IRF8_MSX1

CAP-SELEX sample MSX1_IRF8 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000

Top enriched selection-pool candidates

Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.

Candidate data via API →
Candidate sequence Length log2 FC Class Monotonicity
CACACAAACTAATTGCGGTACTACAGCAATTAGATGCACC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:641678ddaaea
40 — — —
CCGCCTACTAATTAGCAAAAATCCAAACTAATTAGTGCCA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:f9686a500e7d
40 — — —
GCTGAGCTATGTAATTAGTCGTCATACGCTAATTAATAGT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:04a1898451f6
40 — — —
AGCCACATGAAACAGCAATTATGGGACGATAATTGCCAGA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:5cfc5f69b623
40 — — —
GGTTTGATTAGCAGGATGGCTTTTAATCAAACGACATGTA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:08fe3754d5ef
40 — — —
GAACCTAATTTGACCGCATTACGGCCAATTAGTAGTATCT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:693fbb58a462
40 — — —
GAACTAATTATCGGCACTACAGCAATAATTAGCGTGCCGC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:0161bb4d84c6
40 — — —
TGCCAGCAATTAACAGTGATACTTAATTGCCGGATCAACC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:5d0ca1acf7f7
40 — — —
ACGCTCTAATTGGCATATGGAACCCAATTAGTGCGCATAT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:5a2021f0e038
40 — — —
CACGACTGGGGTGGCAATTAGCCTACGGAACTAATTGCAA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:67b8c792e4b2
40 — — —
CGCAGTCGGCACTAATTAGAGTGTCAAGTCTAATTAGGAA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:a8620c77ceed
40 — — —
TGAGCGAAACCGAAACCAATTAGCGTAATCTTGACCCTTC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:b05fec79af88
40 — — —
TGGATAGGATAATTGGGATGCTGTGACCAATTATGAGACT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:fc54885e2fb3
40 — — —
CCACATGACGACTAATTGCATCCAAGATGCAATTAGGATG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:039989c64c26
40 — — —
TACGCTCATTATAATTGGTCATTGATGCGCCCAATTATGT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:ff4a9c91dfbb
40 — — —
CGTATAATTAGGCATGCAACCTAATTATGTGAGTACCAAA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:de677ed77219
40 — — —
CGCTACTTTATTGTAATTACGTACCCGCACGGTAATTACC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:f4cc549d1993
40 — — —
CGCGTACCACATCCAATTAGCCCTGCCTAATTGCATAATG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:2bd2fb1b3eb3
40 — — —
TGCCACGCAGCGAAACTGAAAGTGCAATTAACCCCTAACG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:945337f4c247
40 — — —
GCATGTAATGTGTCACGCGATGCCAATTAATGCCATGTAG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:e5365c69168f
40 — — —
GCGCCCCCCATCTAATTGCATGCGAGGGCAATTAGCGCCC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:ca41095725cb
40 — — —
TCTAATTAGTGAAGTGCCCTGACCTAATTAGCAGGACTCA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:e2f741f26115
40 — — —
CACACGAATAATTAGGCACACCTAATTATCATGAAATCAC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:e4f84d0e3894
40 — — —
GACCCAATGACTAATTAAGTACCGGATTAATTAGCTAACG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:875b025151d4
40 — — —
CGAAACTGAAACCGTGACTTTGCGGCATAATTAGGCCTAC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:ad70ff7a87f0
40 — — —
GACCAGGTCACAATTAGGACGCACATTCCTAATTGATCAC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:c29b1bb8e639
40 — — —
CACAATACCGAAACCGAAACCAGGATAATTAGACGTAATA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:28b3957d5559
40 — — —
GCGTAATTAACTTCAAATTAATTACGCAAATGGTGAGTAG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:ddae6631479e
40 — — —
TTGGGCAATTAGCGTCTACGGCAACAACACTAATTGCACC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:12ea1f85559a
40 — — —
CCGTCATCACTTACGAAGTGAAAACCGAAACTAATTAGCG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:723d050d13fa
40 — — —
ATACGTAATTAGCATGCAAATGATTTGCAGTAATTACGTT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:d01dc2613cf0
40 — — —
AGCGCTGCTAATTACGCAATTGACTTTCGTAATTAGTTCT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:13606b2732b3
40 — — —
TTTAGCACCAATTTCAATTAGCCATACCTGCTAATTGAGC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:00cb24ce1382
40 — — —
ATGTCAATTATCGAGATTAGCTTATAATTGACCCATCATT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:24d0d8877790
40 — — —
ATACACCGAACAATTATCGACCCGCACATAATTGATGAAG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:b3bd7c8d9943
40 — — —
TACCATTGAGTAATTAGCCCTCCTTTCTAATTAACTCATC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:ad1623fe596f
40 — — —
GAGCGCTAATTACAGTTCAGTAATTATGCCCTTACGTAGT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:109a5b92cf31
40 — — —
GCGACCACATTAGCCGAACGACTAATGAGGCACGTGAACA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:e3a4478e2090
40 — — —
ACAGCGTTAATAGCGTACCCGGCAATTAACGTTCGATTAC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:9883dcd1bf4a
40 — — —
AACGCTAATTGCTTCGAATACACCAATTAGTCGATAACGA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:bc77a4605bba
40 — — —
CAATTAATGCCGTCCAAGCAGCATGTAATTTACGCACGAG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:240acd965f31
40 — — —
AAGTGCAGCCGATCTAATTGCGTGATTGCGCGCAATTAGC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:7c8e72be1d6b
40 — — —
CGTTCTAATTAGGCAAGCTGCCTAACTAATTAGATCGCCA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:fbc90c9f0f3f
40 — — —
TCTTGCGCACTAATTGATGATCTCCCAAATGCAATTAGTG
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:3692c451ee4e
40 — — —
GATAACCGCGAAACCGAAACTGTTGCCAACGACCCTAATT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:918a84bd5173
40 — — —
TGCTAATTGGTTAAATGCCACACAATTAGGCATGCACGAA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:7b2f671eead7
40 — — —
CGAAACCGCTACCAACCTTACAAGTAACACGGCTAGTTTC
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:5c9bc97b2621
40 — — —
GCCTTAATTACGACGCGTAATTACCGAGCCATGGCAAGCT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:ff6da6feec05
40 — — —
GACTGGCTAATTGCGAAACTGACAATTAGGACAAATGAGA
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:1d6d26ca1890
40 — — —
TAAGACTGCTAATTAACGTTTCCGATAATTACGCACCGCT
PANAPTA:Q02556:IRF8_MSX1:PRJEB66722:R3:6fd7feb88609
40 — — —

SELEX rounds

R3 ·final