HOXD10_TBX21
CAP-SELEX sample HOXD10_TBX21 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAGCAGATTGGAAAGGTGCTACTTGGATGGCTGAGGTGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:319193047fb8
|
40 | — | — | — |
|
TCACATTGCCATAGGTGTGAAGAGGTTTCACACCTCCGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:84df17ed4741
|
40 | — | — | — |
|
CTACCTTGCAAGAAGGTGTTACGCTATTTTACGATGTGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:28a2636c9fbb
|
40 | — | — | — |
|
TACAGTTCACACCTCGTGCGACACATCGTAAAAATCGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:e09f62c8f3c3
|
40 | — | — | — |
|
TCACACTTTCAACGCCTCATCTTTTACGACTTCTCACCTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:12ccea2513d8
|
40 | — | — | — |
|
AGGCCGTTTTATGATGTGCGAAGGCGACAATCAAGGTGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:f4d0537e2642
|
40 | — | — | — |
|
GTAATCATAACGATGTGCGAAAACGAAATAACGAGGTGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:d0e0cfd77c2d
|
40 | — | — | — |
|
TCAAGGTCACACCTTTGCCAACGCGATTTACGAGGTGCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:288228af8c2f
|
40 | — | — | — |
|
GACACCATTCGCACCTCGTAAATTCGTTCGTCACCTTTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:757b4dcbd6a0
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTTTTTTATTACTTTGACACGTTACGGCCTATGAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:0800c4059f67
|
40 | — | — | — |
|
GGATCACAGCTTAGCGATGATAGGTGTTAACGAGGTGTGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:a5dd2cd57e73
|
40 | — | — | — |
|
ACAACCGAGGTGCGAAACCCATTAACACCTCCTTCAATCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:5031bccac80c
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGCGAAATCGCATTGCTGATGTCACACATAATAAACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:14fba6e3c5ac
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGTGAGGTGTGAAAAGGTATTTATGATGTGTCGAACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:6f899e97bcde
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGATAACGACTTTCGCACCTAAACGCAGAGACGTCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:3e7bd0ee982f
|
40 | — | — | — |
|
GTTGACACCTTTTTTATGAAGTGCGAAACGCTTCCCCGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:c23557a47eee
|
40 | — | — | — |
|
GGACACGTAGCGACAAGGTGTTAATGGCTATCACACTTAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:8ad0b5f6e33e
|
40 | — | — | — |
|
TTACACCTTCGCGCGTAAAATCACACGTCGTAAAACCATA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:bcbf74830836
|
40 | — | — | — |
|
TCACACCTGATTTAATGACCTTACACCTAACAACGAGGAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:7cfe0bebe8fc
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCGTTTTATGACGTGCGACCAATCCTAGGTAGGTGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:3ba772c18474
|
40 | — | — | — |
|
TTACGACTTTCACACCTAGACGTGCTCGTATCGCACCAGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:9f85b73cfbe7
|
40 | — | — | — |
|
TCACACATAATAAAGCTACAACGCGACACCTCACACCTCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:788ae9335bbe
|
40 | — | — | — |
|
TTCACGATTTACGATGTGTGAAAAGGTAATTGGCACCTCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:775d635130e9
|
40 | — | — | — |
|
TTGACAACCTCGCACCTCGTAAAACCTTTAACACCTCTGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:7ab8afffddc4
|
40 | — | — | — |
|
TGAGCTCGCGCAAAGGTGTCTGGTGGTTTTACGATGTGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:edfadacf6852
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCTTGCGAAGGTGTTATATACAAGTAACACCTCATCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:4b3d499f8aff
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCTGAGGCAGTTTTCGCACCTCGTTATCACCTTCCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:f1aa08e47a00
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGATGTGGGAACATGCATTCACACCTAATTACGCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:82c9dcc9337f
|
40 | — | — | — |
|
ATCGAGACCTAGGTGTGAATGCCATTAACACCTTTGAGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:667d3ee611a8
|
40 | — | — | — |
|
GTTGCTGGTGTTGTGTCGTAAAAAAGGTGTGATATCGTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:d122f871d0f3
|
40 | — | — | — |
|
TAAAGAGGTGTGAACTAACGTTCTCACCTACAGAGGTCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:123e92a89e34
|
40 | — | — | — |
|
TAGCACATCGTTAATAGATCTTCACACCTTTTTTGGTGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:7738df85a049
|
40 | — | — | — |
|
TAACACATCGTAAAAGCTACCACGTCATTCACACCTATTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:bc18bab667ac
|
40 | — | — | — |
|
CACACACACCGTTTACGACTTCACACCTCTATCAGCAACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:7969249d4854
|
40 | — | — | — |
|
GGTAGGCGACAGAACATTTTTATGATGTGCGAAGTTTCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:b01253dd68aa
|
40 | — | — | — |
|
TTGCACTTAATAAAACTGACTTCACACATTGATGCAGGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:529e7b2368a0
|
40 | — | — | — |
|
TATCCACGTCCATAGGTGTGAATGCGTTTTATTGACTGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:f5a0d6f5ed1a
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTGACACGTAATAAAAAGGATATGACACCTAATGATC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:e9d1b075052e
|
40 | — | — | — |
|
GAAAAAGGTGCGAATTAATTATTACGATGTGCGAAGTGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:e0ae27e1f710
|
40 | — | — | — |
|
GCAACACAGTTCACACATCATAAAATAGGGGTGACACGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:29c700fd90e1
|
40 | — | — | — |
|
GTTTAACAGTTCACACCTAATAAAACTCAGGTGTGAACGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:fd8b7ef398e9
|
40 | — | — | — |
|
ATATCACACCTGGCCTTAACGACTTGACACATCATCGACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:8ee6db65e61c
|
40 | — | — | — |
|
TGTACCGACCAGGGTGTGAAACTCTAGCGACACCTCCTCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:1273a590ec48
|
40 | — | — | — |
|
GCTATTTTACGATGTGTTAAATGCCTTAGCTAACGGTGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:d3f3883da2f8
|
40 | — | — | — |
|
ATTTACGATCTGACACCTCGGAAGAACTTGTTGACACGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:ad5081b35137
|
40 | — | — | — |
|
AACACATCATAAAATTACAGTAACACCTCTTGGTAGCCTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:bbccb19464e9
|
40 | — | — | — |
|
GCTCGTTTTTATGAAGTGTGAAGCCACCGTTAGACGTGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:9a1294fdf2be
|
40 | — | — | — |
|
GAGTTTAACGATGTAGTGTGACCGCAATTTCACACGTCGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:185a5c6d73f9
|
40 | — | — | — |
|
CGAAGGTGCTAGCCCATTTAATGAGGTGCGAAACCCCACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:07c34f1c4fc4
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGCATTAACGACGTGCGAACACGGTTCGTTGGGTGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX21:PRJEB66722:R3:6e094f8b70de
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final