HOXD1_ISL2

CAP-SELEX sample HOXD1_ISL2 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
CGGCGGCAATTAGGGCTGCCTAATTGCCTCATCACTACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:cff3843720ee
40
ATTAGTGCGACCACTAATTAGCGACACCGCACTACTGTCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:b209fa416329
40
TCAACGCGCGTAATTAGGGCCAGCTAATTACGCATACGTG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:0fd850dfe34a
40
TCTCGCATCGTAATTACGATTCTAATTACGCTAACGACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:2fd39c16ce63
40
ACGCATCATTAGCCTGCAACTAATGAGGAAATGCATCAAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:2032915c4a27
40
CAGCGTAATTATCCCAGCATTTAGGATAATTAGCCTGATC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:5b6d63868d9f
40
GCGACCTGACACGTTCAATTAGCCTTCGCTAATTGCCTCA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:ce9feb89ebe2
40
ATTAGGTCAATTAGACAATTTCCCCTAATGACTTCACACT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:419e8ccf64ef
40
CTTAATGATCACCACAATCATTAAGGCCGTCGGACACCAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:16b71f546e60
40
CCGTAATTAAGATTAGCCTGACCTTAATTACAGTATCGCG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:497e01dd2b52
40
TCGCTAGTCATTAAATGAGTAGATTGGCATGGTCGAAAAG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:37006f8c114b
40
TCCAGGCTAATTACCCCCACCAATTACAGTAATTAGCGAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:d20505e93f69
40
CACGCACGACACGCGCCTCCTCCACGTCCAAGTGTCGCCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:bda7d4e5bc29
40
ATCCACGCATTGTGCAATTAATACCTGAAAAACGTTACGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:51a62cbc52ad
40
ATAACACGCTCTTAATTGACCTTAATGGACTCACTACCGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:3fd0c28cc838
40
ATCGCCACGCCGGGCGAGTAAGTGGACACTATGGCCTGCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:6476cbcc8b53
40
AATGCCTAATTTGTTTCTACCTAATTAGCACAGCAGTCGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:f3a7f24e7435
40
ATGCATCAATTAATTTCCCTAATTGACGACGAACTCGCAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:34c05db6f1d6
40
ATTAAGTGCACTTATAACCATTAAGGGCAATTCCCGCTTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:5f674939372f
40
TGCACTAATGATGACGCACTTCTAGGTCATTAGCGGTAAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:2916c3174738
40
AGACACATCACCTTGCGTTAATTACGGTCGACAACGTCCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:bb9caff9b8f2
40
CCCGCACCTCGCCTGACTGACTGTCCCCCATGACGTCCGA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:94f0c5eee5ee
40
ACCACCGCAATTAGCACTAATGGCACATACCACCATTAGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:4a7d913ccf2c
40
ATGGTGCACCCCCCAATTAATCGCATTAGCGTAATGCGAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:603fcbc3612f
40
CAATTACGCACCTTATTTAGGGTAATTGCCGCAAGTTACG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:ad4c8321727b
40
GCGCCAATTAGCATGGCCTAATTACACTAAGCTGTGGCAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:609b8966dc62
40
CCTAAATTGATTAGCCTAAATCAATTAGGTGCAGCGTAAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:1357849c20dc
40
CCGCCAACCTACTCCCGGCCATTCTCAGCGCCGTAAACGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:63f16a08e138
40
TCAATCATCAAGCTGCCTGATGACGAACACCACACGGCGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:300e428b8610
40
CTTTCCATTAACTCGTTCCCTCCTTAATTGAATTACACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:696d9e2d96f1
40
GTGCCCATACCGCATCATTACGTACATTAATTGCAATTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:72c676bee6eb
40
CACACCGCTAATTAGACTGGTACCGTAATTAGGCAGACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:b48c9736abb6
40
ATGGATTCAGCAAAGGACGATGAATCACATTAGCCTAATT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:6100b077673d
40
CCTGATCATTAGCCTAATTAGGCCCTATTAGACCTGCACT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:96ee4e5bdd84
40
AGTACGTTAATGAATGTACGGCCATCGACGTAGCACAAAG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:2f0ee760cc5d
40
ATCCCTCCTCTCAGGACTCACCGCAACTTACCTCCTCCCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:c7935d8925cf
40
ACAATTAGCCCTTTTAGCTAATTGCTGACACATCCCTTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:087d48af7e0f
40
ATACACAATTTGCGTGCTGTATACACCTTGATCACCCACT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:a7a309e2b150
40
ATTAACCAAGGCATCGTGCTAATGTACCTCGTTACGAAGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:ca82d51749a1
40
CCCCAATGATCCGTAATTGCACTTAACAACAGCGCATGAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:4d32d8cbc8f7
40
CCATACTTACGGTGCCAAGTGGCCTCATACGCACTCGCAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:31522482fb25
40
ATGACGTTTAATTACAACCAAATCGGCTAACAGCGGATGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:c75d4b8b5318
40
GACGACATGACATCAACGCAAAACTAATCTCTCCAATTAA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:8cbca193851a
40
TGTCCATCCATCCGGTAACTAAGTGCAATCTGATATACCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:5414d4bf312c
40
ATTGCCTGTAATACACTCTAATTACAGTACCTCATCCCAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:c70d9470c78c
40
CGTCCGCGAATGTTATCGCGTGCAGCGCGTGAAAGCATGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:121d8254460f
40
CGCAAGTAATTGTCCAACGAATTACGCCCCCATTCTGATC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:98e4daf7d0ed
40
CTGTTACATTAATTAATTCCTTAATTAACTCGACATCGCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:1928baa92b24
40
ATGGACCACCATTTACCGCGCACTCATGCCCCTGTTTGGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:1a99dfaf6aaa
40
CATAATCAACTTGCAATCACACTTAATTGCTGCTAATTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_ISL2:PRJEB66722:R3:13ddc1b0402f
40

SELEX rounds

R3 ·final