HOXD8_NHLH1

CAP-SELEX sample NHLH1_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Sequences indexed
10,000

Top enriched sequences

More via API →
Sequence Length log2 FC P(active) Class Monotonicity
TGGGACAGACGATTGCGATGAAGTAAGACCCTAATTAACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:0742751775f0
40
AAATTGTATTACACTATTAATCACCTTTCTTTGGTAGTAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:354ce3f47204
40
TTAATAAAGCAAATCCTATCGTCCTCAACGATTACGACAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:26b2b99f34b7
40
CTCATTACATTAGAACACTGAACCGAGTTCTACCGTGCAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:bd9f1ade51eb
40
ATTATGTGTTAATGGCTCATGCTGATAAAGGCCATTAACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:417f0e46f68c
40
TGATCAAAGGGATAACTCTAATCGATACGCCGTTTTGCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:a1f211e3930a
40
GCAACAGCCAACGTACCTTAACTAAAAATGCCATAAACGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:24122959886e
40
TGTCCAAAACATTTTAACTCCCAAAAATATAGACCTAATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:bceb6c6b1f39
40
TACCATAAATATTCTATACATGTAGATATGAAGTAAATAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:2a85f5fa0901
40
CTTCACGGGGAAATAGAAAAAATTACCGTTGGGCGATGAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:aea61e1639bd
40
CGGAAATAAGTACCGTAATTAACGCGACCTCGATAATTAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:a6654e13b993
40
CGACGGGCGCGCGTGGCACCGCTAACTAGTAAATGCGATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:d8a7eaa5a31e
40
ATGCACCTCCAAACGCGCCCCTAACAACTAATGAGAACCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:7bc3179768e9
40
AAAAAAAATTACGTTGTGAAGCTGTATACGAGCGATCGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:dca79dfc4ad0
40
ACGATTGAACGGCCGAGAAAATCGGCACGCCATAGAGGAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:104b673dc05e
40
TTGTTGAGAGGTACTACTGTAGTTGATGATGAAGGGATAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:9b8112d4a9ba
40
TGCTAGATGAAAGTGATGCAGCGCTGCTTGAGTAGAAAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:4c10507c5c74
40
CTTTACGGTCTCCTTTAAGACTTTGCTAACAATTATTACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:59b076d049c1
40
CTAGATTAGACGAATGCCTGCACGAAGGCCGGTTGTTTTG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:11593630ecc0
40
GTAATGTCCTTAGCGAGAGGTACCCATACAACTGAACGTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:834686bd857e
40
GCGCGGAAACTCACGTGAACTCACAGAATGAGGACGCCTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:a3d60ab18691
40
AATACACGGATCGGACCTCCAGCATGTCGAGCACGGACGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:ec7215c66bc9
40
TTCTAATAAGAATGTCCATGACCCTGGGAACGTTACTACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:835a8abb1e21
40
CATAGGACTTATAAGGCAATACGTTACAAGGTTATTGCCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:46cfb9d10f93
40
GCCTTCCTAAGTTTACCGAACATCTAGCGAGACGCAATAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:7a3c13e37c79
40
ATTATACTTCAAGATAGACGTACCTGCATCCGGCAAAACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:5da72484e21d
40
ATATACACCCACCCGCTCATGAACCATTAAGTGGAAACGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:3c386fc0be47
40
AAGTGACCACAGCTTCCCGTAGCAGACGCCCACCTCATTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:2056f452fc08
40
AAAGCATAATTAACACAATACGTTAATTACGCACCCAGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:a720895c9af6
40
AATCGCCTAACACGATTGCCAACTGTCGAAACGGCCAAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:5c5ab19c1a75
40
GCATATGGAAAACCTCCCTGTCGCAGGAATAGGCGGAAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:d60bb764d40d
40
GAAATTACCATACGTGTAAGGTTATGGTTAGTCACAGTAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:b77b14f57efd
40
AAGACCATTCGTTCAAACATCAATTGACGAGCCCCCTCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:4357df004b73
40
GAATGGGAGAAGCTGACTGGGAAGGCCTAACCGTAAGGCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:012c75592932
40
GTGCTGTTCGGGTAATTACAAGGCGGACTACATACTACAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:17268c274f10
40
GCCATTAACAACTCCTTAATGGCCCTACGTCCACTTCTAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:c6ed7b432a33
40
AAATTCAATCCGTTGATGACTGACGAAGTCTAATAATCAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:b1332e0c1434
40
AGTTATGAAGACTCATGCATTGACGCAATTGATACCCAGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:83938e913ad8
40
CGCACTGATCAAAACATCAGCCCTAGCCTTCCCGTGGTCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:bf4f08a7a9c6
40
TAATTGCTGCGCGCTTACCTCGCTGTGAAAGCAATTATCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:4d88bb52bbc0
40
ACGATGTTGACTACACATAGGCTAGGTGGCGTTATGTGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:1fb22a517983
40
TACGCACCTTAGTATCATTATGTAACGTGGCCCATGAAGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:fcb79bfb4a23
40
CGACACATCCGACGCGAGAAATCACCGGTGAACGTACAGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:a29db88dbc71
40
GTCGAAGGACAGTGTCGGATGAGACCACCATCTCGACAGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:54a85d7a9925
40
GCATCGGCACGGTGTGGCCCAGACTGCCACCTTCGGAACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:d9e9bdfb06a2
40
GCGAGCATAGCCCTACCCCTACTACTGGGGGCAGCATTCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:8e9a616cd96e
40
ACGCTAGGGTGACCGAAAATGATCTTATCTTTCTACATGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:ca032a795d91
40
CGCCACATCCGTACAAGGACGCACGCGACGATGTACCCTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:8e90df56feec
40
ATGCTATCTTCTAACAAGAGGCCTACCAGTACAGTTAGCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:fae63dd525f6
40
ACGTAGAAGAGCATCCCAACGACGTATAACCGCCTCCCAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_NHLH1:PRJEB66722:R3:9ca3e5c6e0f3
40

SELEX rounds

R3 ·final