HOXD8_TGIF2
CAP-SELEX sample TGIF2_HOXD8 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAGCACTGTAATTACGGAAACAGACTACCATAATTACGGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:f29efa207a80
|
40 | — | — | — |
|
TGGGGAAGGTGGTCATAGGCTAATGGCGTTATGACGTACT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:8b657dfade62
|
40 | — | — | — |
|
CACCCCTGAAACCTACATAGGCAAGACGTTATGAGGTCCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:586d7120a622
|
40 | — | — | — |
|
CTGGGCGAGCGTAATAGGGGGACGTTATTACCCTTTTTTC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:5ecd65eebc5c
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGACAGGCCCTAGGTTACCGTCGTAAAGATGACGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:f0e7d30fdfc7
|
40 | — | — | — |
|
GTGCAATATTTATGGATCGGTATGTGTTCCAATAAATCTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:1e70e01d2131
|
40 | — | — | — |
|
GATAACACGCTTTATCTTGGTGCTGCGCGACCTGACAATA
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:8d31ceb42e90
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCCAGTGCATAATGAGAGTAAATCGTGTTCATTATGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:dd516b28d846
|
40 | — | — | — |
|
AACGCTTTATTTCGTTCGGTGAACGTCAATAAAATTGCCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:0527d884b9a0
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGCCGATTACCACCACACTATGGGAAGGGAAATTGGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:08c1ec5bab70
|
40 | — | — | — |
|
GGGGAGGGAAGAGTACGACCAAAGGATCCCCTACTTCGAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:3a0391858341
|
40 | — | — | — |
|
AGAGTTATAGGCCAGAGCGTTATAACGTTAGAGATGCCGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:694ab07b8d1a
|
40 | — | — | — |
|
TTTATTTTAGACGAGGTCATACCCGAGCGGGACAATGACC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:598e6dad063f
|
40 | — | — | — |
|
GCTGGTCGCACGAATAGGATGAGGCGTGCTGTTTTGCATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:57e7eea25fb3
|
40 | — | — | — |
|
TATAGGCATAGCGTTATAGACCCTTGGCGCCGACGTACCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:517b5436db66
|
40 | — | — | — |
|
TAGTGACACATAGGATTTCGTTATGTGCCCATCCTGTCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:41c71f67faef
|
40 | — | — | — |
|
CTCTCCTGACTAATGGGCACCATCCCACACCCATTATCCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:7a18f103c02d
|
40 | — | — | — |
|
ACCCAACAATACCAGAGGATCCTATGTTTTTAACCAAGCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:5609494e56f1
|
40 | — | — | — |
|
ATAAGGCCTTATGATCTACCATAGGCAATACGTTATGGTG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:d4f213625060
|
40 | — | — | — |
|
CTGAATGACATTCCATAGGCGTACCTGTGCGTTATGGAGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:3f26b091648c
|
40 | — | — | — |
|
TGGATAACTTAGCGTATAAACTGATCTTTACAGTTATCCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:d3288f5007c6
|
40 | — | — | — |
|
GGCAAGGTCTATAGGGTATGTCTAACGTTATAGACAGCGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:4f356ff3ad12
|
40 | — | — | — |
|
GGACGGTGACAACTGTTGCAGTAGCCTCCAGGTGTCAGGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:87828623902a
|
40 | — | — | — |
|
AACTAACACGCAATCTTAACGAAGCGGAGCGTGGGACGTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:ca516c1a273a
|
40 | — | — | — |
|
AGCGGAAATTAGCGAATTTAAGCTAATTGACTATGCTGCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:902c1bc3e94d
|
40 | — | — | — |
|
GTGTACTCCGTGAGTTACATAGGCATGGCGTTATGTCTCT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:4f1f94d5570f
|
40 | — | — | — |
|
AACAGTAACGATTGACTGTAATTAAGGATTCCTTAATTAC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:38c37ed6aedf
|
40 | — | — | — |
|
TAATCCGCGTATGCGAAGCCGATCCGCGGTTAGGGATGCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:da0388bb20a3
|
40 | — | — | — |
|
AAGTCAGAGACCCCATAGGAACCAAAAGTGCGTTATGGGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:34a879ae2963
|
40 | — | — | — |
|
CGTTTGGTAGTAGAACTTATCGTAGATGGACAGTTAGTGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:f63750c70ede
|
40 | — | — | — |
|
GGCCATTAAGACGGTACTGCTTAATGGTCTGCTCGCATCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:1c4ce738248a
|
40 | — | — | — |
|
TGGCCCTTAAGTGTAGTCTAAGCTTTTACATTAAGGGTCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:b5a9ce628184
|
40 | — | — | — |
|
TGCATGCTGACTCAGTGCTATACGGCCCGTATGCTCGTCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:1feffada356d
|
40 | — | — | — |
|
GAATAAAGAGAATCCATAGGTGTGCGTAATGGTTCGTCTT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:956bdaba3f34
|
40 | — | — | — |
|
AACACAGTGAAACAATAGGAATGCCGTTATTGTTTTTCCG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:45d885f5fe67
|
40 | — | — | — |
|
ATGAAATGCATTTATTACACGGGTCGAATAATAAATCATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:cb92e18d1f55
|
40 | — | — | — |
|
AGGCGTTACCTGACATAGGGAATGCCGTTATGTCAAAATC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:516cc06fa9fd
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCCATAGGCTGCACGTTATGGCTCGGTTTACCTGAGG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:8bc17922bfe4
|
40 | — | — | — |
|
AGGTAATTATCGAATATGTCACTCGTGTGCGATAATTAGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:18c69e3c1587
|
40 | — | — | — |
|
AATTACACGCAATAACGCAAATATAAACGCCTATTGACGC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:397d5c68e360
|
40 | — | — | — |
|
ATCGTCTGCCTGGTGACGTGATTGGCCACTGGAGCATCCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:3022ce685e01
|
40 | — | — | — |
|
ATTAACATTGGTTAATGACCTGTTAGTACTAGGGACATCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:2c452554aeb9
|
40 | — | — | — |
|
GTTAATTAGCGATACCGCAAGACGCAAAATTAACACATGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:da429ca7cf6a
|
40 | — | — | — |
|
GCTCATCAGAAGAATAATGTCAGTGTGCCATTTCCGCTGT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:719f9ac9e42f
|
40 | — | — | — |
|
TGACACATGAAGACAATATTGTGATGAACAGATCAATATT
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:5d62b2a93772
|
40 | — | — | — |
|
ACACCGATGCCTCGTAAGTTTCGCTTCTGCCACAATTACG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:a4227aee0b26
|
40 | — | — | — |
|
ATTAATTAAGAAGCTGAACCGATGGCTTAATTAATGGTAG
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:dc4a151cb071
|
40 | — | — | — |
|
AGTTACTTTAGAGTAGCTTGACAGTAACTATCAGGCCGTA
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:c32a98b1b83d
|
40 | — | — | — |
|
GTAAATTTTGGGCATGCTGCCCGGGCAATTTACATGGTCA
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:231c737d75aa
|
40 | — | — | — |
|
AGTAAAGCCATAGCATAGATGTATAGGACCTAGTGATGCC
PANAPTA:P13378:HOXD8_TGIF2:PRJEB66722:R3:05402c88027d
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final