HOXD9_TGIF2LX
CAP-SELEX sample HOXD9_TGIF2LX; Mixture-SELEX sample HOXD9_TGIF2LX · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CAGTGACAATAAAACTGTCACAGCTGTCAGAGTAATGCGA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:408ce07a9ef4
|
40 | — | — | — |
|
AATTAACCTGTCACCGACCTGTCACCACTGTCCACCACAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:df0d99143f3b
|
40 | — | — | — |
|
ACATAACTGTCAAGCAATGACAGCTTTATGACGGCTAGAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:351374123c70
|
40 | — | — | — |
|
ACATTGCTGACGTTTTTACGACCTGTCATCGAGACAGCTG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:298f17afcdf8
|
40 | — | — | — |
|
GTCAACCAGTGACAGATTTATTGCTTACACCCTTGGCACC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a9f80205733b
|
40 | — | — | — |
|
GACACCTTATGACAGTTTAATGACCTCCGCCAGTCGTGAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:f26a7ef6d41c
|
40 | — | — | — |
|
ATATACCTGTCACTCATCTGTCACTCGTGCCGCGCATGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:9779bf4f4487
|
40 | — | — | — |
|
TGACAGGTACATTTGACAGTTTGATGACTACGGCTGTGAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7b155765755c
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCACGCACTGACAGATCGAGTGACAGTTTTATGGTAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c8178145a526
|
40 | — | — | — |
|
GGGACCTTCCCCACCGGCAATAAATCTGTCACGAGCTGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a90fca16cee4
|
40 | — | — | — |
|
GTCAACCCTTTCATGCTCTGACAGGCTGAGGATCGCAAAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:e83d8430e1ea
|
40 | — | — | — |
|
TCTTGACAGGCGTTGACATTTTTATGACAGCTCCTGACGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:552fee213ebe
|
40 | — | — | — |
|
TGACACCTGTCATACTCCGCATTGACACATTTATGGCTAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:192db858fef3
|
40 | — | — | — |
|
AAACCCCCTGTCACATTCCTGTCACCCTCTGACAGCTGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:4925cfa7539a
|
40 | — | — | — |
|
CGATTCCCTAGTGACAGCCCATAAACCTGTCACTTCGCTA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:1d01c753814e
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGTACAACGATGGCTAATAAAACTGTCACGACGTGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:16974eb7e97d
|
40 | — | — | — |
|
AGGGTCGTAAATCTGTCATTGAACCGTATGCCATGACAGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:48e511f68dc5
|
40 | — | — | — |
|
CAATAGCCATCAAACTGTCACTCCCTGTCAACTCCACCTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:6f9ed63af047
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAATGTGACAGCACCTGACACCCATGACACATTTAAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:923ce2f6a47d
|
40 | — | — | — |
|
AATAAAACTGTCAACTTTCTGTCACTGTCACTAAAGCGGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:074de9c6ff06
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGTTCTACGCCTGTTGACAGTTCCTGACAGTTTAACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b6923690743c
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGACACGACAGGTGACAGTTTAACGACTTTACGCCCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:5dcabe3d4aa3
|
40 | — | — | — |
|
GTCACACATGACAGTTTTATTGACCCACACCTTAATACCT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ef5915876f72
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGAACCTGTCACACTCTTGACAGGTGACATCTGCATT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:8efbe21b1dc2
|
40 | — | — | — |
|
ATTCCTCGTACTCGCAGTTTGACAGCCATAAACCTGTCAT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:a4315c8ab266
|
40 | — | — | — |
|
CACCAATACGCAACTGTCAAGTAGTGATGACAGCTGTCGC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ba059d66d029
|
40 | — | — | — |
|
GCCCTCGCGGTGTCAGGCGGCGTTTCACGGAGACACCGCG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:75d0dff4e93e
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGGTTCGACAGTGCTGACAGTCCGTGACACTTTTATT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b3b684d0dc97
|
40 | — | — | — |
|
ATATTCAATGTGTAGGATGACAGGTGACGTGACATTTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b15d9a749a08
|
40 | — | — | — |
|
TGTCATCCATCCCTACTGACATGCCGGTAAGTCTACCGCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:d760f7679eae
|
40 | — | — | — |
|
GTCACAAACTTACTGACAGCCCTACTCCCACGTGTCGCCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0fb144953af9
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAAACACGTAGTTAAGCTGTCAAATGCGTAGCACTGA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:355d147a6e5e
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGCCAGAGGTGGCATACCTGACACTGACACATTTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:47b3e54be405
|
40 | — | — | — |
|
CGCAAATCGTCGCTGTCACACATGACAGGTTTATTAGCAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:977c68622ca7
|
40 | — | — | — |
|
CCGTGTCACACCTGTCACGGCCTGTCACGATGAAACTGTC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:064afbeb8696
|
40 | — | — | — |
|
GCGTACATTGTCAAACCTCTCAATGTTTGACAGATTTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:36513e269bac
|
40 | — | — | — |
|
CTTGACAGCCGACACATTATTCTGTCGCTGTCACGCCTGT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b39d3f771593
|
40 | — | — | — |
|
AGCGAACCGTTAAAGTGCTCATGCCCATTCGCTACCCAGG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ef38aa95bca4
|
40 | — | — | — |
|
CCATAAATCTGTCACTTCCCTGTCACCAACACACCATACC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:d359b6313005
|
40 | — | — | — |
|
CTAACGATCAAACTGTCACCTAGCTGTCACACTACGGGCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ada9a7106651
|
40 | — | — | — |
|
GTAAATACGTCAACCTGTCAACGTACCGCTGACACAGCAA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:e6528fbc7191
|
40 | — | — | — |
|
ATTATCCTGTCAAGCCCCCAAGCGTATTGACAGCTTTACG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:f49d94d50aa2
|
40 | — | — | — |
|
GCTGTCATCAAATGTCACCGAATTGACAGTGCAATGACAC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:785253e36ba1
|
40 | — | — | — |
|
AACCGCGATGACAATCACCATTGACAGCTATAAGCTGTCA
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7c6d498a56fe
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGCTGTCACCGCCCTGTCACAGATTGACAGCTCATCT
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:dd24593cc9cf
|
40 | — | — | — |
|
GTCACCCCTTGCCCAACTTGACAGCCGATAACCCGCAATC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:bcae0037f505
|
40 | — | — | — |
|
GTTTCAGCTGTCAGATGCAGGTCAAGTGACAGTTTTACTG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:bb62bf46284f
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAATAAAACTGTCAACTGACGGCACCATTCTCATGCC
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:59f90ee239aa
|
40 | — | — | — |
|
CCGTGTGACAGGCGCTGTCAACGACATGTAAAGCTGTCAG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:6b79ed3731bf
|
40 | — | — | — |
|
CGCACGCTTGACAACACATGACAGCTTAATGACTTGCCTG
PANAPTA:P28356:HOXD9_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0461789ba948
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final