HOXD8_MAFG
CAP-SELEX sample MAFG_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AATGAACAGAAAACATAGGTAATAACGTTATGTTCTCATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:80bb4cb3db95
|
40 | — | — | — |
|
GAACGGGGAATTAACGTAAAGCAAGTTGGACCGTTATATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:4bc08b10e674
|
40 | — | — | — |
|
AAATGCTTACGAGGACATGGGAACCATGGATGGCCACGTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:824c947486a0
|
40 | — | — | — |
|
TTTCGGAGACATTACATCGATAGGCGCAGCGTTATCGATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:4547c5090e93
|
40 | — | — | — |
|
GCCTAGAACCATAGGCCCGGCGTTATGGTTAAGATAAACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:67d967d4839e
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGAATCCCCGAGATGGATGAGGCCTCATGATTAAATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:e748dc078ad8
|
40 | — | — | — |
|
AATCGAGATCATACGTAAATAGGTTATGACTCGCTGTACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:d8010692b924
|
40 | — | — | — |
|
TAACGTAGCGAGCTGGACCGTTATTACAGAGGGTAGGCAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:63c9c773a634
|
40 | — | — | — |
|
CTCAGTCCATTATAGCGATATCACAAACTATAATGTCTTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:6f8c8e84027d
|
40 | — | — | — |
|
CATTAAAACGTACTTATTGAAAATAGACAGTACCTAACAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:0fea5da08ba6
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCATCTTAATGGGAATGTGATTCTACCATTACGTCAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:0c42379b6cc1
|
40 | — | — | — |
|
GACGAAATTACTAACTAGGCAGTAATTGAGGCGTCAGTAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:361ca98c113d
|
40 | — | — | — |
|
CTCAGCACTCTAGCCATAGGTACGACGTTATGGTGCGCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:0ec54307bcb8
|
40 | — | — | — |
|
GGTACGAAATTATGGGTACATAACTGCCAAAAGTTTCCTG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:5f14c12e17e3
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGAGGAGACAGTGACCAAAGGATCCCACCAGTTCAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:e233f79235cf
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGCTTTTTGGCATCAAGCCACGAAAGCATCATTTAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:a41ba27eb7b9
|
40 | — | — | — |
|
TTTGGGCATTTATTAGGCAGAGCACTATAAATAAATGAGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:feee5f7db39b
|
40 | — | — | — |
|
TAAACACGAGGAACCAGTAAACGGTGAAGCCACGTATCCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:6524f1b6c184
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGAGTGCAACACGCGGCATAGCCGACACACATAATCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:b8dddf315d7a
|
40 | — | — | — |
|
CGCGGACGTAGTGGAACTAAACCGTCCGAAAATAAGTACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:7e08e07c895f
|
40 | — | — | — |
|
GACGGAGTTAGATCGCCATAGGTTTGTCGCGTTATGGCGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:aa7acd76efd5
|
40 | — | — | — |
|
TCTTGTAACGTTAATTTCTAGCAGTTATACAATTAACGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:552f78bb5701
|
40 | — | — | — |
|
GCAACTTAGGTCGAAGTAATAGGCTATGCACGTTATTACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:36c258e8b6c3
|
40 | — | — | — |
|
CGAAAATAGTCTGGGGTAACATGACTACCTTCTCGCCTCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:212bb8d7cb6f
|
40 | — | — | — |
|
ACTCCCCCACCGGACAACTACCAAAAGTGTTCATATACGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:700fe4d28e86
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCTTTCCGCTATACTAAGCAAAAGCAATTAATGACGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:d7e336db8bbf
|
40 | — | — | — |
|
TTGGCAAAATCCGCTATGTCGTAGGCTTACACGCGTTACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:07f932c645d7
|
40 | — | — | — |
|
AACCATAGGCACAGCGTAATGGTGTGTCGGAACAAAGCCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:50198d626b53
|
40 | — | — | — |
|
CCATCTGTAGACCCCTCAATTGGCTGTTAGCGCCAACATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:1713816ae0f9
|
40 | — | — | — |
|
AAGATGAAAGAACGTCAAGCCAGAACGAGATTAATGTCCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:e37c2b787f0d
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGTAATTAGGGTAACTAATTACTGCTGACGTTCTGTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:000141265589
|
40 | — | — | — |
|
ATACATAGGCTTGATCGTGCGTTATGTATTTAGACTCTGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:3f9eec38238e
|
40 | — | — | — |
|
CGATATAAAAGCACGACTAAAAGGACGCATGCTAGGAGAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:da7730403301
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGCGTAATTACCTGTCCGAGACCGTAATTACACTCGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:9999cc4b00dd
|
40 | — | — | — |
|
TACGCAGCAAATTTACAAGGACAAGCACGAAATGTAAATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:681899c3a39c
|
40 | — | — | — |
|
ACCTCGTGTCATGTATAACTGCCTAGTTTAGTGTTTGGAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:5bd7f777af25
|
40 | — | — | — |
|
ACTAGATTGGCTACGAAATACATGAAGCATAACCTAATCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:444fd8af6b58
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTCATTAAATGATTAATGTGCACATTTGCGTCACACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:2b701108db51
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTAAATGACAAAGTGTGCAAGACCATTAATGCACGTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:b61c930cba5f
|
40 | — | — | — |
|
TTGTGGCAATTAAGCTTAATTGCCATTTAATGTACTAAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:c94172e0381b
|
40 | — | — | — |
|
TTTTGTGTGTAATTAGCCCGTCGCCCGCGGTATGGAAGAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:2216d183b84c
|
40 | — | — | — |
|
GGAGACGTCAGTGCAAGAATTTGGGCCTGCCGAATGTTAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:96b24f383130
|
40 | — | — | — |
|
CTCCAGGCAGCCAGCACCATGTGATAATAGAGCAGCCAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:24351f3865ce
|
40 | — | — | — |
|
TTAACTGTAATCGTTAACGGGAAGTAATTAACATGCGAGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:7f83d8cdcd70
|
40 | — | — | — |
|
ACATAACTTCGCAAATTATCAGTTATGATTTAACTGCAAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:de78bb6948b1
|
40 | — | — | — |
|
TTCACATTATGCAAATACGCAATAATGGAACAAGTCACTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:febe4b0f3fe4
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCAGGCTGAGAAATAGGCTCGGCGTTATTTCTGAAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:b104463c23cf
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTTGATCTTAATCGCAATTACTGCGCGCATAATTGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:45a6b1d326ed
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCCCCTAGGCAACTTCGCGCGTTAGTGGGGCCGGGAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:71596bd2bdd7
|
40 | — | — | — |
|
TGGCACTACGAAAAGCACATTAAGCATCTTAATGACCGAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_MAFG:PRJEB66722:R3:c57c34e93fff
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final