HOXD9_TBX20
CAP-SELEX sample HOXD9_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATGACAATAGATGACACACACAGGCCAACAATGCCCAAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:25924d9141f7
|
40 | — | — | — |
|
CAAAACACGCCAAATTTCCTTCCATGTTGCACCTTAGTGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:7b953feebd71
|
40 | — | — | — |
|
TATAGCCGATTTGTAGTTTTATGTTAATTGCATAATGATT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:a29a9229d4e6
|
40 | — | — | — |
|
AGCACATGATTATCCACAATACAACATGAGGAGAAAGAGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:5199ea2ebac2
|
40 | — | — | — |
|
TCACACTTAATTATCACTCAATAACAAGTCGTAGATCACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:540a2215eb7c
|
40 | — | — | — |
|
ATCCTCTAATACTCATTAATACAATAATTGAGTACTGCAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:cd605b1cd580
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCCCTTTCCATAACAGCTAAAGTTCTACACGCCGCTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:28701c2539dc
|
40 | — | — | — |
|
TGAGCTGGCCAGATATGATTAAATTATGTACATTGTACTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:6d95da51e2fe
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCACGGGTCCGACAGAATGATTGTGGCTTACACGACC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:6c3c4887460d
|
40 | — | — | — |
|
ATCGACCCTTAGACGACGCGTTCGCACCTCGTTAGCACGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:1ebeea3059e9
|
40 | — | — | — |
|
AAAAATCCGCTTATCCTCCGCCTGTAAGCTTTCAAAAATA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:4279c82f6adf
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGTGATAACGACTAACTATAGCGCTTCATGTGCTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:86cce4b4caef
|
40 | — | — | — |
|
TAACGGTGATTCATATAAAATTTTTACATATATCGCAACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:070fd821e45b
|
40 | — | — | — |
|
TTGACACCATGTGACGATCGTTCGCACGTCATTAGCACCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:f18be43a5d4f
|
40 | — | — | — |
|
GCACGCAATTATCACCCCATTATAGCATACACCTCCTACC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:10e333303272
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCAATTAACGATCTAACACCGTTTTATGGCATTACCT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:ce77d293e0a4
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGATGACGTGTTAACGTGTCACCTGTCGAGACACAAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:d6c6efcd45e4
|
40 | — | — | — |
|
ACACCCAATCAACACTCAATAAATCACGCTCTCGCCCATC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:2dfd5947eacf
|
40 | — | — | — |
|
GAATAAATGCTTAGTATCAGGCTAGCTGGCCTAACAACGA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:4ef9a1af9f74
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTTAACACATCATAACCACGTATCCGCGTTAGAGTGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:503567ca62cc
|
40 | — | — | — |
|
CACCCTTACAACCCCTTACGATGTTAACTATGTGATAACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:d456b02ff69f
|
40 | — | — | — |
|
TTATTACACCATAAAACGCAAACGTGCTACCTCGTTAACT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:4fbdb61b1f37
|
40 | — | — | — |
|
AGCGAACACATTAACACTCAATCAAACTTTATCACACCCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:cf454154517e
|
40 | — | — | — |
|
TCCACGATTACGCTGCCTCAGTTATGATGTGATAACGACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:8d15e28384c6
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCGCAACGCGTTACAAGGCGTTAACGACGTGCTAAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:9fa2400c2166
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCAGAACCGCACCACTAGTAAGAACGTGATAACGATG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:5130b2cfea2f
|
40 | — | — | — |
|
CACGTCATTTAGAATGACTCTTATCACGTCATCAACACGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:ba0b75f60651
|
40 | — | — | — |
|
TTATCACCCAATTATCGTAACGTCACGCATGCCACAGAGG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:704ffa32059c
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCATTAACACCTAATTAACGTATTGTCACTAGATTGG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:0441a4cccd27
|
40 | — | — | — |
|
CACGGTTGTAATTTACAGTGTGTTAATTTGCGAAAAGTCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:582d6358cdaa
|
40 | — | — | — |
|
CACCAAATAAACACGTTACAGTCATTTATGACGTGATAAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:fdbf76c4921b
|
40 | — | — | — |
|
ACCACGACCTCGCACAGTTAATAGTCGCACATTAACACCT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:c02128c544a0
|
40 | — | — | — |
|
ACACATAAAATTGGCGCGTTAACACGTCGTATTATACAGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:7509b9466a74
|
40 | — | — | — |
|
CCGACAACTTCACGAAATCATTTTCACTTCATAAAACATG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:cbad6c54df38
|
40 | — | — | — |
|
TTCGACAAATTAACACGTCATTAGTTGTCGTGTGCAACAT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:88e5f68a0c13
|
40 | — | — | — |
|
CACATTCACGCCGCCGCAGGATTATGACGTGTTAGTTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:4cba1393ccd5
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTAAAAGCGTCGTAAACAGCAGTTTTACGTGCAACCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:7d93d9184fe3
|
40 | — | — | — |
|
GGTCGTTATCACGTCGTTGTAGGACAATAGGCCTTCCGAT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:9a8254e73463
|
40 | — | — | — |
|
GATCGTTAGCACGCAATTAACCTGTGAGATAATGCGAAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:5b6ee50552ce
|
40 | — | — | — |
|
TTATCACATAATTACTGCCCAACAATGTGATAACTAGACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:d43853b6eec0
|
40 | — | — | — |
|
ACTTAACACATTAGCACATCATATACCTAACACATAGCCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:4f714dc2c630
|
40 | — | — | — |
|
CAACTCGAGTTATCACGTGATAACGATCTTGGCGCGTAAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:c3fb9b5ede17
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTATCACCTCATAAAACAATGGGTAGCGTTGCGATGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:ee90fbc769db
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAAGGTCAGGTCCAAGACTAACACGTCGTTAACACCT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:8bd2e2a98d59
|
40 | — | — | — |
|
GCAATGCTCCCATTATCACCTAATAAAAAATGTGCTACGG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:ff97097871c1
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTTATCACCCCATAAACACGACCTAACCTTTATGAAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:83165555d1f5
|
40 | — | — | — |
|
TGGCTAAACTGCTCCCGGCGGTATTCCGTATTTACTAACA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:f15f490e061b
|
40 | — | — | — |
|
TTCAGTGTCGTTATCACCTAATAAGCGCGAACCAGCTGAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:bc6f956c6158
|
40 | — | — | — |
|
CTAACACGTTAACACGTGATAAAGTCGACAACAACTATCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:9a4ed96d00df
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGCCCTTGGACCGGACCGCCACGACAGACCTGACCCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX20:PRJEB66722:R3:a2f012264b15
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final