HOXD8_PAX5
CAP-SELEX sample PAX5_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACTGGCTATAGGTGGCACGTTATAGCCTAACCACAACAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:de0f414a4708
|
40 | — | — | — |
|
TTTCGTGAACTACCCTAATAGGTAGAACGTTATTAGGGAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:ddb2090a5795
|
40 | — | — | — |
|
TGTCCATGGCTGAATGCTCACTACTAGTTACTAGCATTCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:682ed69e61b3
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCGCAACATACGTTTAAGGTTATGAGCGGCGTTGTGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:a9b61a2834bc
|
40 | — | — | — |
|
GGACCGCTGCGGGCCGCGTAACAATCTAGCGAAAGTCCAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:1ccdb3111a54
|
40 | — | — | — |
|
TGAGTATCGTAGGCTCAGCGTAACGACACAGCGGAGAGGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:051a99a060e7
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGCACCAATAGCATGAAGGGTACTAGTGCGATCAGCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:4f7b92878300
|
40 | — | — | — |
|
ATTGAAGTTTAATGGGCATTTGGCATTTAACCCATTAAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:2a1a4c3e43bc
|
40 | — | — | — |
|
CTTACACAAACAATAACGGCGCCCACCTATTGATTTGTGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:329404483aae
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCGTGTTCATTAACTTAGCACAGAGCTAAACAGTTAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:929599e885c9
|
40 | — | — | — |
|
TGAAACTGTAATTATGACAGTGCGACGAACCATGACTAAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:00af649e4d39
|
40 | — | — | — |
|
AACTCGTCCGCAACCACGCGTGACTAATGGTTCTTTAATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:f3c6c3a13a9c
|
40 | — | — | — |
|
AGTTCGAGTTTGCTATTAGTTCCGCATGGTTAAGCTAATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:73ff784a9caf
|
40 | — | — | — |
|
GAAACAACCGTTTACGCGCTCAAGCGGAACTAATGGCACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:ed31dc76f51a
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCTCCGCACACTGACCCGTGCAACATGAATAATTAAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:617e5d6ec548
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTTCAGCCGTGCAACCACTCAAGTGTGACTAATGGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:c5a885b84d62
|
40 | — | — | — |
|
ATGACCATACGTAAAAGGTTATGGCATTAAGGTGGCAGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:4a957a89ebc0
|
40 | — | — | — |
|
GGCCATGGATAACTTCGCGGCTGCCACAGTTATCACTGGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:c7cdb601b274
|
40 | — | — | — |
|
AACTATGGGCACACATATGCAAGAGAGTTATGTGCGAACA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:750f32cc34f0
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTAACAAGCCTTTATTTTGCAAGCTGCTAACAATAAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:9fe172efa1ab
|
40 | — | — | — |
|
TAGTCGCATGAACCATAGGCTCGTAAGCGTTATGGTCCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:1a9a6ac69ee3
|
40 | — | — | — |
|
GGGTCATTAGTTCCGCATGATCAACGATACTGACGCGATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:b7c2ca1f5120
|
40 | — | — | — |
|
ACGTCAAGGTCGTTAGTTCCGCTCCATTGAACGTAAAGCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:7a5ab9a7c817
|
40 | — | — | — |
|
AATCTAAACTTGCCGGTTAAACCTTGAGGCGGACAGTTTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:8e2c6e8693f6
|
40 | — | — | — |
|
AATTACCGCAGTGGGCACCCAGCCGTAACTAATTGCCCAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:536e4bb6bbe2
|
40 | — | — | — |
|
CCTCATCCTCCACGTAACGTAGACAAGCTTGGCACGTTAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:d338a6c97d7d
|
40 | — | — | — |
|
CTGCACTGTCTCGAATTGACGAATTTATGAGCTATTCGAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:a9d3437de441
|
40 | — | — | — |
|
AACGAGACTGTCAATTAATACTGAGCGGAATAATTACAGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:6bf08b1a96f6
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAGCGGATTAATTGCGCTATCACGCGTCAATTAATGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:2bf74829bcd3
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTACCGTAATTAAGACGTCTTAATTAGGGCGTGGATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:aacee984221b
|
40 | — | — | — |
|
AAATCTTTAATGTAGAAGATCTAGGACATTAAAGGGAAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:a8c9ed197159
|
40 | — | — | — |
|
TAGGCCATACGTGGACAAGTTGAGGTTATGGCCCGCGGCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:5cfd3daba180
|
40 | — | — | — |
|
GCCGCCGTAAAGATAATTGACCCATTAGTCATGCATGGGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:ffedee1fe51e
|
40 | — | — | — |
|
AACGAGACACAGAGGACCCTACGTTAAGAGCGTTCCTGGA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:b639db49d916
|
40 | — | — | — |
|
CTAAACTTTATATTTCGTGCCAACGCCACCACAATATAAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:6ebd82c7bf3f
|
40 | — | — | — |
|
CATTGCCGTTAGAGCTGAGGTTAGTCAAGGGGAACTAATG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:8a722c4f8e5b
|
40 | — | — | — |
|
AATTCTTGTATGCCTCAAACTTAGTAAACATCAACAGTTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:0acb3af92f1e
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGAAGAGAGCGGTTATGTGCAACCATCCGGCACTAAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:a1775f004284
|
40 | — | — | — |
|
TCAGTTGATGCACTGTACTGCAAGTGGCAGTGCATGGGTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:2f6cf8b95882
|
40 | — | — | — |
|
GACGTCATCTCTACCCGACCGTGACTAATGGCCACCCCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:a79df2d1a8c4
|
40 | — | — | — |
|
TCACAATCAATAAACCATTAGTTACGCAACGTTGCACCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:ba32b7c44947
|
40 | — | — | — |
|
GGCAATTAACACGCATTGGTTGACTTAATTGCCCACACAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:79bedc9c5290
|
40 | — | — | — |
|
TAGACGACTTAACGAAGTTGGACAGTCGTTCCTAATCTAA
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:421418aa6250
|
40 | — | — | — |
|
GTCACAGTTTATGATAATAGGTTATAGCGTTATTATCTCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:599ae7ffcdbc
|
40 | — | — | — |
|
GATAGTGCCATTAGTTACGCGCGACTGAGCATTAAGCAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:9d52c477e9b4
|
40 | — | — | — |
|
GGTCATAGGTTCATCGTTATGACTAAGGACGAGGCTGTTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:b5ff14dff4bf
|
40 | — | — | — |
|
AGCACCAATCAGTGGGTTAGCAATTAGTTCCGCCTGACAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:61806fe91758
|
40 | — | — | — |
|
GCCATGCCTTGATCGACGAACCGTGACTAATTGACTAGAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:1db772766a10
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCATTAAAAAGTCATTAGTGACGGCTGAATAGCTTTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:8149de20b487
|
40 | — | — | — |
|
TAATTACCAGGCTGTGGTAATTAAACAAAGTGTGGTAGAT
PANAPTA:P13378:HOXD8_PAX5:PRJEB66722:R3:1c1f1d396af5
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final