HOXD1_TBX20
CAP-SELEX sample HOXD1_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACATTCATTACTACGCAAATCGCCTCCTGCGTTATGATCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:4add1fad79a4
|
40 | — | — | — |
|
CACATTCGCACGTTCCATAGCGCGAAGGTGTTAATTAGGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:124db0103fa7
|
40 | — | — | — |
|
TCTACCAATGAAGCACCCTTAATTAGCGCGTAATCACCTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3d5f75e4f58a
|
40 | — | — | — |
|
TTGACGCATTTGCACACATTTAATTACGTGTTGTCGCGTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:e4169cebeadc
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTAGCACGATAACACGTAATTAACGCACTTATGATGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:e8252c233ed2
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTCAAATTAGCGTGTCATCGTTAATTACGTACAACTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:4b0580a96fa4
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTCGCAATTAGGGTGCGATATGTCTAATTAGGTAAGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:cb512081d599
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTTAATTACCCTAATGTGTGATCGTCGTTGCGATCTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:f1d6ea3a5523
|
40 | — | — | — |
|
CTTCGACACTAATTAACGATTTAACGCGTAATTAGCCAAG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:462f758c241e
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGCCTCATCGGCACTGATTGGTGTAATTAACGCTAAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:2f4ab524b7e8
|
40 | — | — | — |
|
CTAACAACTACTCGTTAATGACGCCTAATGGTGTGATGAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:751593e38aeb
|
40 | — | — | — |
|
ATCACCTCACTTAATCACAAGTTGATTGGCTAATTGACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:924634d1bf13
|
40 | — | — | — |
|
TAGGCAGGTGCTAATTAGCTAATGATGGTGATTTCGCGTG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:63ab7e81db70
|
40 | — | — | — |
|
CAGGTATTTCTTAGAAACGGTTGATTTTTGGTCTCGTTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:710ca181dc76
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTAGGCAGCTAGGTTGTTAAGACATGACGTGTCATAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:5e4bd578a260
|
40 | — | — | — |
|
GTCGATAAGTCGTAAGTGCTAATGTGTTAATTAACTCTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:0c0ffcd71ca2
|
40 | — | — | — |
|
TTAACGTTGTAACGAGTTGCGAGGTGTTAATTAACGACAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:61458b5b37d6
|
40 | — | — | — |
|
TGGTGATTAACAACTAATTACGCCACATTCACAGGTGGGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:1a84e1f7f9ef
|
40 | — | — | — |
|
CTTGCTAATCGATGTGCTAATTACAAGCTTGCAGATGATG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:5cb106bab104
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCTAACGAGAGAAGTAATTACAACACGATTACGACTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:2f976a373096
|
40 | — | — | — |
|
TGTGCAATATGCTCACACTAACACGTAATTACGTAATGCA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:d782219ee20d
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCACCTGTCGCATCAACACATATGTCCCATGTGTTCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:15f5838bee3e
|
40 | — | — | — |
|
TCGACTCAGTAACGCTGTAGCACTTTAACACATACCTATT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:baa8214cd4a1
|
40 | — | — | — |
|
TGAGAACGTGAGTCAACACCCCTAATTGGTGTTAATTACA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7b5489918a7d
|
40 | — | — | — |
|
CTCATTAACAAATGGTGATGATCACAGCTAATGACACCCG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:66a8fee3a923
|
40 | — | — | — |
|
GTGCACATTCACGCATCATTAGGTGATTACACGCCCTTCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:2096e687419e
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCGCCCAATCACATTAACAATGGCGCAATGGCGTTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:a76ae35e3d4b
|
40 | — | — | — |
|
GGTGGAGTTAATGACTTAACGACATTACGTCACGCGCAGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:77deb19316e5
|
40 | — | — | — |
|
AATGACACATGTTATAACGATTTGTGAAATAAGCCCACAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3a91bd918b25
|
40 | — | — | — |
|
TATTGACACCATGACACTGATGCTGATCACGTAATGAGGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:0616b25cd54e
|
40 | — | — | — |
|
TGAGTTAATGCGTTAATGACGGTTTCATGTACCATTACTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3f79c6bf35a7
|
40 | — | — | — |
|
ACTGATAAGGTGCTAATGCGTTAATCGGTGTTAAGTGACA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7c6add3c5136
|
40 | — | — | — |
|
TGACAGCTTAACGGCCTTAATTACAGGTGATAATGATATC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7cf01887cbc0
|
40 | — | — | — |
|
TAGGCGTCACACCACCCACTAATTACGTCATTAGCGCGAA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3ed2213387c6
|
40 | — | — | — |
|
GGGGATCATTCCGTCACCACGTGCGCCACCCTGTTAAGGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:34c648954438
|
40 | — | — | — |
|
CGTGTAGTCACGCACTACGCTGATCATTAGGTGATTACCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:efbc6cd7c245
|
40 | — | — | — |
|
TTACACATCGCTAAGTGTAATTGTGCGATAACGATAATCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:3b963bf933e3
|
40 | — | — | — |
|
CCACACATTAATAATTACCATTTGCGTTAATGTGCTAATC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:8ac9f81cc338
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGCAATTAACACGCACTAATCCGTCATTTACGTAATT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:c0781226c96b
|
40 | — | — | — |
|
TTTGTCACAACTAATGTGCGATTTAGCGTGATTACACAAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:5ce430820243
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTATCAATCAGCGCGTCACTTACACGTTGATTGCCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:4b673ff61428
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTTAATGCCGCCTGTGTACGTGATAACGAGCTAATGA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:b42aceac1f30
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCTAAATCGCTTTTCGATTAGGACACCTCATCAGTTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:da1d1786527f
|
40 | — | — | — |
|
ACACGTGCTAAGTCGTTAATGACGATACCTAATGTGTTTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:12809c9855ca
|
40 | — | — | — |
|
GACACACTCAGTGTGATTGCCACACCTAATGTGTTAATTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:b4530688e7b8
|
40 | — | — | — |
|
GGCGTAATTACAAATCAATTATCACCTCGACATCGCCTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:9b2c068465d4
|
40 | — | — | — |
|
AATAAGTGCCAATTAACGCATTAGCACCCTTTCTGTACGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:c07877258ce5
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTGATTAGACTACGTTAATTAGCGCGCTGACAGTTTA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:b90474ebf81d
|
40 | — | — | — |
|
CTCGATAATTAGCTAACTCGTTAATCCTAGTCTCACAAGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:7c235a704579
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTCATATTGCTTAATTGACGTAACGACTAATTGCCTG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX20:PRJEB66722:R3:d2fa8eb5c0c6
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final