HOXD10_TBX20
CAP-SELEX sample HOXD10_TBX20; Mixture-SELEX sample HOXD10_TBX20 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCACACCCACGCATGCGAAGCGCTAACACCTCGTAAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:5b55e9fb23a6
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTCACGTTTGAAGGTGTCGCCACCACCTCGTAATCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:ad66e6ec44f5
|
40 | — | — | — |
|
AGAACGCGTCAGAAACACCCTACGCACCGATCGTTATCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:fb3b16dfc06d
|
40 | — | — | — |
|
GATCGTTATCACACCATTAATCACCCCAACACCTCAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:c108c22e293a
|
40 | — | — | — |
|
TGCGAGTGACACCACCCAGTTCCCCGCACATCGTTAGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:e202d7ea7817
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGGTGTTTACGGGCTGCGAACCACACTTTAACACTAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:914879a13921
|
40 | — | — | — |
|
ACAACGCGCTCTCAATTAGCACCTAATTATCACCATCGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:cf9a0f55d2b1
|
40 | — | — | — |
|
TCGAGCGTTATCACGTCATAAAATCGGAGTGCCTAACTGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:6b2cc6f8d0e5
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGTTACCATGTTACGTGCCGCCTTCGCTCGTTATCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:c90ef8caa7ed
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCTCACGCTTACACGTCGTTAACACTTACATTGCACA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:ecb39ed475f3
|
40 | — | — | — |
|
GTTTGTCGGCTTTGCACTTTATCTGTCACATCGTTAGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:5d8ffecb7ac6
|
40 | — | — | — |
|
TACTCATGTCGTATAGAGTGTGATGTCACCTCGTAAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:ad5945a03886
|
40 | — | — | — |
|
AGACAGGTCGTAAACAGGTTTGCACTTTAACGTGTTACGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:b51e4cef9f49
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGGCGCTAACTTTCGCACACTAGCACCCCATAAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:fdb55e417fde
|
40 | — | — | — |
|
ACACCTCATTAATACGTCGTTAATCGGTACTAATGAGGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:bccb4092379d
|
40 | — | — | — |
|
CAGAGTGTGATGGCACATCGTAAACACTTCATTGGTGACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:864e29efee99
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTTAATGACGTGCCAACCCGTTTTATACGCATGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:667ab18b6ae7
|
40 | — | — | — |
|
TGAATCGATTTCTGCGGCCCGAAAAGGCGTTAACGAGGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:7259af132913
|
40 | — | — | — |
|
TTTATTGAGTGTGACATCTCACTTGGTGTCCTCACCTGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:72ee5c524f84
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACAATATCACACCCCATTAACACCTTTCTTCCACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:60bd83a28ec1
|
40 | — | — | — |
|
CACTGACGTGTTATTTACGACTTAACCACCACCATAGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:004d86fafcb3
|
40 | — | — | — |
|
TCACACGTGCATAAGGTGGCACGTAATACCTAATTAGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:9e6790e2c955
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCTCACAACACCTCATTAACACTTCCGAGTGTCGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:be05b596c154
|
40 | — | — | — |
|
CCATTTGACAGTCAGCGTGACACAACACCTCATTAACACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:add7991db4db
|
40 | — | — | — |
|
CCCCATTAACACGTTATTAACCTACACACCATAACAACGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:24346462cfbd
|
40 | — | — | — |
|
TCACCGTCATACATTAACACTTAATAATTCCTTCCCACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:d4b4f441cec5
|
40 | — | — | — |
|
ATTTAGCACATTTCCACCTCATTAACACTACTCGTAACAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:12034c272ceb
|
40 | — | — | — |
|
GGACCGCGCTTTACACGTTATCACCTCATTAACAGCTGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:df821424242d
|
40 | — | — | — |
|
AAATCCGTGTGATTCACACGTACTTAACACCTAATAATGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:1c5b3e788a2d
|
40 | — | — | — |
|
TTACTTGATAAGGTCGTTTGCACTTAATTAATCTAGCCAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:0394156ea418
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTGGTCGTTAAACACTGATGACGCACGTCGTAAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:9313878929e1
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTCGGTTTCCGCCGTCACTCAGACACCTCATTAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:129d51574190
|
40 | — | — | — |
|
CCAGTATGTGAGCATTGCAGGTCGTAAACAGGGTAACGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:e845718d7464
|
40 | — | — | — |
|
TAACACCACAAATAACACCTAATTAACACCTAATTCCTGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:07bca7fb7d8b
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGACAAGCTGTCAAATTAGCACCCAATAAACCATTCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:f94235dd5860
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAAGCCATAAAATAGGTGTGAACGAGATAAACACAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:fb2f7b5c8a57
|
40 | — | — | — |
|
GATTACGACGTGTTAACGACCTGGTTCAACACCTCCTGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:9e72aeef98dc
|
40 | — | — | — |
|
GTGATACCTTGTCGCTCTCTCTGCAGTTATCACGTAATAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:e7ab4619f548
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTGCGTTTCTCACACCTAATAAAATTACGACTTGTCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:da03255fdc7d
|
40 | — | — | — |
|
TTAAGCCTTCTTAGACATGTGTCTTCGCACGTCGTAAACA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:9c96fefdd22f
|
40 | — | — | — |
|
ATATTGAGTGTTAACGACCTTGCCGCGAGTCACCCTGTCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:9282ea77d597
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTCGAGATAATCCTCAGGTCGTAATCACCTAATTAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:a173b520fe0d
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGCCGTGATTTACGAGGTGTTTGATAGCACTTTCTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:6364fa3f8125
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGAGGTAACAGCACGGATGCCACCCCATTATCACCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:6aad273526cb
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTTAACACTCGCACCTTTTTTATGACCCACATGGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:7a5d5f2f45e3
|
40 | — | — | — |
|
ATAAGTCGTTTCGGCACCTCGTAAAAAGGCGTCAAAAGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:6cb93ef81d58
|
40 | — | — | — |
|
TGGTAACGCATTAACACTGAAATACTATGTTTACGATGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:fdaa872266e2
|
40 | — | — | — |
|
TGCCATTCGCACATCATAAATCACACTAAGGAGGTAGCTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:131fc419c1d9
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCCGAGCCGAGGGTGGCCATGAACACGTCGTTAACAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:09fbd4b74ebb
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCATGTTATGACGTGATAACGACGTAGTGTAAGTTAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX20:PRJEB66722:R3:5245f69b841b
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final