HOXD9_TBX4
CAP-SELEX sample HOXD9_TBX4; Mixture-SELEX sample HOXD9_TBX4 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTATAGTTCACGCCTCACCTAACGTGAGGTGTCGCTGCGA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:759973302046
|
40 | — | — | — |
|
TACCCGTCTCACACCTCACCTGCACTTGAGGTGTGACATG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:1130742c8392
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGACGTGTCACTTTTATTGGTGTCTCGTAAACTGCCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:6031a565093f
|
40 | — | — | — |
|
ACGACCCTCACAGAGGTGTCGCGTAAGAATTCACACCTCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:3c70fe0ee7b1
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTGACGTGCCAACTTTCACACCTGTGACCAGCGCATA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:e25d21b24da7
|
40 | — | — | — |
|
ACTTAATATGATCACACCTTCCTCCAAGGTGTCACATGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:be9d3b65ec65
|
40 | — | — | — |
|
TCACACCTCACCTACGGGGCTAACACGTCACCCCCCACTT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:e7ed3b71a265
|
40 | — | — | — |
|
TGGCCCTGGAAGGTGTCGCTGACACCTCACCTCTTTTCAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:d213324de760
|
40 | — | — | — |
|
AGGCGTCACAATTCACACTTCACCTTCACCAGTGTCACCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:7b4f3c74b1fa
|
40 | — | — | — |
|
GATAATCATATCACACTACACCTGTTAAAGGTGTCGCCAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:106fbc8a31f5
|
40 | — | — | — |
|
CACACGCCACCTAGACCTGACGTGTCGCGTCTAACACCCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:98207a399cd5
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGTGCCACTTTTCACACGTCACCTCCAAGCGCCCCAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:98306425534c
|
40 | — | — | — |
|
CCAACACCTTAGTATAGGTGTCGCGTTTCGCTCCACACCT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:5b3d31350f91
|
40 | — | — | — |
|
GACACCTTCCGTAAAAATGACGCGTCACCTTACGTTTCGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:461496212a49
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTAAAGGTGCCAGGTTTCACGCCTCACCTTGCACTTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:3a141d0581f5
|
40 | — | — | — |
|
TCACTACACCACGCATCATTAAAATATCACACCTCACCTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:d7bcae0f70e1
|
40 | — | — | — |
|
GATCACGCGACACTTCGCGTGATTAATTCACACCTCGTTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:b6a5c722de60
|
40 | — | — | — |
|
CGATCGTGCCCTCCCCACACCTCGCCCCAGGTGTCGCGAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:86ffa51b94c2
|
40 | — | — | — |
|
TAACACGTCACTTTACACCACGGCATAACACCTCACCTGT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:61c6a147647b
|
40 | — | — | — |
|
AAAACACCGCGACACCTCACCTTCTCGCCCCAACACCTAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:d498a246c2ee
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTATCCCATAAAATTCACACCTCACCTATCCGTCAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:b14a96a97e67
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCATAACACCTATGTTTACGACCTCACACCCTGGTAA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:1d319e69656f
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTTAGTCATTACTCACACCTTCTCTGCAAGGCTTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:d22f279a1452
|
40 | — | — | — |
|
TATGCCCAGGTGAAGTGTGAAACATAGCACATCACCTAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:e77f9887d40f
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCACACCTTTCGCGCGTTATGACACATCATTAATGAA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:f6c8bc826073
|
40 | — | — | — |
|
GCTAAGTAACACCTCACCCTATCACCTCACCTCGGCCCGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:ac04c9b2fb87
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAAATCGCACGTCACCTTAGGCTCGCCGACACCATTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:46832178d9d5
|
40 | — | — | — |
|
TCACGCGACACCTCTAGCAACCAACACCTACACCTACGCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:4dc681673f31
|
40 | — | — | — |
|
TACCGCCACCTGTCCCAAAGGTGTGATTTTTAGCACCCGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:011faeffbba8
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTCCATATGACGTGTTAATTGACGTGTGCGACCTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:8fccdf8f9e82
|
40 | — | — | — |
|
ATCATTAGGTGACACTTCTGTCGCCTCACCTCCATGGGGT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:943f1d8e516a
|
40 | — | — | — |
|
AACACCTCACCTAATTAAACACTCGTAAACGCTACATAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:45c0d09c1a3e
|
40 | — | — | — |
|
CGAAGGCGCGGCACTTGACACCTCACCTCAGCAGTTTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:2cf188e1fc8a
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTTACGTGACAACTCTCACACCTCACACTCCATTAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:d6976f3d8079
|
40 | — | — | — |
|
CCCCACACTCACCTATGCCTCACACCTCACCTCTGGACAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:06d736f921e7
|
40 | — | — | — |
|
TACGCGACACCTCTTTCTCACACCTCACCTAACCCCCGAA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:c7f40806b259
|
40 | — | — | — |
|
CGTCACGTGACACCTAACACCTCGTAAAGGCCTAATCGCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:da38e58a1f5c
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCGTACCAACTTTCGTAGGTGACGTGCGAAATGCAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:8ff1ea764986
|
40 | — | — | — |
|
AAACCGTAAAACACACCTTTTCTTAGGTGTTGCTAGCGAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:685d87c54bd6
|
40 | — | — | — |
|
CACTGACACCTGTCACCTCATAAAACCATGCCTTCACCAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:9d1021176fbf
|
40 | — | — | — |
|
CTCGCTTGCAAGGTGCCAAATGCTACACCTCCTTCTTCGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:7b6556703d2c
|
40 | — | — | — |
|
GTCACTTCTAGGTGTGACAATTGGGTAACACGTCATAACT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:e38c8bf6d258
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGTGTGACGAAACTATCACACTTCACGTACTCATCCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:11d6bd5e3424
|
40 | — | — | — |
|
GCTAGGTGGGAAATATGACACGACACCTTCCCCCTTCGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:680d42a0afee
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGCAAGTAGGTGTTACTAATTGATCACACCTTCTTCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:a372df571e37
|
40 | — | — | — |
|
AACACCTCACCTATCGCGACACCTCGAACTCGCAGATACC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:03043083e5b4
|
40 | — | — | — |
|
GAGGACGAAGGTGTTACCCGACCTCACACCTAAGGCACTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:311e95f94e3f
|
40 | — | — | — |
|
GGACGTGATTAAGGTGTGAAGATTTTCTCGCACCTGTACT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:bfe56d60579f
|
40 | — | — | — |
|
GATGCACTATAGTGAGGTGTCACCTCGCACTCACACCTAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:8aff8799a174
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCACCACGCGAATCCCGGCCCGGCTTCGCCACCTAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TBX4:PRJEB66722:R3:ac3cd704f284
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final