HOXD1_TBX21

CAP-SELEX sample HOXD1_TBX21 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
AATTGATTTGCTTCGAAGGTGTCGGAGGCTAACGAGGTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:6e41cb282a62
40
TTAACACCCAATTAACGTGTTCACACTTCTACGTCTCGTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:52662576503e
40
TCACGTAATTGACATGTGTGAAACTCTAACGAGCACGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:159d51284fb1
40
ACTCACCTTCACACCTCATTAACATTTCGCACCTAAACGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:13dd614b40ba
40
TCGTCACTTCACACCTCATTTAGCACATTGCACCTTCCCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:75dc76cdc79d
40
TTTCACACTACCTAATTAGGTTTTCGCACCTTCCAATACC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:2877f210a554
40
CCGCATTATTGATGAAGTGTTAATCAGTATGCCGATGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:f394a93c798b
40
ATTATGTGAGATCATTAACACCTGCAGCGCAGGAACGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:c03023f58f3b
40
TTTTACGCAATTAGCACCTCATCACATTATCACACCCCGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:b96e0003773e
40
ATCGGCTCACACCTTTAACGACACCTTGACACCTATGCTT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:4492b99660bd
40
ATTACCGCCCCAACACCTCCAAGCACCGTTTCACACCCTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:29d91c9b908e
40
TCCATTACCAGCAATTAACTCACGACACCTCGTAAGGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:e0e8d0bd70fa
40
CCAACACCTCGTCATATCTCATTAACACCTTCAGTCCCGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:5d8e8c93f581
40
ATTAGGTGTTAACTGCACAGCAGGACCCATTCACACCTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:7087344b362e
40
TTACGTATCACACATCATTAAGAACATCACACCTTCCGAA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:fb26dd54a43a
40
GTGAATTAGGTGCAAATGGATTTCACACCTCATGACTTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:bf3a41832b0f
40
ATACCGCCCTTCACACCTAATTACCATTCACGACACCTCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:1efc1fbe97a6
40
TTCCACACCTAATCAACACCTTACACACCTTCGTCCACTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:5c127cc293fc
40
AAACGATCTAGCTAGACGTGCCACCTTCCTAATTAGGTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:2eeb7a3fb3ad
40
ATAAGCCACACCACTAGGTGCGAACCTGCTAATTACGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:6ab9bc3ece09
40
ACACATTACATAATTAGTTCACACCTCTCGTCGCTTCCTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:3f079449ac0a
40
CACAATTAGCACCTAACTAATGACCTCACACCTTACTACG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:6a39500e86f9
40
CGCCCTTAACGAGGTGTTAATAGGTCTCACGCCGTTGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:0248528ce9e8
40
CCTGGATTTCACACCTCATTAATCGCCGTTACACCTTTCG
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:aa848a159932
40
TTATCATTGCGTGTAATTGTTCACACCTACTATCACACCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:4c2ab5e9a2e9
40
TTAACACCTAATTGCTAATCATCGTCTGAGCGACACCTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:9844b4afeadb
40
ATTACGGGATTGCTAACGATTCACACCTAGGCCCACGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:f1ea9c972741
40
TTTCACACCCTATCACATGCCATTAGCACCTCGGCTACGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:779ee831998a
40
TCAGCCTAATTGTATAACACATTGAGTTCACACCTTTAGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:af8047dd010b
40
AGTTTACACCTCCTAATTACTTCACACCCTTGATCGCCTC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:cd7ab676769c
40
CCCATCACGTCCAACACCTAATCGACTACCTAACACCTAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:ef10eaa299fe
40
ACACCTATACCGACGATGTGTTGATTAGTTCACACCTGCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:3b7da8a86989
40
ACGATTAGGCTATCATAGGTGGGAAATCGTGACGACGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:8244fddcbb3d
40
TACAGAATCATTGTGATTAATTAGGTGTCACAAGAGGTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:700cc96d6597
40
ATTACATCACACCTCATCTCGTATTTCACACATGTGATAA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:9215456ae5a0
40
ACTATTTCACACTTCCACTTTCTCGTTCGCACCTAATTAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:7782d0582b70
40
GTCCCGACACTTAACACCCCATTAAGTACACTTCACACCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:e64c812af799
40
CTTCACACCTCATTAACGTCATCAAACACCTTTCCAGCCA
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:5cfd2be123e3
40
CATCCCTAACGATGTGTGAACTTTCACACATACCGTTACC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:520abc9113e7
40
TCGATCGATTGCCACACCTTTAGTAACACCTAATCAGTCC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:6d26610716e7
40
ATAGGTTGTTAATTAAGTTCGCACGTTATGATTAACGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:47406d89ac70
40
ATTCACACTATTACCTAATGAAGGTAACACCTTTCCTGAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:34f4f5cbd323
40
TCACTCACGCGTGCACATTTGCACCTACTCAACGAAGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:24b5169c01b5
40
TCAACACCTCATTTCGACACCCAACACCTTAATGATCCAC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:b7522d016bdd
40
TGCAACGCGACACCCCACAGGTTAATCGTTCACACCTCAT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:bd62ca4dea79
40
TTATCTACCTAATGTAATTAACACCTCTCTGATTGAGTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:391f71631f90
40
TGCCATTACGCGTAATTAAGCTGAACACCTTAAGAGGTGT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:dc2543b1f4ea
40
CTTCATTTCATCATTAACACCTCACACGTATCAAACGTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:ad3a095904af
40
TTCGATTATAGTTCACACCTATACACACCATTAGCACCCT
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:6fe182f1c079
40
AACATTGAGCTTAAAGGTGCAAACGAGGCTGATTAGGTGC
PANAPTA:Q9GZZ0:HOXD1_TBX21:PRJEB66722:R3:b63f2633d101
40

SELEX rounds

R3 ·final