HOXD10_TEAD4
CAP-SELEX sample HOXD10_TEAD4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATGCAACGTTGGAATGCATAAGGTCGTAAAAAAATACATT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:6cfa16a131f5
|
40 | — | — | — |
|
AGGTATGTCTGGAATGCCAGTTGGCATACTTCGATTCACA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:1503d613471f
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTATGCTTGGAATGTCAAAGTAATAAAAATGACGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:97f43f616d62
|
40 | — | — | — |
|
TCGAAATCGTAAATTCCCAGCATACCGCAAATACCAGGGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:8f63a7530924
|
40 | — | — | — |
|
TCCACCATTAACATTCTTTACATTCCGTACGTTCCTGAGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:f703122af73d
|
40 | — | — | — |
|
GAGAAGGGAGGAATTCGGATGCACATTCCTGACATACCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:ed2c6a172395
|
40 | — | — | — |
|
TCAGCTACGATATTCGAAGAATGTATGATTTTATGACCCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:1dbaeadf113c
|
40 | — | — | — |
|
GACTATGGAATTGGAAGAATGCTATGTAAATTTTATTACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:a18674460f13
|
40 | — | — | — |
|
CGGCAGCCGTGTGGAATGTAAAGCACGCTGTTTTTTACGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:96a2ddb90d4c
|
40 | — | — | — |
|
AATGGCATCTTGAGAATGTATGGAATGTGAGTATAGGATC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:258ae95de912
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGGAATGCCATCGATTTATTACTTATACATTCCTCCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:1540e9a72beb
|
40 | — | — | — |
|
CGCATAATTGGCATTCTCTGCATACCTTGTTTACCACCCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:fe92dece2b4b
|
40 | — | — | — |
|
TGGAATGTTAAGAATGTCCATAAACGACGGTAGTTGCAGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:4a3291862e6a
|
40 | — | — | — |
|
GAGTATGCAGCCTTTTTATTACCCACGCATACCTACATGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:38986c59a259
|
40 | — | — | — |
|
CCCTATAATTGCGCGTTTTATTGACATTCCACACGTGCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:ea49954e4033
|
40 | — | — | — |
|
CACATCACGAACGGATGCCTGGAATGCCCATTTTTATTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:cb6648010418
|
40 | — | — | — |
|
TTCGTTATGTAGTCTCACATACCGTACATTCCTTTCATGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:16ae4f583205
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTTTTACGATCTGCATTCTTCACATGCCACCGATTCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:66d6d0ef5394
|
40 | — | — | — |
|
TGGTATGTCTTGCGTCGTAAATTTACTGCATTCCTTGGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:9c257fd64aa9
|
40 | — | — | — |
|
CGCATCATTCCTAACATTCCAGACTTTTTTATGACCTTCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:0241b412b845
|
40 | — | — | — |
|
ACGACGATTGGAATGTAAGGAATGTAATTAGTTTTAATGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:5e396072cb5d
|
40 | — | — | — |
|
CGGAATGCGTTATTACATGCACGCTTTTACGACCTAGATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:965f4d8948cd
|
40 | — | — | — |
|
GGTGGAATGTAATTAAATGTGCTCCGGCATTCCAGCAATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:e804c836faf1
|
40 | — | — | — |
|
CCTCATTACATTCTTTCTGCATTCTTTGCATGCCTACGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:2eb9c6da31a1
|
40 | — | — | — |
|
TGGTCGTAAATTTGGAATGATCACTGAATATTTCGGATGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:24867a120fcb
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTATGGGATGCCGCGCATTCCAGGCTGGTTTAATTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:ec93cb5e606f
|
40 | — | — | — |
|
ATCTTACTGCATTCCATGCATACCTTACATAGCTTACGTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:be3c1b3a3bd0
|
40 | — | — | — |
|
CCCAGGACAATAAAATTTCCACATTCCAACCATTCCATAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:b5e7ad5dcfad
|
40 | — | — | — |
|
GAATGTCTCGACTATGAATTCCAGACATTCCATTCTCCCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:eb72e58a27cc
|
40 | — | — | — |
|
TTCACAAGAATGCAACCAATGCGAATCTTTATGACCCCCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:7eaeaa6ffedf
|
40 | — | — | — |
|
CTCCTTGAAGTCGTAAATACCGCGCATTCCATAGTCTCGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:d1f6ab693880
|
40 | — | — | — |
|
GTATGCTAATAATGTTATTTTTATGACCTTCTATGATCTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:4a9910b2dff7
|
40 | — | — | — |
|
GATATTACATATTAGCAATAAAAGTTGCATTCCTGAGATG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:d4c29dbfd178
|
40 | — | — | — |
|
GAATTCGTCCTTGCATACCTAACATAACACTATAAAAACA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:42ef592c419b
|
40 | — | — | — |
|
AACATCTATAATTTTACGACCTGTTGCATAGCAGAGATAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:f3dd4b974cb6
|
40 | — | — | — |
|
AGAATGCACGTTCACAACATTCCATTCATTCCAAGCTTTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:007badd8df91
|
40 | — | — | — |
|
GATTCCAGACATTCCTTGCATTCTACGCACATAACATACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:c627e18aeeb5
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGAATGTGCGTTTTACTACATTTTGCATACCTATGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:ffd28384b3be
|
40 | — | — | — |
|
GTATGCAGTCCGCATACCGTGCATTCTTGCGCACTGCTTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:c833f0701818
|
40 | — | — | — |
|
CACATACCTTACATTCCCCTTAAAGGCCATAAATTGCAAT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:009a0b48237a
|
40 | — | — | — |
|
CGAATGCCGCACATTCCATGCATACCACTACCCTGCTCCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:3ee821f9d17d
|
40 | — | — | — |
|
TACTCAGTACCGCTCTACAGCATTCCTGAGTTTTTACGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:1c03c5e60f8b
|
40 | — | — | — |
|
AATGCCTCTCTGCTCATTTACGATCGCATTCTTCACGTTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:7977093f05d5
|
40 | — | — | — |
|
CCCGACACATTCTTAGCATTTTCCGAATAACTGTGCTAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:92d071cc12cf
|
40 | — | — | — |
|
AAACGCATGCCCTGCATTCTTCTAATTCCAGCACGCATAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:16fd720415bc
|
40 | — | — | — |
|
ATAGTGAAGCATTTTAATTACCTTAGCATTCCGATCATGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:b92f72623634
|
40 | — | — | — |
|
CATACCATTCACGATTTTAGGCATTCCTAACATACCTTTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:0b7c82b99f3c
|
40 | — | — | — |
|
GAATGCAGTTTGTCATACCGATCACATTCCATTGCTTTTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:0f44151b9275
|
40 | — | — | — |
|
CGTCGGAATGCAGGATTTTACGATCTGAAACGTTATTACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:3c8b01a71e81
|
40 | — | — | — |
|
AGGAATTCGTTGGTACGTATGGAATGTCGCATGTTGCATT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TEAD4:PRJEB66722:R3:e9c1c45e8903
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final