HOXD3_TBX20
CAP-SELEX sample HOXD3_TBX20; Mixture-SELEX sample HOXD3_TBX20 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAGTGCTAATGAGGCAATTAGTGGAGGTGATAGCCCGTTA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:d7ecd5623323
|
40 | — | — | — |
|
CACACATAATCAACACCTCTTCGAACCACGCAGCGACGCC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:b89e48c5105e
|
40 | — | — | — |
|
CATTAACGCTAATTGGTGGCAACGCACCACTAAGTGCCAA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:186a15806154
|
40 | — | — | — |
|
GCATCCATAAGGGACATCGAAATATAATTGCCGTATCCCT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:bb17f53e6553
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGCGTAATTAGCACGCTAATGATGTACGAGGTGATCC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:f4f579e8f795
|
40 | — | — | — |
|
CATAACGCAGTGACACGTGCTAATTAGTGTTAAGTACCAG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:6a47cfbab8fd
|
40 | — | — | — |
|
GTTAAGACGCCAAGCGTAATTAGCGCTTAGGCTAATTACA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:5ebd9328b30c
|
40 | — | — | — |
|
GATCTGCTGTAATTAACACCTACAAACGTGTCATTAGCAC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:fc20c69329c4
|
40 | — | — | — |
|
GGTAAATCATGTGTAATTAACACGCTAATGACATCCGTAG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:ce209b06e8a3
|
40 | — | — | — |
|
GCCAAAACTCTAGGACGTCAATCAAAACTACTCAACGCTT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:0122b00d8f61
|
40 | — | — | — |
|
AGTGTCATTACGCGTTTGCGCCTAATGACTGCCTTATCGA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:cc21c74cac34
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATGGGGTGATAATGACGCTAATATTGCCGCCAAGCT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:1303f145b879
|
40 | — | — | — |
|
CGAGTGTGTGCCGTTGTCACCTAATTAACACCTCTTCAAT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:6094e8d01c66
|
40 | — | — | — |
|
GTTGTTATCGCACATCATTGTCACCCTGTCGCCATCACAC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:68767744b665
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAAGACTCACTGATGACATATGTTGATTTTAACGCC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:67e7169cdf34
|
40 | — | — | — |
|
GCGACCGTGGTAATTGGGCCATTAATTAACGCATTGATGC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:9a23bdfbea41
|
40 | — | — | — |
|
TACACGGAGCAAAACGTGTTTTTCACACGTGATTAACACC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:3c97911f3385
|
40 | — | — | — |
|
CACCGCCACCTCTCGCGCCCCGACACCTCATCAACACCTG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:d3ac5ad151ef
|
40 | — | — | — |
|
GATAATTACAGTTGACAATGTAACACGTAATTATCGTAGG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:edfae5452c59
|
40 | — | — | — |
|
GCAATTACGCTACTAATTGCCAACACGTCATTAACATCTA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:31eef0de9ebb
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATGAGGTGTTAATTTCACGTAGTAGCGCGGTTCCAA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:39c4b3b4143d
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCTGCCAAGATCGAGGTGCTAATTGGCCTCATTAGTG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:cb75700e66fd
|
40 | — | — | — |
|
AGTTACTGCAATTAACACCTTAACACCTTCGCGAGTTTGC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:bc4ed937906c
|
40 | — | — | — |
|
GACGAGGCGTTAATGTGTTATGTCATTAATGGCTTTTCGT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:62fa04c0c253
|
40 | — | — | — |
|
AACACGTCTCACCTCATCGCGTGCTAATTAGCGACACTAA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:9ca839292760
|
40 | — | — | — |
|
TCGAACAAAACCGAATTTTTGAATGCCGTAATGTCGAATT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:0983ac196d0e
|
40 | — | — | — |
|
CACCGAACTGACGTGCCGTATCCTGCCCTTTATGAGGACA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:353754398668
|
40 | — | — | — |
|
GTGATGACTAATGATGTAATTAGCAAAGCTGTGAATGCGT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:a01950506ffb
|
40 | — | — | — |
|
TAACCCTCATTCGTTAATTACCTTTTAATGATGTGCTTAT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:90eaaecf80e1
|
40 | — | — | — |
|
GTTAGTGGCACCATCATTAACGCGTTAATTATGTTACATC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:9886572e4077
|
40 | — | — | — |
|
CGATCCTACGTGTCAGCGCATTAATGACAGTTCATTAGTG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:64cabdaa49f9
|
40 | — | — | — |
|
GTGATGGTGCAATTAGCGTAATTGCCGCATCACTTCCCTA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:8894587eb5cc
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGTTAATTATGAGGGTAATTACCGCTAACAACAGCAC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:6f4503e6a6e7
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATGATAGTGATTAACACCGCGAATTGCACATCGTAT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:a0f30ee08561
|
40 | — | — | — |
|
TTACACATCTGCGCTAATTAGGTACTAATTGTACTTGTAA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:777c729f83f4
|
40 | — | — | — |
|
CACGTGAGCCACACCAAATCGCCAAGGTTTCAGGTAAAAG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:b6298d99b529
|
40 | — | — | — |
|
GCGATCACACTAATGACTTTAGCACTTAATTACGTGTATA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:eb754501166f
|
40 | — | — | — |
|
TCACCGCCGAAATTTCGATTGTCCGCAGTGAATCGACCGT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:ed8576f5f9b7
|
40 | — | — | — |
|
TGTCATTGCCAACTTGCCAATTAGCCGCTAATGACCTGTA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:dbc14999e401
|
40 | — | — | — |
|
AGTTTGCTGCGGCGTCATTAACGCGCGTTAATGATGTGGT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:e011bc3c3c17
|
40 | — | — | — |
|
GAGTAAGGGGTGATAATGATGTGTGATTAGCGATGATTTC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:f14f293f9890
|
40 | — | — | — |
|
CATTAACTCTATGTTAATGACAGTGTCGATGTGCGGTTAG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:675908fe5cbb
|
40 | — | — | — |
|
AGAGAACACCGAAATCAATTTCCGTATATCATTACTTTAT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:b9c5586e1029
|
40 | — | — | — |
|
GTGAAGGCGTGATAATTAACACCTCCGTAATTAGGCTTAC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:9ae922946ece
|
40 | — | — | — |
|
TGGCTAATTAGGTCACACTAATTAGCAGGTGTTCATTCAT
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:40f3caac9387
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGCTAATGAAGGAGGTGTGAACCTAATTAACGCGTTA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:da35c7836bf1
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCAATTAACACCTTCTCGCTCCTAGTTTGTGCGTTAA
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:eba41e8ecef3
|
40 | — | — | — |
|
GATAAATTGCTAATTATCGTGCGCGTAGTGTCATTTGCAC
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:5c55a69f307e
|
40 | — | — | — |
|
TCACACCGTGTTAACGACGTTGACACGTAATTAGGCCGCG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:31d470c931e4
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATGGATTGTTAATGAGCTGCAAGAGCGTGAACTTAG
PANAPTA:P31249:HOXD3_TBX20:PRJEB66722:R3:22cde3723d75
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final