HOXD8_PAX1
CAP-SELEX sample PAX1_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TCTGCGCTATATGACGGAACCAAACCACCATCATATATCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:6e8ff18337be
|
40 | — | — | — |
|
CTGACAATGGGATGATAATGATGCTTACGCCCTTGCATAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:f446b59887e1
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCATACGAACGGTCAATTTCTAATACGTTCCTGAGAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:28932a4198d6
|
40 | — | — | — |
|
GGAACGGTTCCTTAGCAACGACTAAAAGGAAGCGTTGCAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:57757dac3b79
|
40 | — | — | — |
|
CGACTCAATGTGTGGGGCCAGACGCCACAATTTGCACTAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:bea2c5e297ba
|
40 | — | — | — |
|
GTAATGGATAGTGTTACCGATGTACCATCCAGTCCATTAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:87677fb54ce2
|
40 | — | — | — |
|
GCCAACTATTAACGCGGACACTAGAAGACAGGGCAACGTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:e0715f624c3f
|
40 | — | — | — |
|
CCAATGACCATACCTAAGGCAGAAGGGGACATTGGAACCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:0ccb91774a09
|
40 | — | — | — |
|
GGACAATTGGGAGGCCCCAACCCAATTGGGACGCTATCCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:f64c20047099
|
40 | — | — | — |
|
CTACCCACGATAGGCCTCAACAATGACGTAAGAGACCAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:37ab09d9a20e
|
40 | — | — | — |
|
TGGTAACACATTACGCATAGGACATGCGCCGTTGCAGCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:4c860a665cbf
|
40 | — | — | — |
|
AGCCTAATAAAGGGCCTAAAAGGTATATTCACTTTATTAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:cca47ad548e3
|
40 | — | — | — |
|
AGCTTACCAGTAAACACGCGAACCCTCCCTACCCGATAAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:955d494c50b8
|
40 | — | — | — |
|
AGACGTAACCTTCCCCATCACACTGACCAAACGCGCAACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:3e5c861ab7f6
|
40 | — | — | — |
|
AGGGAGATACGTACCTTAGGTGAACCGTAAATGATCGGAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:75ddbc1ef12b
|
40 | — | — | — |
|
CTCGGGTATTCCCCCCAACGCATCGCTAACCAACCCTATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:25c9f7710a94
|
40 | — | — | — |
|
GTTAGTAGAGTGGATTGGCTCCGTTGCAGTGCTTACGGTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:f279efb880a1
|
40 | — | — | — |
|
TACTCGAAATCCATGACTAAAACGGATCACCTGATCGGGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:776bd23803a0
|
40 | — | — | — |
|
TCAGACCATTAAACGCAAACTTAATTTAATGGTGCGTAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:4c467b5bde67
|
40 | — | — | — |
|
GTTGATATGTGCAATTAAGGGAATACTTAATTGCACCAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:8175b121c431
|
40 | — | — | — |
|
CACGGGATATACAAATAAAAAGCCTGCTCGCAGTTGAACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:fefb084a67f6
|
40 | — | — | — |
|
AATGGCCTATTGAACCAACCAAAACGCACATGGCTCGGAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:215f04f4efcd
|
40 | — | — | — |
|
TCTTAATTTCATTTGTGAACAAGTAATTAAGCATCCGAAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:7069dd1a624d
|
40 | — | — | — |
|
TGTGCTGAGTAGAGGCTGATCAAAACTATTAACATGCACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:84cb7d668c0a
|
40 | — | — | — |
|
CCCCATTTACCTCGCGCGTCAACGAGCGTTAATGAGCCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:d97a1b25fc6b
|
40 | — | — | — |
|
GTAATTAGCCATTAAATATGCCCTACCTTTAATGGACCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:69407d20d335
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTAGTCCGGAATTAATTGAGCGTGACCGTTATACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:fec2a547802f
|
40 | — | — | — |
|
AACGTCACGCCCCATTACCCATCTTAATGACCACCTAACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:21d60d0aa1ef
|
40 | — | — | — |
|
TCCGATGAGGGCGTCGTAATTAACTATCCATTAATTACGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:b89b52b0b0bc
|
40 | — | — | — |
|
TATTCCAATAAGTTATCCCCATGCCGAGAGCGGAAAACAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:32964326b2f7
|
40 | — | — | — |
|
AGCAGTCCCGCCTAACCCTGCGTGCATCCCCACATATCAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:83ea29f9c009
|
40 | — | — | — |
|
CGCACGGATTGATCTGTAAGTCGAACCGTCAAGGCGACCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:c4f19edf2b58
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCGCGCACGAAGGCCGCAACAACGACGATTAGTAATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:138b4af62346
|
40 | — | — | — |
|
TACTCAACGTTCCGCTTCAATGCACAACGATAATCGCCAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:e576adad991e
|
40 | — | — | — |
|
GAAAACAAATCTAATAGAAATTGGACAATTTGTTTTTTGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:bead108b4eca
|
40 | — | — | — |
|
GTCACGCATAATTAAGCGCAAATGAGGCATTCAGAGACAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:a16146f2e137
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCTGAGCCGATGCGTAATTATGCTAATTACGCGTGAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:519d11ccf4b6
|
40 | — | — | — |
|
TATTAATGGTTTAGCACGCTCCATTAACACTAAGCGCAGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:ca1c2591a4cd
|
40 | — | — | — |
|
CGCACATCATGAATCCTCTACTCTAACAGACCTGTCGCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:7263c6af4ce7
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCAGGTAATACTCAGTATCCCGATAACATCGAGGCAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:f882e548bddb
|
40 | — | — | — |
|
GTGGCGTCAGTCAAGCATGACTAATGGCCTTCCATAATTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:7c7dbb062c6b
|
40 | — | — | — |
|
GTAGGCCATTAAATGGCACTCTGCGTAGTTAATGACTCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:61e364b0379f
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGACACGCACCATTAACCCGCTCATAATGGACGCATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:83d71d966180
|
40 | — | — | — |
|
TTATAATTGATGCCATAGCAATTAATTGGTATCCATGCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:8393d02ec79c
|
40 | — | — | — |
|
AAATGAACTGGGTACGGCTAAGTACTCACAACGAGGCATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:76d2455700b2
|
40 | — | — | — |
|
GCAATAAACTCTAATTGCCCATAACGCACGCATCATTAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:8f76d84a4c3b
|
40 | — | — | — |
|
GATGTCAATTTATCAGAGATAGGACAATTGCACTTGGATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:2cc113a0a04e
|
40 | — | — | — |
|
CGTAATGATGTGGTTACGGTTGTCATTACTACCACTTCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:454450bac8bd
|
40 | — | — | — |
|
GACGCAATTAATGCAATATCACGTAATTAATTGCAAGCGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:25284c2e3998
|
40 | — | — | — |
|
TGAGATTATTGGACAGGCCCTATAGGATAGACGTTATAGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX1:PRJEB66722:R3:7e415ba6cc4d
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final