IRX5_TBX20
CAP-SELEX sample IRX5_TBX20 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCAAAGGCGAAGGTGTTTATGTTCACACTTACATCAACAG
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:60791e7f17c3
|
40 | — | — | — |
|
CCAAGGCGTGAATCTGTGAACATGGAACACACTTAAGCAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:4a9623d40df4
|
40 | — | — | — |
|
TCAATGACCCAAAGTGTGAATGTTTACACCTCGCCACAAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:460795d2bfe5
|
40 | — | — | — |
|
CTATAACAACCTGCGAACATCAACACCTTGCCGACCTCGG
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:c73a8940ca19
|
40 | — | — | — |
|
TATGGTAGGTGACAACACAACACCTTCCGCCTACCGTTTC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:77aae3adea53
|
40 | — | — | — |
|
GGCATGTGAAGTGATAACACGCTAACTATAGTGTTAACAT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:bef2cab6a979
|
40 | — | — | — |
|
TGAACATCTAACGCCCTAACACCTTTAAAAGCGTGTACGT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:28c2e3ab9246
|
40 | — | — | — |
|
AGGCACGAGGGTGTGAACATGCAATGGTAAGCGCGAATTA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:fc2514e3acf2
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAAGGCGTGATATGTTAACACCTCGTTAATTGTGTTG
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:8517028128a5
|
40 | — | — | — |
|
ACATGAGTGTGAACATGGTTCCATGGTTGACACATTTACA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:c8ed2f50b27b
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAAGTGTATTCACAGGTGTGAACATGGTCGTCAACAT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:9db621d4aa91
|
40 | — | — | — |
|
TCAGAAACAGGTGTAATGTTCACACCTTGTCCATCGCATA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:1ad4ff8bf841
|
40 | — | — | — |
|
ACATGCCTGGTTACAGTGCTAACACTAACACCTTTCAGGT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:e7e2f4332bc5
|
40 | — | — | — |
|
ATGTTCACACCAAGAAATCCTGTTCACACGTGATAGCTGT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:b605da4eb470
|
40 | — | — | — |
|
CAGTAACAAGTTCTCACCACTACTCGCAAGGTGCGAACAA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:40e022c320d9
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGTAACATGACGCGAATGTGTTAACTAGGTGATGACA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:33fbca94c372
|
40 | — | — | — |
|
TCAGTTGTAGCACTTACGAACATGTGTTCACACCCTGACA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:af8e73b305f4
|
40 | — | — | — |
|
ACGAACATGTGTTAACATAACATGACACTTCCTCCGTCAA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:868a76815232
|
40 | — | — | — |
|
GAAAAGCGATAAGTGTTGATGTTCACACTTAAACGCGGGC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:53b94c9d5249
|
40 | — | — | — |
|
TTAACAGGCTCAGGTGTCAATTGTTCACAAGTATTAACGC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:4104c140acef
|
40 | — | — | — |
|
ACCTATGATGTGTTGAGGCGAGGTGTTAACAACATGTTAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:08d5bff41e1b
|
40 | — | — | — |
|
TTGTGAGATGTTTCATACGTGTCCAAGTAGGTGTTAACAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:35d40b389c8e
|
40 | — | — | — |
|
CGAAAATAAGTTGTGAACATGCAATTCACACTGTCGTCGC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:cdcd2e3d8ee1
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGTCCTGTAGCACGTGTTAACGTAAAGGTGTTAACAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:4bd599748873
|
40 | — | — | — |
|
CTAAACTTGTCATGTTAACACACTCCTGCAACACGTTCAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:e719e6e12f0b
|
40 | — | — | — |
|
ATAATGATCGTGCCTTTGTGTTAAACACGGGTGTTAACAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:ec92866a0a3e
|
40 | — | — | — |
|
AGACGCATACACGACTTCTCGTGTTCACACCTACAAGGTA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:36fb95917c7d
|
40 | — | — | — |
|
GTTTTAAGTGCGAACTATTCACACCTCAACAGATTGATGT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:2f2d32713c8f
|
40 | — | — | — |
|
CTAAACCGTGTTCATGTTAACATGAAAATAAACACGACAA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:570c9743398a
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAACACCCTGACACCTCGATATTGCGAGGGACACACT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:d91985b50190
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGTCACGCTGAGAAGTGCGAATCATTGACACATTATC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:7f7bb12d909c
|
40 | — | — | — |
|
GGAATGCAGAGCAACGAAGGTGCGAACATTAACACTTTGG
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:dcb71f98a245
|
40 | — | — | — |
|
CGAACACTAATCACCTTCACACCAGATAGTGTTAAGTACA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:e679817c5bbf
|
40 | — | — | — |
|
GGAACACAGGTGTTAACAAGAGATAGTGCCGCGTTGACGC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:050727a2753b
|
40 | — | — | — |
|
CTCACTCACTAACGATACATCGATAATAGCATGTTAACAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:699c29cf05ea
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAACACGTAAAAACAAGAAATTACATGTACAAGACGA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:59543a15dd71
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGACGCGTCAATCATCAACACGTAAAGGTGTTAACAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:d32658b85907
|
40 | — | — | — |
|
CTAAAACGAAGTGTTAACACGTAACAACAACTTCACTGTT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:1e7fcf3d77d4
|
40 | — | — | — |
|
TCATTAACAAGTCTTCGACATGAAAAATCATGTAATGACA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:719200561074
|
40 | — | — | — |
|
TCCAATTGGACGTAACAATGTGAGAACAGCAACACCCTAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:408daadd9c1b
|
40 | — | — | — |
|
GTGACCGTGTAAAACATCTAGTTAACGTGTTAACATTTCA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:571e47290743
|
40 | — | — | — |
|
GCTTGCCCATCCGTAATACGAGGCTACAAGGTGTTAACAT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:4b56af5fae9c
|
40 | — | — | — |
|
TGTAAATGATTACGTGAGAACAACCTTCATCATGTTCACA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:9670d056ce32
|
40 | — | — | — |
|
TCAGGTGCGAACAGCGACACCTCACCTCCCTACTGTTAAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:2f1285fa7b5b
|
40 | — | — | — |
|
CGTTAACACAATGATCTCAGATTTCAACACGCGTTAACAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:7c5d82d4b372
|
40 | — | — | — |
|
TTAACACCTCACACCTTAACACCATGGCGCGACTACAAAT
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:136dcef34797
|
40 | — | — | — |
|
AGATTACGTGTGAATTATTGACACCTAGTGTGCGAAATAC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:b8ab17eac7d7
|
40 | — | — | — |
|
TGTGGAACACCGCGATGCAGAGTGCGAACATAGACACCTC
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:7c3e25edb837
|
40 | — | — | — |
|
TCAACACGTGTCAACATGTCTACAAAACACCTTTTCGGTG
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:ee2e467a6757
|
40 | — | — | — |
|
CAAGGCGTGAAAGCGTCAACATGGCCTCCCGTGTAAACTA
PANAPTA:P78411:IRX5_TBX20:PRJEB66722:R3:f22be48045f8
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final