ISX_NKX2-3
CAP-SELEX sample NKX2-3_ISX · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CAAACAAACTGAACATTATAACTTGTCACACTTCCAGAAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:7aeb6876a977
|
40 | — | — | — |
|
ACCCACCCGTATACCCGTCCCGTCTTACCTGCTGCATTAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:f66c1db4f954
|
40 | — | — | — |
|
ACTACCATACTGTCCCCCCTTTGACTCGCCCTTCCCCATC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:2b6866e800c5
|
40 | — | — | — |
|
CACTCCCGGCCATGTCCCAACCGCGCACTACATACGCCCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:16ee9fc77f56
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGACCCCCCACCCCGCCCTGCCACCTCACCAACTTCT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:abb0561989ef
|
40 | — | — | — |
|
GCTCACTCAGTACAACCCTGCCCCCTGACCACCAATGAGG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:bcacd85bfd1f
|
40 | — | — | — |
|
CCTTACTTGCTAACGCAGCCCCTGCGTCCGCCAGTGACTC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:42ed80dfe91a
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTGCTACCTTTGCCCCCCCCACCCCTCACCGCCATGC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:f6039a99d1a7
|
40 | — | — | — |
|
CACACACCCGCTATTCCCCTCGTAATACACCCCCCTCCAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:c1e01ba193cd
|
40 | — | — | — |
|
ACCCTCTTGTCCACCCCACCATTGCCCCCCCGTTTGGCCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:0e6af667172e
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCTTTCCTTACCGCATTGTGTGCGCCCACCGTCCCAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:1b29cf8a701d
|
40 | — | — | — |
|
GGCCAACCCGCGACCCGCGCATTCTCCCCGCGCGATCTAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:9e6092917580
|
40 | — | — | — |
|
CACACCACACATGTCGCACCCCCACATCCACACCCCTTTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6728d69c7c34
|
40 | — | — | — |
|
AACGTAACAAGCACTTAAGCCCATTATGACCGAATGCGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:25a90a61a6a0
|
40 | — | — | — |
|
CCCACACACTCAGACCAATTTATTAGTGCCTCATCCCTTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6b5bf60b3892
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATTGCATTTTCGAAACCATACAACGAAGACACTAT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:33615e5bc34e
|
40 | — | — | — |
|
ACACACATGAGTAGCCCTAATTACGAGGCAATAAGCATCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:b0419a28d176
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTACATCAAGTGCCCAATTCACCTTTGTAATTGCGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:dd2873a3f474
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGTGAGTATGCAATTAGTACGTACTAATTCGTGATT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:258c18edaa12
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCAACACATCTTATGATTGCACGAGACGCGATGCCTC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:f8010e8b7016
|
40 | — | — | — |
|
AAGCTCCCTAATTAACAAGGATGCTTAACTCCAACAGCAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:931afa10760a
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTTTTCGTTACAAGTATCGCGTCTAATGGCCCTTCCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:a4991f0d0a90
|
40 | — | — | — |
|
AGGTCCGCACCCCCTCCCTATTAACACGTCATTATAGTCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:036b442643cc
|
40 | — | — | — |
|
ACCATTACTTGACTGAATGAACACGTATAATTGAGCGTCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:741826824e6d
|
40 | — | — | — |
|
ATCCAATTTGTCCTCGTTACCCCGTACACCACTTACGCGT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:21fcb5c6a1e9
|
40 | — | — | — |
|
CAACGTAATTACGGCATTTAGGCAAAATTAGGGTTGGAAA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:78acf4042c7b
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACCGAATTGTCATTAACTAATTTGAGCCCAACACCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:2e0df7328185
|
40 | — | — | — |
|
CTCCTTCGTGATCTGGTATATGATATGGTTTCGCCACCAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:63f525ec9450
|
40 | — | — | — |
|
CTTGCGTAATTAGCCACCGCTAATTGCCCAATTACTAGCT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:92c0ebac4276
|
40 | — | — | — |
|
ATTGCCATGACGCTAAACCGCGCGCTTCATCGCGACGTTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:cfdefa02e461
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGCCCCGCCTTAATTGCGACTAATGATGCAAACCTAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:2740be9572f2
|
40 | — | — | — |
|
ACCATACCAATTCTGTCCATCGACGAGGTCATCCCTAGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:263e198b567e
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCCTGCTACGCCCACATAGCTAAGTGTGCCATTACCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6afbc12f003a
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCAATTACGGTTTTAAATGTAATTGCGAATTGAACTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:7d9b93c16cd9
|
40 | — | — | — |
|
ATTGGCGTAGCACATCACGCACATAGCACTTAACCTTAAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:a3543dd3268e
|
40 | — | — | — |
|
CTCCACTTCGATACCTCCTTGACTCAAACCCAATTACTAT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:966dd0e47e3c
|
40 | — | — | — |
|
ACCTACCTATGATGCATTAATTGGCATAAATGCCAATAAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:8ae2f32da1aa
|
40 | — | — | — |
|
CCACGCGTGCCACTTACCTACTTACTCGCCCAATTAGCTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:d0bfb1a91303
|
40 | — | — | — |
|
ATGACGTACTAATCACTCTCCGATTAGCCTATTGTGCACA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:8bfb663668b4
|
40 | — | — | — |
|
CCTATTGCACCGCCCTAATTACGTAATAGCACGCGCGTCG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:e7c7a023931f
|
40 | — | — | — |
|
ATCACCGTTTGTTGCCTAAGCTAATTGCAACTACGTGGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:f32025cb92f4
|
40 | — | — | — |
|
TGATACCAGTTAGCACCGCTGTTGAAATCGGCGTCCCCCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:468e548f6767
|
40 | — | — | — |
|
CTACAAGCGCGTCCATCGCACTAATTACGACCCTCAACCG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:e2344291222c
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCTATCCTTCACTCCTTCCTTACCACGTTACGTAAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6212ce0bf28c
|
40 | — | — | — |
|
CCGTATGACTAATTGCATTACCTCAAGTGCCGCTCATAGT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:33e0fcea9a75
|
40 | — | — | — |
|
CACACCACACCCCATAGACGCAATTAACGTAATTGCGGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6df7b53731a9
|
40 | — | — | — |
|
TTCCTCTTTCAATATCGGCTCGGTCTTATCATCCGCCTTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:69c3a52b2141
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCGACTAAGTGCACCGAATTACTCCGTAATTACGACG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:ca54e9b4643f
|
40 | — | — | — |
|
TTTACACGCGTCCAATTAGGCCGTTAGTGCCACCGCCACA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:95e8ff0bf194
|
40 | — | — | — |
|
CCCTACTTGCCACCTACACCGTACGCACCCCGCCCCCTCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_NKX2-3:PRJEB66722:R3:4a51138c9698
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final