HOXD8_PAX2
CAP-SELEX sample PAX2_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGTAACTCTTTAAAGCAGCCCAATATCTTAACTGCAGACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:d1209dc2d963
|
40 | — | — | — |
|
TTGGATACACACAATCATAGGTAGAATCGTTATGATTACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:2da0c882e45b
|
40 | — | — | — |
|
ACGTATGTAAGACAAGTTATAAGCACGTCAACCTATTACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:251448c96cf3
|
40 | — | — | — |
|
AATACAACGAAATAATATGAGGCATTGTATTGTATGACGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:37b495c08fba
|
40 | — | — | — |
|
TGCCAAACCACAAACTTAATAAATTACACAGTTTGCACAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:a6a45e4f4afc
|
40 | — | — | — |
|
AGCCGAACCACGGCCACTAAGGGGAGGAGAATAAAACACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:237189729383
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTAGTAACTTAATAAATTGGCATGCCACTGTTACTGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:28f05cfc28b6
|
40 | — | — | — |
|
GGTACGACGAAATATTAAAGATGTTGAAGCATCGTACACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:9eaf49d80e20
|
40 | — | — | — |
|
ATTGACTCATCGGGCATAGGTAAGACGTTATGTCCGGGCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:b9865af0612d
|
40 | — | — | — |
|
ACGGAGGGATTAACGGAGTGGCTACGACGTCAGTTGAAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:bb52cde7026f
|
40 | — | — | — |
|
GGACGCGAGACGATGCTATAGGCAATGCGTTATAGATCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:177601b65069
|
40 | — | — | — |
|
CGAATTAATTTCGAGGACCTACAATTAATTGAGATATGTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:9721e2093088
|
40 | — | — | — |
|
GTGGAAGCGTGTTCGAGGATACACCAAGAGGCCGTATATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:fdd04b595410
|
40 | — | — | — |
|
CGTAGCCGAGTTATGACCCAAACGCCAACGTCATAACTCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:bf44f74551e2
|
40 | — | — | — |
|
CATCGTTCACGTCATATAGGCCTTGCGTTATAGACCTGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:ed8fc9ec9ca6
|
40 | — | — | — |
|
AAAACAGAGACCACACTCTTCCTTCAATGGGGTAGTGTTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:d019f821c5eb
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATGATAATAGGCAATGTTTTATGAACGCGTTATTAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:48f2e40bc10a
|
40 | — | — | — |
|
GTATCGCACATCGTATGTCTGAGGCCAACAACGATCTGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:d48627a39c62
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATTGCTGGTGTAATCTTGATGTGCAATTAGGTTATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:0b972cdcd9c7
|
40 | — | — | — |
|
TTCCCATTACGCCACTATGAACGGCAGTTAGGCAACGACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:f011ac02967c
|
40 | — | — | — |
|
TAATAATGACGACCTCTCATTAGGGAAGCGTGGATTATTG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:2bd6e3adb187
|
40 | — | — | — |
|
GAGAGGGCACAACCATTAACGATCAAACGTTAATGGTTCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:243f6f6b9ea8
|
40 | — | — | — |
|
CGACAGTGGATAAGAGACAATTAACTAAGTAATGCAAAGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:4df1617af1a0
|
40 | — | — | — |
|
AAACTTAGACAAGCTGGACAGTTTTCTGTTTATGATTGGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:aa1c1329b3e8
|
40 | — | — | — |
|
TATGGACCTTAATTGGGTAAAACACGAAACAATTAATGGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:3e2450ee8c59
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCACCTCCCAGACACAACAACACCCCGAACACACCCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:8a7750d44250
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAACAATCAAACACGCATTATGCGTAGTGAAGCGTGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:1fee531f031b
|
40 | — | — | — |
|
TAGATTCTACACATCCATTAGACACGCTCTAATGGATACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:a42b7e7cef3b
|
40 | — | — | — |
|
TATTGTGAGTGTTATAAAGGTAACTTGAATATAACAACGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:cf5676b7a28e
|
40 | — | — | — |
|
TTATAATGGACTTTACGTATGATATCGTAACCCATTATAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:e6b2ce4a2958
|
40 | — | — | — |
|
ACCGCGATAGCCATTAGTCACGCATGGACAATTATACGCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:12fba74150bd
|
40 | — | — | — |
|
ATATAGGATTGAAGCCTGATCTCAAGACGATGAGGAAATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:73f4f130bbc4
|
40 | — | — | — |
|
TAATGGGTTGGAAGTCCCAGCAAAACCTGCGGGAAAAGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:434dcbd6f96e
|
40 | — | — | — |
|
CATTACGGCAAATAAAGGCAATTAGTCACGCCTGGATAAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:e48d4753f91e
|
40 | — | — | — |
|
CAATTTCAAGCCACATAAAACAGGACTTATGCAAGGCACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:9b5a0a9cb61c
|
40 | — | — | — |
|
AGCCTAATATGCATGGCTGTGGACAGATATCAATTAGGCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:55ef7c5f4d00
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCCTACCTAACAGACCCACGTATACTAAGACTCCGGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:b099c8039cbe
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTAATTGATGCAAATAGTCAATTTACGAAATTAGCCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:43db112caeb9
|
40 | — | — | — |
|
ACCAGCGACAATTAGCGAATATGTCCCTTGGAGCATACCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:a865adc299d4
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTAGGTAATCAATACCATTAAGCTCAGTCATGCAGAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:24e844698714
|
40 | — | — | — |
|
AGCTTTATCAGCAACTATCCATGCCTAACTACGTGATACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:f0c8c395b740
|
40 | — | — | — |
|
TTTATTGACATTGGAAAAAAAATACAATAAACTAATTACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:3964521c4ea3
|
40 | — | — | — |
|
GAAATTCTTGCTTCAAGTGGCTCGATGAACTCAAGCGAGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:8705ea063e90
|
40 | — | — | — |
|
TTCACGAGGCCGCGCCAAATGCCATAAAACGACACCTCTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:0a5e58cf9555
|
40 | — | — | — |
|
ATCACCAAGGCGCTGGACCTGAATAAGACGAGTAGACCCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:73affcd07561
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATAAACTTATCATAGACAAACAGTTTAATTAAACAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:0cbfb81eea74
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAATGTCACGCGGTAAGCACTAGACCTAGCAGCCTCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:cfc2d8607bcc
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATGGAGCGGTATTGGATCCATTAAATAAGGCCAGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:73414b9a8493
|
40 | — | — | — |
|
CTTGGCTGCGAAATTAATCATGTGTTAATTGTAGCTATCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:caeef709b12e
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCATAGGCAGGAACGTTATGGATAGAAGAATCGAACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX2:PRJEB66722:R3:e88d89ac9505
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final