HOXC11_TGIF2LX
CAP-SELEX sample HOXC11_TGIF2LX; Mixture-SELEX sample HOXC11_TGIF2LX · 4 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTTTGTATGCATCTTCCCCTCAGTCACCATTTTGACGTAA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:e12986dfd8de
|
40 | — | — | — |
|
CATGACACTCCCTGACAGTTTAACGACCTCCGTCCCCTTG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7ca206861c7d
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGACAGTTTAACGACCCCCCATAAGCGTGACGCGTAC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:f7ab67962276
|
40 | — | — | — |
|
CGTCACCGATCAATCTTACTCACGCCCGCCTGAGACCCAC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ba5dbbdb348e
|
40 | — | — | — |
|
CACAACATCCACACGGGTCGTATAACTGTCAGCAATGACA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:f03569896a8e
|
40 | — | — | — |
|
CGTCTAAGCATGACAGATTAATTACCCATCAACTTGACGT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:78a1a1895de4
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCTGTCACGCAGCTTCGTCTTGACGTATTTACGACCT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:269de0cdf817
|
40 | — | — | — |
|
TTCGATCCGCTGTCAGCCCTGACGTGTTTACGACCTCTCG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0dd14c49033a
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTAAGCCTTCAATGACGCGTTTACGACCGTTGTGACA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b623bf39f082
|
40 | — | — | — |
|
CAAACGTGCACCACAACTTGACACTGGCACTCGTACCACT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c45dcf307653
|
40 | — | — | — |
|
TCACCTTATGTCGTTGACTGCTGGTCGTTAAACTGTCACC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2d6b2466608d
|
40 | — | — | — |
|
TTAACCTGTCATTCGGATGACAACTCCTGTCACAGCCGAG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:19db3d7e818e
|
40 | — | — | — |
|
GCTCGTTAAACTGTCGTACATGACACTTTTGCTGTCGTAC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:afe4381b00df
|
40 | — | — | — |
|
TAGAGTGCGCATTGACACATTAACGATCTACATGACACCA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:50d6c4559f6b
|
40 | — | — | — |
|
CTGATTAGATGTCAAAGTGCGGTCATTAACCTGTCACTAT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:675b553e04bb
|
40 | — | — | — |
|
TAATGACGCAAACTGACAGTCCGCTGTCACGTTCATGACA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:f8602320c7af
|
40 | — | — | — |
|
TATGTCAGTCCGCTGTCAACCTGTGACACGTTTATGTTGC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ebd020993d06
|
40 | — | — | — |
|
ATGACAGCTGATGACAGTTTTACGGCTTTATGTAATTGGT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:300878df6531
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTATAAAACTGTCACAGCCGATGTCTAGGCCCTGACA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:d1818bcc7deb
|
40 | — | — | — |
|
CTGACAGTTTTATGATCGCTGTCATGATATTGTATGCGTT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b82609989740
|
40 | — | — | — |
|
TCAACCATGACAGATTTACGACCACCTACTGTTCCCATCT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2f99a4214ecf
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCTCTGACAGATTTACGACGTCCTGTCAACTGATTAT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a5030450dc2d
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATCGTAAAAATGTCACTGCCTGACGTTCGTGCTGTG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:14983a9ded49
|
40 | — | — | — |
|
TGGGTGGTCGTAACCCTGTCAACACGCTGTCACTAGCGTG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c46fdb021b11
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCCCCTCGTGACAAGGACATCGTAAACCTGTCAGAA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:184ef42339ad
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTCATGACATATTTACGACATCGCTACGTGTCAACCC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:6e0a3ddac94d
|
40 | — | — | — |
|
GCTTGACAGATTTACGACTTGTGATGTCATTTTCAATGTC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:de57d4bdd1c3
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCCCCGTCGGGCACTAAACCTGTCAACCGCCATGACA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:50950820065d
|
40 | — | — | — |
|
AGCGACACGTAGCGGGTGCGATCGTAAAACTGTCAATCCA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:6f918968f0ab
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGACATACCGTCACTGTGACAGATTTACGACTCGTTG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a709292f4297
|
40 | — | — | — |
|
ACATCTCCGTACGCTACATGACAGGCGTGACATATTTATT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:8720ee6d1aec
|
40 | — | — | — |
|
AAGGCCTAACTTAACCATGACAGCTCTGACAGCTTTACGA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:9ab6bb118951
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGTAGGTGACAGCTTGACAGTTTTACGTTCTTAGGAC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a9d0110e8da9
|
40 | — | — | — |
|
CTACGTCGATGACAGTTTAATCACCGCTCATGACAGCCAC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0ce9ef8f6f39
|
40 | — | — | — |
|
CTCGGTCAATGTAGCAGCTGTCAATCCTGACACTTTTATT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b0263c52968d
|
40 | — | — | — |
|
CTTGACAGATTAACGACATACAGGCAACAGCTGACATGCA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:beea7484b160
|
40 | — | — | — |
|
GTGACGTGTTTACGACTTCAATTTGACTTCCTGACACACC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:cb0a006c02dc
|
40 | — | — | — |
|
GGACCTGTCACAGACTCGTAAAACTGTCACTTCCTTCGAG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c7302eef01c9
|
40 | — | — | — |
|
TGACGGGATGGGTCATAAACCTGTCACAGTCTGTCTATCC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0e1bfafb3728
|
40 | — | — | — |
|
GGCCTCCATACCACGTCGTAAAAATGTCACGTTTGACAGA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:75bdfad51e9b
|
40 | — | — | — |
|
GCACACAACCCTGACAGCTCATGACGCATTAACGAGCTAG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:97200ea7c0dc
|
40 | — | — | — |
|
CCTGACAGCTGTAATGCTCATAAAACTGTCAGGCTAGATA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7f1e88df1db4
|
40 | — | — | — |
|
ACGGAGTGCAGCTGTCGTATAAACGTCACCCATCTGTCAT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:87ee650286bc
|
40 | — | — | — |
|
GCGAAGTCGTAAAACTGCCACTATCTTGACAGATTGTAGT
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2908cfb4b246
|
40 | — | — | — |
|
CTACGTCGCGTCGCACCCGGACGCGGTGACAGTTTTACGA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:5f56539bc5ec
|
40 | — | — | — |
|
TCGTAAAACTGTCATACAGCTACGTCGTATGAGCCGTATC
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b8af6a2012ff
|
40 | — | — | — |
|
CCTGACACCATATTGACAGGTTAACGACTGAACTCTACAG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a414c682f350
|
40 | — | — | — |
|
GTCCCCCATAAAACTGTCACCGCACGTCACCACACCAGCA
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:97d097700f52
|
40 | — | — | — |
|
CACGTCATAAACCTGTCAACCGTTCACTTTGACAAGCTCG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2eaa0eba2881
|
40 | — | — | — |
|
TCATAGTGCGTTGACACTTTTACGATGCTAAACGACAGGG
PANAPTA:O43248:HOXC11_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b68dcfad941a
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final