HOXD10_TBX6
SELEX selection target
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTGAATGGGATTGTTAATTATGTAGATTGCATCGTTAATT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:824582c80874
|
40 | — | — | — |
|
GCTTGTGGTCGTAAATAACGTGTGAACGATGACACCTCTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:d0bb24754f9d
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTCGTAAAAAACGTGTTATTCCATGATTCACACCTTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:026e22a24b62
|
40 | — | — | — |
|
TCACACCTCTATTTACGACCTCGAAACACCTTAATCATCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:18d8e01acec0
|
40 | — | — | — |
|
GCAGGTGTCGCATTTGCCACGGATTTAACGACATAAGCTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:e5de6a86de65
|
40 | — | — | — |
|
TTTCCTAAGGAGGTGCTAGGCTGGGGCCGTGGTGACGCGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:25f5a5ef9fe7
|
40 | — | — | — |
|
AGCACCTTGACACCTTATTAACGATCGTATAAGGTGTTAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:e8ad63e68434
|
40 | — | — | — |
|
CGAGGTGAGATTTTAAGCACCTTCTTAACGACCATACTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:18b7960ee2ad
|
40 | — | — | — |
|
CTAGGACCACATCCCCCTCTGGGAACGATGCCGGGCGGAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:29669cae74fa
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACCGTTTTCATGACCCTCAACCCCACGCGACACCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:88d538c8b9d0
|
40 | — | — | — |
|
AAAAGGTGCGAAGTCGTTAAATCCAAGGTGTGAGAATCGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:d8f43b797c23
|
40 | — | — | — |
|
TAGGATCGTATAAAACGTGTGAAAAGTAGCACCTGAGCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:6b8e73961e99
|
40 | — | — | — |
|
AACACCGCATGGTCCTATGTTCATCGTCATTAAAAAGGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:0c09d83dc05f
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGCCATAAAATAAGGTGTTGAGAACATCAGGTGTGAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:e6aed35ccc26
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCCATAAAAAAGGTGACAATCTCGCACTACTCCGCCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:4876e34e043d
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTGTAATAAACGTACGTGTTTCTTCTAACACCTATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:152671c6f697
|
40 | — | — | — |
|
TACGATTTCACACCCCATTTCGACACCGTTTTAACGATGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:babe54d99c85
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCCGCGTGAGAGGACGATGGATCGTAAAATAGGTGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:fea85072aa39
|
40 | — | — | — |
|
TCTTCACACCTGCACGATCACAGTCGTAAAAATTGGTGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:9009fb610f32
|
40 | — | — | — |
|
TCGTCTCACGCCCTAACACCTATTTTACGACTGCTTTCCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:342dc9f7f08b
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTGCTAGGACGAATCATAGCTCGTTAAAAAGGTGCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:1ca77d2b88b3
|
40 | — | — | — |
|
TACGAAAGTCGTTAAAAAGGTGTTGAATCACGTGCCCCGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:042c42272a86
|
40 | — | — | — |
|
TGGAGCAAGGTGTGACATTTGACCCGAATATTAACGACAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:3f8562c9b0f0
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCACCGAAAGACTTACACTCAAGGCCAAACACCCGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:302246585582
|
40 | — | — | — |
|
TCGATCTAGGTGTGGAGCATTCACACCTTTTTTATGTGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:8e49cfc1aef1
|
40 | — | — | — |
|
AACACCATTTTTACGATGGCCTTAGGGTGTGAACTTACCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:786aa86ae13f
|
40 | — | — | — |
|
CCAAATGACATGTGCTAACACCTTTTTTACGACTTAAGGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:7eeda897b081
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTAAGGCGATTGCTCGTAAAAAAGGTGCCAACGCGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:e82fb01524dd
|
40 | — | — | — |
|
AAATGTGTCAGATGCTGTCAAGGGTAATGAAAAAGGTGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:8092cef7b76e
|
40 | — | — | — |
|
ACGTCATTTTTCACACTTATTTAACGACCATTCATCGTCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:eeb8dffe5bde
|
40 | — | — | — |
|
CTACGCAATTAACCAACGTGTGATAAATCACGCCCTAGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:b284191dbf0f
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGCCATCGCACCTGACACGTTTTTTACGACTTGCCAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:43d8d143163a
|
40 | — | — | — |
|
CTTCTATTGGTTGACACCTTTTTAATTGCTCAACGCTACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:86101c240e9d
|
40 | — | — | — |
|
TATAACGGCAATAAAATAAGGTGTTGATTCTCACACGACT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:f60508df88c3
|
40 | — | — | — |
|
CCTATGGGGTGTGATTCTCAGATGTAATTAAAAAGGTGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:981875b2715e
|
40 | — | — | — |
|
TTCATACGCTCGTAAATAAAGGTGTCAATGAACGTTGCTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:96b1389fd9b3
|
40 | — | — | — |
|
AGTTGAAGGTGCTAAATGTAACACTAAATCGTAAACCGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:d6aeb18263a0
|
40 | — | — | — |
|
AATGGCGTGCGATGGCGTCAAATTTCACACGAACTTTACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:4c03d7433e8a
|
40 | — | — | — |
|
CGAATGACTTGTGACACGCAATGTTCACACCCTTTTTATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:7ea94441e0fa
|
40 | — | — | — |
|
CGGAACAACCATAAATTAGGCGACATTTTTCACACTACGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:91ef456fa85f
|
40 | — | — | — |
|
GACTGATATCCTCTTTAATGACACCTTTTTTACGACTAGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:8c65d8df401b
|
40 | — | — | — |
|
TGACACCTTCACCATTCCAAATCCTCGTTAAATAGGTGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:b1ce5901f51c
|
40 | — | — | — |
|
GTGGGGCAAGCCTAACACCCAGTTTAATTGCTTCACACCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:5c257a910896
|
40 | — | — | — |
|
GAGCAAACGTGTGAAAGTCGTAAAGCGAGGCGTGAAGAAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:70aa7e1ab88d
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGCATCACACCTTGGCGCAAGTCGTTAAAAAGGCGAG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:d5c0a4b73741
|
40 | — | — | — |
|
TAACACCTTTTTTACGGCGTCGTCTCCCGCGCGCCCTGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:1e7fe9d97ffe
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGCTTCACACCTATTTTATGACGAGATCAACACGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:3eeea32be5d2
|
40 | — | — | — |
|
GGATCAACCAACTGTTAAAGTTTGACACCGTTTTTATGGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:e969ecd5cb71
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGGTCATAAATTGCATTCGCACGTCGTTATAGAGGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:6091e446a2be
|
40 | — | — | — |
|
TACTCTGCCGAAACTCGTAAAAAAGGTGTTAGACAACACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TBX6:PRJEB66722:R3:3a21297efef9
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final