HOXD10_MEIS3
CAP-SELEX sample HOXD10_MEIS3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGCAGCTGACCTACTCATCACTGCTACTTTTTCAGCAATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:b2a128d71f88
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTCATTAGCATATTGAATACCGTGCAAGACTTTGTGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e62f016e7298
|
40 | — | — | — |
|
TCATTATCGATGCGGAATCGACGTACTTGCATATGAACCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:aa124813b8ca
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCGCCTCAATTGACCGACTCGACAAACGAACCATGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:a7929d77a5f7
|
40 | — | — | — |
|
AATAAGGGTCCTGTCAGGAGCAAAGTACTTATGAAACGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:51f5cd97d4cd
|
40 | — | — | — |
|
TGCTCCGTCCAACAAATTCTTCCTCAACCTGCTGTAACTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:27050010088c
|
40 | — | — | — |
|
TGTACTTAGTACTTAAGTGGAGTGGTTGGGATGCGATGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e6846abd296b
|
40 | — | — | — |
|
CTAGAGGCAACTGATCAAAAACACAGAAAAATTGGCATAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:d95bae9ab91c
|
40 | — | — | — |
|
TCTCAGGAAATAAGTAAAAGAGGTAAGAATGACCGATCCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e46615599c7b
|
40 | — | — | — |
|
ATATTAGCAACACTTCAAAACGTACCCCAGAAACCCCTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:d3ccd2bebe77
|
40 | — | — | — |
|
CGCGACATTTATGAGACGAGTAACATAAATGTCAATGGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:d44fd252bad1
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGTAATGCTGTCAATGCGTGCAAACGTGGAGACATTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:195b4d2117e0
|
40 | — | — | — |
|
CATCCTCGAAACGGTGACTACCCCACCTAACACTCGCATC
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:a62b25576b41
|
40 | — | — | — |
|
GCCCCCCCGCCACCCGACTGTCGACTCGCTGTCACGCGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:c6ffd5889bc1
|
40 | — | — | — |
|
AACTGCAATTCAACGGGATGCAATAATTACCTTCCGCAGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:d7b570a10592
|
40 | — | — | — |
|
TACTTCAAATGACGTACTTAGGACCGGATAAAGGGATATT
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:b81c269d8e93
|
40 | — | — | — |
|
CTGACAGGAGGCTCCTGTCACGGTGACGACCGATGATGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e451eb658bc7
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTGAAAATGACAAACGAGACCTAATATACGACGGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:3d26e40e7bac
|
40 | — | — | — |
|
CTATCAAATCTGTCACAATGCCTGAACACATGTCGGCAAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:0471f6568034
|
40 | — | — | — |
|
ATCATAAACCTGTCATCGGGTGTCGCAGATAACCTGACGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:fcf890096a62
|
40 | — | — | — |
|
CAAAAGGTCGTAAATATGTCATTCACGTTGGTACTGCACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e8c91c83f146
|
40 | — | — | — |
|
GACAACGTCGAAGGCTATGTCAATAGGTGACATGTCCTTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:646c09507a11
|
40 | — | — | — |
|
AAGACTTATACAGGAGGGCAAGGAACGTAGGGTTCTCGAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:4d0e63f18730
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCACGCCGCGCGACACCGACACACTGTCGCGCAACTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:ed5c09b4c252
|
40 | — | — | — |
|
GTTTGTCAGAGCTAAAGGCAGTGACAGCTTTACGAGCTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:c62e1f594608
|
40 | — | — | — |
|
GACCCCTGACGTTTTTACGACTTGCTGACAGTACCAGTCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e89af19074f1
|
40 | — | — | — |
|
GGCCAATATCGATGACAGACGTACCTCTGTCAGATAGCTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:8b76c4cd0a67
|
40 | — | — | — |
|
CTGACGTTCGACGCGTACGTGTCGTATAGATGACTGCATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:7897d4765dd2
|
40 | — | — | — |
|
CACATGACTGAGTTGACATCTGTCATACCGAAAAGACAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:3a752f690934
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTCACTTGTCACGTGCTTGACAAGCATTGCACTATTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:e09e18d9701b
|
40 | — | — | — |
|
TTGCACGTCACGCTTGTTAGTGTGACAGCTTTATTACGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:403d3aa08d58
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACAATTGACAACTTTATTACGCCCTCAACTGACAGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:a793e363b9d5
|
40 | — | — | — |
|
TTCAAACCTGTCACTACATACGACGTTCTTATCGGGCCGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:06645354d639
|
40 | — | — | — |
|
GACACGGGAATGCCTTAATGGAGACACACGTCACGCCATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:bb5fe1913fe1
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGACGTGTATCGATGACAGTACGTCGTTAAACTGTCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:2f9cb7d1db22
|
40 | — | — | — |
|
AAATAGTACATTGCATGCCTGTCACGGTGGCAACCAATTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:7bed6460dd5e
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCATAATACTGTCAAACTTGTGATGCCCTGACAACTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:f1f6312a4ccc
|
40 | — | — | — |
|
CAGCACCGGCAATAATACTGTCACGTTGTCAGCGTTGATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:50a022d654c2
|
40 | — | — | — |
|
ACTACGCTTGTCGTCGTAATAAAACTGTCACTACGTCACA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:9ab5476510b5
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAATCAAGCGGTCCATGACAGACGGTGGTCTCAATTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:a00e90025142
|
40 | — | — | — |
|
TCACCGACAATGCCGTGTCGTACCTGACAGACAATTCTGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:9a10ca821ac8
|
40 | — | — | — |
|
GTGACAGTAATATATGTCTCGACAGTTGACATCTACTCAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:55b392eddb88
|
40 | — | — | — |
|
GGAGTGACATTTTGACAGACAATGTTCGTACTGTCATAAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:7940990b3b14
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACCACTTGTCAGGCACACCAGACATGGCAGACAACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:54bce23b0594
|
40 | — | — | — |
|
CATGACAGGTAGTGTCGCAACCGTCAACTGTGACGGGTTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:8c9a0f7cc723
|
40 | — | — | — |
|
GCCTGACACATTTACGACCTGTATAGTGTCACCAGCGACT
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:6b13c636618a
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCTAGCAGGCGACATAAAATGCGTATGTGCTCTTACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:38f759bf8925
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTCAACGTATGACTGACGTATTTACGACCTTGACATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:d5b8716ae834
|
40 | — | — | — |
|
CGACATATTCCCGGTCGTACGACAAGTAGACGACACGTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:d2946b212767
|
40 | — | — | — |
|
GTGACTAAAGCGTGCAATAAAACTGTCATTCACAATGTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_MEIS3:PRJEB66722:R3:f7af75f5bc90
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final