IRX1_TBX20
CAP-SELEX sample IRX1_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTAACCTGTTAACACATGACATGTTTCCACTTGTTAACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2596b5ec6de0
|
40 | — | — | — |
|
TTACCACTGTTGGTACACACGTCAACACGATGTTCGACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ae6d1c110f66
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTGTACATGTTAACACTCTGTTTTGACATGCTAACAT
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:7aa92714ee6a
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCATGTGACACCGTAACACGTGTTTTAACACCTAACG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:f054f79668d5
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTTACATGTTCACAGTCTTGTTCGCGACTTCGCGTTC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:11436633b001
|
40 | — | — | — |
|
TGTCCTATCAACGTGCTATATGCGACACGTGTTCTAACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0686cabf9c3c
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACTTCCTTGTTCACGCTTTCACAAGCCATCTTGTA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:44230f4d3cb0
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCCCTCTAACACGTGTTAACTGGTGTGATATGACACC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a7c9a8bba58c
|
40 | — | — | — |
|
TAATCGCACTTGTTTACGTGTTATTTGCTGTGCATCACGC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:8ffb5ead1d6d
|
40 | — | — | — |
|
TGGTACATTGCTTACACATGTCAACACCTCAACCTTACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:af19bba79435
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTTACAACGTAACATGCTTACATGTTCGATTTCACGT
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:4115ce44124e
|
40 | — | — | — |
|
CTCAAATACACGTGTAAACTTGTCGTTACATGGTGCCGAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:42a3c02eaea3
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTGTCCGTCACTACACGTGTTTCTACGATATCACACC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:0f56d4cf9514
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGACCTGTTATGTAGCAAATACATGTTGACGACAACA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:023271e5d681
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAACAAGTGCCACGTTTACATCTGCTCAACTTGTCGC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:383ee8663041
|
40 | — | — | — |
|
TTAACCTGTTCTCATTCTCGTGATACATACACAATGACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ea16aa92b57f
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGTTAACACGTAACACGATGACACGCCCACTCAACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:d1dfd9bc858f
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATTCACACCCTTGTTTCGCGCGCTAGTCGTGACACC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:e1bdd462a0a4
|
40 | — | — | — |
|
AATGGACATCGCTCTTCACACCTACGTACATGTGAACATG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:b821b3b062e8
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGACATGCTAACACGACATTTGCCACAACGTCATAAT
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:b40eb01b589c
|
40 | — | — | — |
|
TTGTGAACTTGTTCATGTTTTTACACGTTTACGCGCTTCC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:2967157b8a60
|
40 | — | — | — |
|
TATTACGTTGTGATTCCGTTACATGTGTTAACATTGACAT
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:66ce2a5e40f9
|
40 | — | — | — |
|
ACATCCAGTACCACTAACACGTGTACTCACACGTTTGCAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:65ed11adccbb
|
40 | — | — | — |
|
GTGACGTCATGTTAACATCGCCTCGACAGCTTTACAACCA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:4ddd10c26948
|
40 | — | — | — |
|
TTGTAATCTTGTTGTGATACGATGTTATGGCGCGAAAGTG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ca6e63037a22
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCCGTGTTCGTTATGGCGTTAAATTACATGTTACACG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:cac427cb3375
|
40 | — | — | — |
|
ATGGTGTGAACGTGTTTACATGTTACCTCACTATCGCACA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:b90048609305
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTGCGTTAACGTGTGAACACATGTCGCGTTATGAGAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:f999e8822609
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTGTTATACAAGAGTGACTACATGTCAGTTAACACAG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:df9318e72c93
|
40 | — | — | — |
|
TAGCTACTTGTTGTATATCATGTTCACACTGTTCACGCTG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:4fcb69ef817f
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGTGTTTACATGCAATGCCACATCCTCTAGTAACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:84f584e06333
|
40 | — | — | — |
|
GACAGCCTAACACGTTTGCAGCTTGTAAACACGGTGCCAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:3f518bfbc25c
|
40 | — | — | — |
|
TTACAATGCGCTAACGTGAGACTTCGTTAACATTTCACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:1a249ac6bb21
|
40 | — | — | — |
|
TTCGTGTCTTACCAGTGTTACACGTGGTACACTATGTCAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:64b386b3bf9a
|
40 | — | — | — |
|
TACGCCACGAAGCTAACATAATAACACAACACTTTGACAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ef372bd134f1
|
40 | — | — | — |
|
ACATTGCTTGTTTACAACTTCACAACCTTGTCAACTTGCA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ef9a3db5ca4b
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCAGTGTCAAGATCATGTTAACACGCTAACGACGCAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:cf71578f65d5
|
40 | — | — | — |
|
GATGTTAACGTGCTGTGGCATGTTGACACGTTGTCAGCTG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:f67862450291
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAACATACGCATACGTGTTGGCACGTCCATTTGCCAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:57952d8833e8
|
40 | — | — | — |
|
ATGTTGTCATCGCTGTTATGTACACGTGTAAGATCGACGC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:3f34d7b49093
|
40 | — | — | — |
|
TGATAACATGTCAATTATTCTCCCGTTAGCTTGTCATGTA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:ef21bdc9e776
|
40 | — | — | — |
|
TTACCATAAGCTGATAGTGTTAATGTGGTTGTGTTATCAC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:bfe4d08c1c1a
|
40 | — | — | — |
|
TTAACGTCAAGATAACATGCTGCTTAAACTGTTATCACGC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:16c46cf66bd1
|
40 | — | — | — |
|
CCGACATGTAAACACGTTTTGTAGAGCGTTAACGCGTCAA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:a121427360b2
|
40 | — | — | — |
|
TTAAGTGCCATGTCGGCAGGTGTCGCATGTAAATTCGCGC
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:eee3bc5a936f
|
40 | — | — | — |
|
TTATCACGAACAAACACGTGTTCGATGACTTGCTACCACA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:4538d3e1b66f
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGTGTGCATAACGATGTTACACGTCGATCAACACGTT
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:d024d29223bb
|
40 | — | — | — |
|
ATCTCGTTATGTTGTTGTTGTTAATGAGACATGTTGTCAA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:94552b01a71a
|
40 | — | — | — |
|
TACGCTACATAGTGTGTGTTGTTAACATCCTAACATGACA
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:07a5a7bc488f
|
40 | — | — | — |
|
TCACGCCATCGCGCCGTGTACATGCAGTGATAATAACACG
PANAPTA:P78414:IRX1_TBX20:PRJEB66722:R3:fc6483cbd3c7
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final