HOXD1_TBX20

CAP-SELEX sample HOXD1_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
ACATTCATTACTACGCAAATCGCCTCCTGCGTTATGATCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:4add1fad79a4
40
CACATTCGCACGTTCCATAGCGCGAAGGTGTTAATTAGGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:124db0103fa7
40
TCTACCAATGAAGCACCCTTAATTAGCGCGTAATCACCTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3d5f75e4f58a
40
TTGACGCATTTGCACACATTTAATTACGTGTTGTCGCGTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:e4169cebeadc
40
TGGTTAGCACGATAACACGTAATTAACGCACTTATGATGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:e8252c233ed2
40
CTCGTCAAATTAGCGTGTCATCGTTAATTACGTACAACTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:4b0580a96fa4
40
CCTGTCGCAATTAGGGTGCGATATGTCTAATTAGGTAAGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:cb512081d599
40
TGTGTTAATTACCCTAATGTGTGATCGTCGTTGCGATCTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:f1d6ea3a5523
40
CTTCGACACTAATTAACGATTTAACGCGTAATTAGCCAAG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:462f758c241e
40
TAGCGCCTCATCGGCACTGATTGGTGTAATTAACGCTAAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:2f4ab524b7e8
40
CTAACAACTACTCGTTAATGACGCCTAATGGTGTGATGAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:751593e38aeb
40
ATCACCTCACTTAATCACAAGTTGATTGGCTAATTGACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:924634d1bf13
40
TAGGCAGGTGCTAATTAGCTAATGATGGTGATTTCGCGTG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:63ab7e81db70
40
CAGGTATTTCTTAGAAACGGTTGATTTTTGGTCTCGTTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:710ca181dc76
40
TTGCTAGGCAGCTAGGTTGTTAAGACATGACGTGTCATAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:5e4bd578a260
40
GTCGATAAGTCGTAAGTGCTAATGTGTTAATTAACTCTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:0c0ffcd71ca2
40
TTAACGTTGTAACGAGTTGCGAGGTGTTAATTAACGACAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:61458b5b37d6
40
TGGTGATTAACAACTAATTACGCCACATTCACAGGTGGGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:1a84e1f7f9ef
40
CTTGCTAATCGATGTGCTAATTACAAGCTTGCAGATGATG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:5cb106bab104
40
GGCGCTAACGAGAGAAGTAATTACAACACGATTACGACTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:2f976a373096
40
TGTGCAATATGCTCACACTAACACGTAATTACGTAATGCA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:d782219ee20d
40
CCGCCACCTGTCGCATCAACACATATGTCCCATGTGTTCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:15f5838bee3e
40
TCGACTCAGTAACGCTGTAGCACTTTAACACATACCTATT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:baa8214cd4a1
40
TGAGAACGTGAGTCAACACCCCTAATTGGTGTTAATTACA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7b5489918a7d
40
CTCATTAACAAATGGTGATGATCACAGCTAATGACACCCG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:66a8fee3a923
40
GTGCACATTCACGCATCATTAGGTGATTACACGCCCTTCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:2096e687419e
40
TTAGCGCCCAATCACATTAACAATGGCGCAATGGCGTTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:a76ae35e3d4b
40
GGTGGAGTTAATGACTTAACGACATTACGTCACGCGCAGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:77deb19316e5
40
AATGACACATGTTATAACGATTTGTGAAATAAGCCCACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3a91bd918b25
40
TATTGACACCATGACACTGATGCTGATCACGTAATGAGGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:0616b25cd54e
40
TGAGTTAATGCGTTAATGACGGTTTCATGTACCATTACTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3f79c6bf35a7
40
ACTGATAAGGTGCTAATGCGTTAATCGGTGTTAAGTGACA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7c6add3c5136
40
TGACAGCTTAACGGCCTTAATTACAGGTGATAATGATATC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7cf01887cbc0
40
TAGGCGTCACACCACCCACTAATTACGTCATTAGCGCGAA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3ed2213387c6
40
GGGGATCATTCCGTCACCACGTGCGCCACCCTGTTAAGGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:34c648954438
40
CGTGTAGTCACGCACTACGCTGATCATTAGGTGATTACCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:efbc6cd7c245
40
TTACACATCGCTAAGTGTAATTGTGCGATAACGATAATCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3b963bf933e3
40
CCACACATTAATAATTACCATTTGCGTTAATGTGCTAATC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:8ac9f81cc338
40
TGCGGCAATTAACACGCACTAATCCGTCATTTACGTAATT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:c0781226c96b
40
TTTGTCACAACTAATGTGCGATTTAGCGTGATTACACAAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:5ce430820243
40
TGCGCTATCAATCAGCGCGTCACTTACACGTTGATTGCCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:4b673ff61428
40
CTCGTTAATGCCGCCTGTGTACGTGATAACGAGCTAATGA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:b42aceac1f30
40
GGTGCTAAATCGCTTTTCGATTAGGACACCTCATCAGTTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:da1d1786527f
40
ACACGTGCTAAGTCGTTAATGACGATACCTAATGTGTTTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:12809c9855ca
40
GACACACTCAGTGTGATTGCCACACCTAATGTGTTAATTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:b4530688e7b8
40
GGCGTAATTACAAATCAATTATCACCTCGACATCGCCTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:9b2c068465d4
40
AATAAGTGCCAATTAACGCATTAGCACCCTTTCTGTACGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:c07877258ce5
40
TGCGTGATTAGACTACGTTAATTAGCGCGCTGACAGTTTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:b90474ebf81d
40
CTCGATAATTAGCTAACTCGTTAATCCTAGTCTCACAAGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7c235a704579
40
TGCGTCATATTGCTTAATTGACGTAACGACTAATTGCCTG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:d2fa8eb5c0c6
40

SELEX rounds

R3 ·final