HOXD10_LMX1B
CAP-SELEX sample HOXD10_LMX1B · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AATGTCATAAAAACCGTATCTTAGCTTTACGATCTACGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:97aa0f58eb92
|
40 | — | — | — |
|
GTAGCACGGTACGGTCGTAAAATCAATCGTTAGAAGTCGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:d671b19cefba
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCTGCTCAAACTGTAATTAAATTCGCATGACGTCGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:8472503d5a40
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGCAATAACGATTTTACGACCTGAAGCAACTGGCTAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:162e963254c5
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGAGTGATCGCATCGTAAGTGTCGGTTTTACGACTTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:53321293b769
|
40 | — | — | — |
|
GCTCAATTAGTGACGTTTTACGACTATATGCACGTCATAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:9215f897801d
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGTCAACACAAAACTCATTAGATAGGCGTGTAGCCCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:c2848c018572
|
40 | — | — | — |
|
CATTAAATCGTGCAGTGTGAGCAAGGTAATAAACCGAGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:ca3504dd5908
|
40 | — | — | — |
|
TTATTCGTAGGTCGTAAAATTGACGTTGTTGTCGAGATCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:1617002355b0
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGCGACGAAGGGGACGAAGTTTTTACGACCTTTCGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:7c79ca8c23bc
|
40 | — | — | — |
|
CCCATAACACGTTTTCGTTACGCGTTTTATGACCCTATTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:bdb22aa55e0f
|
40 | — | — | — |
|
CGCTTGAGGCCTGACATTTTACGACCTGTTGTCTCGGGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:67e33a32ac92
|
40 | — | — | — |
|
TCGCTGGGGTAATTAACGACTTAACAACGTAATTACCACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:65b3b39ad57c
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTGATGCACACGAAGGTAATAAAAGACTATGTCGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:ed4bf61a0544
|
40 | — | — | — |
|
AACGTCGTAAAACGTGCTGTCCTTCATTCTCCCCTGTTTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:6020866a2c14
|
40 | — | — | — |
|
TTATGAGGTGATTCTAACGTTACGACCGTTAATTAAGCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:29d5b7e5721d
|
40 | — | — | — |
|
ATGATGTCGTAAAACGGGATGTACTCCATTAATTAGGCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:8e111913b735
|
40 | — | — | — |
|
TGACGCACCGTGGCGTACCGGTAATAAAACTGCCATCGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:0fd710e89ace
|
40 | — | — | — |
|
CATGATCACTGAGTTTTACGACATTGATACGTCCTGTTTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:9d25b8c565fd
|
40 | — | — | — |
|
CAATGATCGTAAAAAAACTAATTAAGTGCTCGATGACGGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:17a5a5e337d7
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTACCACGTCATAAAAATACTCGTACCACTCGTAAAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:d2cfcc78291d
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCATGCCGATCGAGCAAATCCATTTTACGACCTTAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:47f052420c00
|
40 | — | — | — |
|
GGTCGTAAAAGTTTTACCCCAACGTTCACGTGACGCACGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:2301be1a9bf3
|
40 | — | — | — |
|
AGCAATAAAATGCCAATAGGTCTCACGAAACGATCATAAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:7d34e3f7e2a6
|
40 | — | — | — |
|
GATGCCTGTAAAGTTAGACCAGTCGTAAAATGTCGGACTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:34429bb0fcf1
|
40 | — | — | — |
|
GAGCAGGATGGCCAGAACATATAATTGCCAAGGTCGTAAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:51a7872402c9
|
40 | — | — | — |
|
GTAATATTACAATCGTCGGTTTTACGACGTAATTACCACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:603010581b8a
|
40 | — | — | — |
|
AACAGTGTTGTGTAATTACGCATAGCAAAAGTCGTAAAAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:95ba22247fab
|
40 | — | — | — |
|
GGACAGCAACAATGCCCGATGGGTAATTAAATTTCACGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:240065af41b7
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCGTAAAACGTGTATGCGCTCACCCCTAGTGCCTGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:572551e229b8
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGTGACGTGTTCGAGACTCGTTTTTACGACCCACGGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:0950357b9a62
|
40 | — | — | — |
|
TTTATTGCTGTTTAATTAGGCCCTAACGTATCGATTAGGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:12bd3cada4e1
|
40 | — | — | — |
|
GCTTCTTTCGAGAGGTCGTAAAATTGTGGACACGATTCTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:cc9b1aa58501
|
40 | — | — | — |
|
GTGATCTTAAATTATTGAGCACGTTAAGTCGTAAAACGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:ba750e74f663
|
40 | — | — | — |
|
TTTTACGACCTGCCCATCTCGCACTGCCACCCTAAACCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:e138594e21f7
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGGTGCTGAGGCAATAAAAATGATGATGGTGTACTCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:c0e6403d98a9
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGACCTCAATAACCTGACGTGAGGGGTTAGTGCCCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:6266f86e60e4
|
40 | — | — | — |
|
GTAATGTTAGCATGTCATGAAGGTCGTAAAAGAGCTTAAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:13989c7db554
|
40 | — | — | — |
|
TCCATTTTACGACCTAGCGCTATCTGCCACATATGACACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:8a3d1365a908
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTTTATGATCCACTGTCTCACGTTAATGGTTTTCATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:a4b0ca4d2113
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGTCGTGACACTAATTTAATTACCTTTCCACCCTCCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:14d27b16ad9f
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCGTTTAACGAGCGCGTCCCAATGTTTATGGGCACGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:fd001ddcb684
|
40 | — | — | — |
|
TACGTAGTTACCGCTGTTTTATTACGGTTATTAACATCCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:8f4941ad5e6d
|
40 | — | — | — |
|
CCAACGCCCCCTAATTTTACGACCACTCTTAGCGCGTGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:7795d430b846
|
40 | — | — | — |
|
AATTAATATTTACGACCACTTCTGTGACGTATTACGATCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:30af1997eff1
|
40 | — | — | — |
|
GTAGCCGAACGCATACTTATTGGTGCCTGAGGTCGTAAAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:c7a0eaf3c03f
|
40 | — | — | — |
|
GCGTAATAAACGCAAATTTCATGTTAGGTCGTTAACTCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:a85963da65e3
|
40 | — | — | — |
|
CCTATTGTAAGTCGTAAAACGAGCCAGGGTCACCTACCGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:3acd61b78e64
|
40 | — | — | — |
|
ACCCTACCATAAAAGTTAATTACCATTTCCTGTTTATGGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:8dddc88946a1
|
40 | — | — | — |
|
CTCGCCGTTTACGACTTCCGAGAGCAGGTCGTAACACTAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_LMX1B:PRJEB66722:R3:93b7bf01fd96
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final