCAATTAGCCACTAATGGAGTGT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:e6d9322a6c7c
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGTCAATTAAGGCAATTAGCGATGAAGTGATTAGCGG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:664caf335ef8
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGTGTATTGCGAATACCACGTGTAAGAGCCTTGTACA
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:d506cdf2fb47
|
40 | — | — | — |
|
GCACTTCCCCTATTAGTGGCTGATCAATCACCATGACCAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:e95d5e0527f5
|
40 | — | — | — |
|
GGTAGTATCAGCCAACTCCACGACACCTCCACCCAGACAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:4734d43bff83
|
40 | — | — | — |
|
AATGACATATGTCACTTACACCTGGTAGAGAACACCTCAA
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:551ed437f9db
|
40 | — | — | — |
|
TCCACTCCCTAATGCATTGCCGACTATCGTTCGTCCCGCT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:e563831189aa
|
40 | — | — | — |
|
CGAAATAATGGCCCATAATTATGTACCATTATCGCAGCTG
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:562beaa89eb4
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTAGACCTTAAGTGCTACCCAGTCCGATAGCTGCAC
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:a2acf171bd5c
|
40 | — | — | — |
|
CCATCACAACCAAGAAAGTACAGGTACATAATGCCAGGAT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:b024f12fec70
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCACTTATTATGCATTAACGTGTGACAACGTTCGCCT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:1cc553c4a5b0
|
40 | — | — | — |
|
AGCAATTAAATACCAATTAGCGCAAAACCTCTATCGCCTT
PANAPTA:P17483:HOXB4_ISL2:PRJEB66722:R3:71f38d1ce51e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final