HOXD8_MAF
CAP-SELEX sample MAF_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTCAGCTACATACGTAAGTAGGTTATGTAGCATGATGGGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:7b038e56f99e
|
40 | — | — | — |
|
AGAAAGCTATATCATAGGCGTGTGCGTTATGATGCTAGAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:3703f80671f0
|
40 | — | — | — |
|
AGTTTTGCTAGGCAGTAACTTTGTAGAACAAGACAGTTAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:8837f0d6cca5
|
40 | — | — | — |
|
GTTCAAAATCAAGGAATAAAATGAGGCCTTAGTTTTCGAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:5ad09d875716
|
40 | — | — | — |
|
GCCATCTAAGAATATCATATTAACTGATGGCGAGGACATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:892436ca34fa
|
40 | — | — | — |
|
GATCGCGCCCTATGCCCTCCCTTTGCCAACGTCAGCAGTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:9c408a81a65c
|
40 | — | — | — |
|
CGGACAAATATCATATGTGAGGACTCAAGTTATGATATGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:727701330383
|
40 | — | — | — |
|
AGGGCGTTACATAGGCTTCGAATACGTTATGTACACCCAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:ea9c70c17e9d
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCTTGAATGACCATTAGAATGAGGTCTATTTGAACTG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:92dc594fd548
|
40 | — | — | — |
|
AGGGCAACGTAAAGGATTGTAGACCGTTGATAGAGTAATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:54bef1e3e05b
|
40 | — | — | — |
|
GAACATAGGAAGTGCATGATGCCTAGGTTCTAAGAAGGTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:3b648a434b68
|
40 | — | — | — |
|
CTAATAAACCTGTTTTTCACGCCGATAGGATCATTAAACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:02b3c7badd48
|
40 | — | — | — |
|
CAGTAGATTAATGACCGGGCAACGAGAAGGATCATTAATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:440ca5482041
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGTGATGCGACTATAGGCTTAAGAGTGCGTTATAGTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:3dcc018a6c3a
|
40 | — | — | — |
|
GGAGCGTAGCTAAGCCGACACCTGCGACCGAAGAATGAGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:18ae3eebf8ac
|
40 | — | — | — |
|
CGAACATATGAAACGAAATAGGTATAAGGACGTTATTTCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:834d266e1f79
|
40 | — | — | — |
|
TTTAATGAAGATTTGTAGTAGACAAAGTGCTTACATTATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:bc05cb36414f
|
40 | — | — | — |
|
CATACTGCTAATAACGAGACAAACCTATTAGCTATGTTTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:488dd04c24d7
|
40 | — | — | — |
|
AATTTGCAAGACATAAATAGCCACCATCCACGGCATATTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:2600ef69028a
|
40 | — | — | — |
|
GAACCGCACAAACTTAGTGGAACCTAACAGTTTTGCGTGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:4c52629ce7d0
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTTTCATCAGATAATGAAGAAGATCTGGCACATTATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:648ac71f52b2
|
40 | — | — | — |
|
GCCGCGTAAGTGTATCAAGGAGACGATTACATTACGCGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:b57118e6d555
|
40 | — | — | — |
|
GTCAGTCAGCAATAAATCCACGCATCGAAATGATGCGTTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:67af9c9da0f7
|
40 | — | — | — |
|
TCTAATGTGCTACTGAAAGAAAAACAGCAATTAGCAATTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:da9f6abd44a3
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTGTCTAATAAAACGTAGTGTAATATATTAGGCAGTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:d26db4a1fdb2
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCGCTGGTGAGAAGCTGAGAACAATGTTTTGTCGACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:fe6c017a3a07
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGCACGGAAACCGGCACTGTGCGCGCAATGGCCCAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:5aea24d366b3
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTAATTAAATTGAAAGCGTTAATTACCACACGACTTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:5eb93d0a3c4e
|
40 | — | — | — |
|
CCGGGCACCGTTATCCACCCAGCATACATGCAAGCCTTAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:8dc0347427f4
|
40 | — | — | — |
|
TCATACGTGAACCTAATTAGACTCTTGCTATGTAATTAGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:e7961c4ea945
|
40 | — | — | — |
|
ACAGAATTAGATACAACGAACGCGACACGTGAGGCATTGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:602e35aefb4a
|
40 | — | — | — |
|
GCGTAATTACACAACTCGTCCTGACAGTAATTAACGCCCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:fce6a24e275b
|
40 | — | — | — |
|
CTAAATTCTAATAAAGTTACAGGAACAAAACCTCGTGACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:e10236013d3a
|
40 | — | — | — |
|
GTTCCAACCATAATTAACTGTCGTGAGCAGTAATTAATGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:01e65adb6bf5
|
40 | — | — | — |
|
AAATCAGAGTCAATTAATAGGTGGAGGGATTAATTTCCTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:ed540256bcc2
|
40 | — | — | — |
|
CAGCAATGAGAAGATAATTACGTGCTTTGACGGTAATTAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:b486707936e6
|
40 | — | — | — |
|
GGGGAATGTGTTAATCCCACGAATGGAAGATAGAAGGACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:4b8b88829ff9
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAATAACAAGTACATCTGGACACCTAAGGCAGTGAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:7121972bd569
|
40 | — | — | — |
|
TGTATGTCTCCATAGGTCTAACGTTATGGGAATTCCATCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:cfb39e2b030e
|
40 | — | — | — |
|
TTTACTTAGACAATCTGCACAGTAAACGGTTATGGCAATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:198f1cbbae68
|
40 | — | — | — |
|
TTAACTTATCGGAGATGACAGTTACCATATATTCTAGCTG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:07f17bf56e50
|
40 | — | — | — |
|
TTTCGTGAGGTGCGGATAAACCACAGATGTCTGATCATGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:75d69094ca7a
|
40 | — | — | — |
|
CAAAAGAGGAACAAGGGTTTGTGAGGCCACTTTTGAGTCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:fa7dd37925fe
|
40 | — | — | — |
|
TTCGAAAAAGCACGAGTCTAGTAAGTGGAAGGAGCTATAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:658df9027624
|
40 | — | — | — |
|
GGAACATGATGCAACTGCACAGGAAACGCTACGCTGCACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:6471b26646e2
|
40 | — | — | — |
|
GATGACGTACAGTAATTAAACCCCTCACCTTAATTACTTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:8595ba394aff
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGCAGCTCATGAATATTTAACTAAAGCGCACTCAAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:f8715f9e295c
|
40 | — | — | — |
|
AGATTTACGTATAGGCCATGCCAGAATATAGACCGTAAAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:84f1a97bdccd
|
40 | — | — | — |
|
ACAACACGTTCACGAACCGCAATGAAGCTTGCAGTGAAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:5c4f46f41743
|
40 | — | — | — |
|
CCATATGAGCAAGGCCGATCCGATGCAAGGTTAGCGTTCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAF:PRJEB66722:R3:82ce1bb17135
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final