HOXD10_TFEC
CAP-SELEX sample HOXD10_TFEC · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGCCCGGCATATCACGTGATACTGCTATCACGTGTCAGCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:a4a9f24da4a5
|
40 | — | — | — |
|
CACTTAACGAGCCAGCCCGGATAAATAAAAGAACGATACC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:40cdb6667858
|
40 | — | — | — |
|
GCTCTCCGCGTTCTCCTCCTCTTCGTACGTACCCTTCCCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:b131a480aa9e
|
40 | — | — | — |
|
CTGCACGATGTTCCCTGCTCACCCTTGGCACGTGCCCGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:f966ebd26f44
|
40 | — | — | — |
|
GCATCAGTACACGTGACACCAACGTATGAATCACGTGCTT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:fd752e208b7c
|
40 | — | — | — |
|
ATAAGCACGTGCCGACTACACGTGCGGCCTATATCACCGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:f73927649394
|
40 | — | — | — |
|
TTGGATATCATGAACTACTGAAAAATATTCCCTATTCTTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:9caed1a56204
|
40 | — | — | — |
|
ACACCACGGGATACTCACGAGCAAGGTAATTGGCACGTGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:1031be77cc18
|
40 | — | — | — |
|
CGCCACCCCGTACCCCACATGACCCTACGGTCATGTGCCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:0460f0dd77f2
|
40 | — | — | — |
|
CTACCGCGTGCATCGACACCTGCGCACGCGGACACCGCTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:c4f3f7a26a9f
|
40 | — | — | — |
|
TCACGTGATTTTGCATACACGTGAGGACCGACACCAGGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:f2ccb4850440
|
40 | — | — | — |
|
CTCTGCTGAGCCCTCACGCGTTGACCAGCGCGTTGTATTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:f0bf957e4194
|
40 | — | — | — |
|
CTCTGCATCTTTCGCTACTGTGTCACGCGGCCACTTCCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:5bb27139f94d
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGACACGTGATACTATCTGACACGTGGTGACCGTGAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:ba478a23d175
|
40 | — | — | — |
|
GCTTGGCAGATCAGTACCTCACGTGCTCCCACAGCTTACT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:ea05b4bbd46f
|
40 | — | — | — |
|
CCATATACCTTCCTTACTACACCTGTATCCACCCATCGCA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:e200a6a86395
|
40 | — | — | — |
|
ATGGCAACTCAGACCCGCGTGCAAGCCGTCACGCGGGCAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:e6251bcb37ee
|
40 | — | — | — |
|
AAACGATAAACCCCAATACGTTACATCATAATGGCGATGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:3dd441fe3d74
|
40 | — | — | — |
|
GTCCACCTCGCGTGCGCGCCCCATGACGCCACGTGTTCCC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:870be2897df2
|
40 | — | — | — |
|
ACCACAATGTACCGCCACACGTGTACCCCTCACACGTGGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:f61616d61262
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCATTCCATCCCTTCCGCACCTTGCGCTAGTCGTTTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:e62bec1f724e
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGGTTGCACGTGCTGCCTCTTATGGTTCCACGTGCCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:9115e3208ad3
|
40 | — | — | — |
|
TTAACTCACGTGCAACACCAATGCGCACGTGACACCCAAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:e1d56fa081af
|
40 | — | — | — |
|
CACGTGGTCATGCACGTGCACATTTAACCTCAGTGTTGGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:b4509cf72a44
|
40 | — | — | — |
|
CTTGTCCTCGTTACTACCCTATCCTGTCTGTTTCCGTGCG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:36ca5aedda2d
|
40 | — | — | — |
|
CATCCTCGCTCATTCCTGTTTTCACCTTTACTCCACTCTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:31db9d8f3773
|
40 | — | — | — |
|
ATGGGCGTGGATATCACGTGGTACTCCCACGTGGTCGATT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:476a08f5a5ba
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCTCCTAATTACCGCCACTCCTATTTTCCTACTTGAC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:1bf2d6fbfec9
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCACGCGCATGTTGTTGTTTCACGTGACTTACCAGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:725a30083b67
|
40 | — | — | — |
|
GAGACCCACGTGTCGCTTTGTTCAAACACGTGTGCTTCGA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:52768a0867ac
|
40 | — | — | — |
|
AAATGACACGTGCCCTTTGGCCAGCTTGGTCACGTGATTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:5dfcea3a9dbf
|
40 | — | — | — |
|
AACCTGTTACATTCTCCGTAGGTGCCTGCGCATCACATGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:38808a0e9c87
|
40 | — | — | — |
|
TTACGATGACGTCATAAAAACGTTAGTTTGATAGTTTTTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:5edb8e7b2ab3
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGGCGCACGTGCTCGTATCAAACGTGCGCGAATCACG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:3366c07d013c
|
40 | — | — | — |
|
ACCATCCTACACCACACCCTCACGGCATCACTGACCTTGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:a915007868ce
|
40 | — | — | — |
|
CTTTCCCACGTGTCAACCGCGCGTGCTCTCTTCTTTCGTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:dc713e1a1904
|
40 | — | — | — |
|
CTTTTTCCGCATTTGATCACGTGCCACAACCGCACGTTGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:d0cc3f8d49c8
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTCCTTGCGTTAATTGTCTTTCCTTCGCACGTGGAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:56bca666c987
|
40 | — | — | — |
|
GTAATCACGCGCTCTGTTATGTATGCGCGTGATTCAAAGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:b74b3f021c5a
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCTGGTACACGTGCCACAAGGGATCCCCCCACGTGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:ccfeccbf5a1b
|
40 | — | — | — |
|
TGCACCCTCTCTGCACCTCCCTTTCGCTTCGCCCTCTGTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:1dc238e721e0
|
40 | — | — | — |
|
AGTCCCGCCTGCCCTTCCTCTAGTTCACCGTTCCCTGCTG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:478b27253e70
|
40 | — | — | — |
|
CTACCTCACACGTGCGCACCTTGCGTACCCATACACCCGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:b1b604e8034f
|
40 | — | — | — |
|
CATGAAACCATTATGACAGAGAACCTCTCTCACATGACGT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:c96080519505
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCATCTTTAGTCCACATTAACGATGTCCTTGTCCCTC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:72904b6cf11c
|
40 | — | — | — |
|
ATACTCCTCTTCCTCCCCTAACCCTCCCCATCACGTGAGC
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:e1d63e3ce5f7
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCACGTGCATCTACGCGCGTGACTCTGATCCATAGTA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:2186877ce000
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGTGGGAGAATAGCGACACCCCTCACGTGTGGTGGGG
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:5353644a4d63
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGCTATATCCCTCTCGCATATTCTTTCGCCCCCTGAA
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:5196882a5b4a
|
40 | — | — | — |
|
GCAGGCAGTAAATAAACACGCGCGTGAGCACACACGTGCT
PANAPTA:P28358:HOXD10_TFEC:PRJEB66722:R3:947c8e9a6a1f
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final