HOXD10_RUNX2
CAP-SELEX sample HOXD10_RUNX2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGGTATGATAATGACCCCAACAAACCGCCACTTTTACGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:af92dfe856f3
|
40 | — | — | — |
|
CGGTAATTGCGGTTACTGATCCATATTTTATGGCCCACTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:889e9fae7f48
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGCGGTTTTATGCGGTTAATTTTTATGATCGGTGCGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:ec792f799ee7
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCAATAAAACCATTAACCACAAACCGCACTAACCCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:955345a3d385
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGCCCCACATTAACCGCAAAAGTCATAAAAGCGCGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:20de2b83fb40
|
40 | — | — | — |
|
ACCACCAAATACCGCATCGTAAAACACAGTAAACTACCCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:863702f871d7
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCAAATACCACAACCACACTATTTTATTACTTGGTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:72998ad32db6
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGGTTTTAGCGGTAATTTTTATTGCTTTTAAGACAGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:3ae517317cf5
|
40 | — | — | — |
|
CGGTGTGCAAACCACAGTAATTAAACGAGTCGTAAAAGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:17225294d98f
|
40 | — | — | — |
|
ATTTTACGACCTTGTGGTTTAATAATGTTTGCGGCTTTCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:a75def643b3e
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCAACCTTTTTATGACCGCGGTTTTAGCGGAGTAGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:45a6efcb861d
|
40 | — | — | — |
|
GCAATATAAAGCATCATTAATGATCCCGCAAAGTTGCGGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:46533c8aa25b
|
40 | — | — | — |
|
TAACCGCGGCTTGCGGTCACGTATTATTACTTTTATTGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:56dae71c2b83
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCAAATATTAAGAGGTCGTAAACGGAACCGCAAGCGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:f5d8e21ff274
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCTGCTTTTATTACCTTTTGCGGTTTTACAGATTCAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:092881481b4c
|
40 | — | — | — |
|
CTAACCCATGCCCATAAAACTCAAACCGCAATGACCGCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:11595079efe3
|
40 | — | — | — |
|
TAACCTAAACCACAAACCGCAACGCAAGGCCCTTTACGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:71fa0cda8b5d
|
40 | — | — | — |
|
GCCGAACTAACCACAACTAACCACACCCATAAAAAAACAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:c247497fcc31
|
40 | — | — | — |
|
CGTGACTGGTCTTGCGGTTTTAATGGCTTTTTTATGCGGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:50da250882d6
|
40 | — | — | — |
|
AAGCTATAAACTCCTTTTAAACCGCAGTCGTAACCGCAAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:ee729d616d73
|
40 | — | — | — |
|
CGGGCGGCACCGACAATAAAATTGACCACAAAACCCCAAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:f0629afe3523
|
40 | — | — | — |
|
AACTACGGTAACCCACAAGCAATAAAACGTAACCACACAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:56c69c8a8fca
|
40 | — | — | — |
|
CTCCAACTGCGGTTTTACGTGGTTAACATAATTACGACCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:02f8d8a1279a
|
40 | — | — | — |
|
GTGATTACTTGTGGTTTCGCGGTTAAAGCGGTTTATTGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:dfd4b8e3b182
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGTGACAACCGCAACTTACCGCTGTGCTTTTTATTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:151061b0b89d
|
40 | — | — | — |
|
CATTACATTTATGACCTGCGGTTGTGGTTTGGGGTGTCAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:c1106f4acac2
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCAAGTGGAGACCACAAATGCGGTAATTTTATGATCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:24f36e6ea6b4
|
40 | — | — | — |
|
GCAAATTTTTTTATGACCACCGCAATGATTTGCGGTTTTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:c5ed5b6ab7f1
|
40 | — | — | — |
|
ACCTCCGATTACCGCAATAAAAGGCAGAATAACCGCAAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:538e3b4fa16a
|
40 | — | — | — |
|
GGGTAATTGTGGTCAGCTTGTCGCGAAGTCATAAAAGTTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:e69b3a1df910
|
40 | — | — | — |
|
AAATACTTTTATTACCTACTGCGGTTTCAATGGTTTTCGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:a96955588b67
|
40 | — | — | — |
|
CTTCCTGCGGTTAGTTCCGCCACATTAATGTTTATGACCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:ad12c1b594d0
|
40 | — | — | — |
|
TTTTATATGCTTCATAAACCGCAAAGGGAAACCGCAATAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:6d3d57a4f50f
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCAAACGACCGCAAGCTCCCTCGTAAACCAGGAACGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:9305add5210d
|
40 | — | — | — |
|
ATGTCGTAATAAATTGCGGTTTGCGGTAGTGACAGGTAAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:63e2cca16ffc
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGTTTTACCCCCATCATAAAAATCCTAACCACAACTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:bee1abec0d4b
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTACATCCACGCCACAATCGTGTTTTACGAGCTTACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:724786ea6f2c
|
40 | — | — | — |
|
CCACGACCCCATAAACCCCAATCCTAAAACTTAATGACCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:5ab587e4d461
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTAGGCGCTTTGTGGTACTATTTTACGAGCCTGCTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:502e9e3acf45
|
40 | — | — | — |
|
GGCCGCAGACCGCAAACTTTTATGATTAGACCGCAAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:26451f0393c5
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTATAAACCGCAGACCACAAGCGGTCGTTAAGGTGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:84d3ae45ecb0
|
40 | — | — | — |
|
TGGGTTTAAACCGCCAAAACCGTTACTACACTTTTATTAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:1622f5324d3c
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTACATGGACCTGGGGTTATGAGCTGCGGTTTTATTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:1975ca92c879
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCGAATTTATGACTTATTTCGCATTGTGACCACAAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:b9b3b55378b7
|
40 | — | — | — |
|
TAGCTATAAAATAATGATTTGCGGCTTTTCTGCGGTTTCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:91715492650f
|
40 | — | — | — |
|
TGGGGTTAATTTTATTACACTTGTGGTTGCATTAAAGTCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:d655e8555d0d
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCGTATTTTTTGCGGTTTTATTACCCACCTTGTGGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:4a683c47fa84
|
40 | — | — | — |
|
GCCACAAACCCCAACTGCCCCTAAGGTAATAAAAAACACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:c8ff0f0389a1
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTTTTGTGGTTTATGACCGCAGCTTAACTGCTCTTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:56005453a91b
|
40 | — | — | — |
|
GGCAATTAATTAACCGCAACCGCATTATTACGCCAGACCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_RUNX2:PRJEB66722:R3:2c181dbf32a2
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final