ISX_PAX1
CAP-SELEX sample PAX1_ISX; Mixture-SELEX sample PAX1_ISX · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGGTCAACCCGTGAAATGCACCGTAATTAGTGATACGAAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:929ff198ec62
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCGTAACATGATGTAACAAGGATACAATTGTGCATTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:8b2535891f41
|
40 | — | — | — |
|
GACGTACTCGACGTTACGAATATTGGTATTGAGCAATATA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:94bd55a2da58
|
40 | — | — | — |
|
CATACCCGAAAACCTAGACGCGAGCACCCGGTCGACCACT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:a12765fa46a6
|
40 | — | — | — |
|
GGAGTATAAAGATACCGAAAACACCGAAAAAGAAGCTCTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:bff7d6e76bff
|
40 | — | — | — |
|
AATATCATGCTTTGCCTAATCAAGGAAACAATTTGACCTC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:07a06470f2f4
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCTGCCAATTAGGGACTGCCATTAGCTACCTTATAAT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:887e71abc4ed
|
40 | — | — | — |
|
TAATTTGGAGTTTTTACGCAAAATACTCGCACAGCTTAAT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:b5e67b269f7f
|
40 | — | — | — |
|
GAACTGGCGCGATGCGCCCATTACGAGTACACCGCCTGCT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:59ee95b58793
|
40 | — | — | — |
|
CTCGCCCGTGGCCAACAGCAGGAGATACAGGAGCTCCCCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:2835cafc46fa
|
40 | — | — | — |
|
AGGAAACATTAAATGGCCTTAATTACGCACTACCCCGAGC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:8c49394ffb59
|
40 | — | — | — |
|
CATTAATTATGGTGGCAATTTCTAATCGGAAACATACTCT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:1f6be6379e26
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTGCAATTAACGATGCTAAGTATATGCGCGAATTCGC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:cd916411d3cd
|
40 | — | — | — |
|
AAAACGGCAGAACGAACAACAACAACTAAAACACCCGACG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:eedbc92ea10a
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGAATACGCTAATTACCTGCGCGCTTCAACCTTTATT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:3045a9a84ff8
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGACACGCCATCCACTTTAGGCTATTAAGGCGTACCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:1fd067f5d935
|
40 | — | — | — |
|
TTCAATCAGACCAATTTACTTGACGCTCCGACTATCAACC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:1a5345ba3d4a
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGCAAGGGGCGTCTGTAGCTTGCACTGACATTGCGCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:715fdc08c593
|
40 | — | — | — |
|
ACAATATACATGCCCAATCGTTAGCACACTTAGCAGAATT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:81069882a347
|
40 | — | — | — |
|
TAATTCATGCTGCTAGAACAAACCATTACAACACCGCAAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:fe507b2916ed
|
40 | — | — | — |
|
CCTATGTTATGATACGAGTTATTGTAAACAAGCCTAAATG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:bf70da5b6f80
|
40 | — | — | — |
|
TGATTACGCAAGTATAACTCACGACCGTAGCAATCGTCAT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:5811a781d4f2
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCCGTAATAGACTGAAATCAATTATAGAGAATCCAGT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:7559f0435e3c
|
40 | — | — | — |
|
ATTAATGAGTAAAATTAAGCGTAATCCGGCCAGGGTGGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:d89d49a62ba7
|
40 | — | — | — |
|
TGACGCTTATTGGGAAGCAGGGGAGAAATGCGTCTAATGA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:9561ae99bd57
|
40 | — | — | — |
|
GACGAAATGGCTTATACGAACTCTTGCAAGATAACCCAGG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:28bfeac88448
|
40 | — | — | — |
|
GACAATATGCCCCGCACCTGCGAGCAATTAGACCAAATTC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:12e823db40eb
|
40 | — | — | — |
|
GAGCAAAATCAGTAACTCCGTGTTATTAATGCAGAAGCTA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:3c795355d06e
|
40 | — | — | — |
|
AATACGGCCATTCTGGCCACGACGACGCACAACCATTAAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:47b01cb3d507
|
40 | — | — | — |
|
CAACGTCGCAGGATCACCACCCCACACGCACGTCACCTCT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:d864cb1af8a6
|
40 | — | — | — |
|
ACGGAGACGCGTAATCCCCTAATTCGGATGTGATTCGCTC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:2abcbd5df19a
|
40 | — | — | — |
|
TAATAATAGCATTGTCGAACCGACTCGCAGGACAATAGTC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:1caa93c32dd9
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCTTACTTCACACGATAACACAATGGCAAGTTGACAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:207ef1bae20b
|
40 | — | — | — |
|
ATATAGAACTTGCATTTACGTCTTAGGGGCCAATAAACAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:68396ff9da3e
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGTTGGCTAATCAATATCCAAGTGTTCCATCATTTAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:6088dffe9ab7
|
40 | — | — | — |
|
TCGGTAGCACGAATCCTGCGCACATATACGAGGGCGACGA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:454d382f1a87
|
40 | — | — | — |
|
AATTTCGTAAGGCGACGATAACATCTTAATAAGCATGAGC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:e15f4e5c16ba
|
40 | — | — | — |
|
CCCGGCTGATGAATTAGTAAACGATGCTGATATTTTAATT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:12ead4551b40
|
40 | — | — | — |
|
GAGAGGTGAGATAATTACACGCAACAACACGCTGGACTTG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:e1a04365e8ec
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATTGCTGTAAGCTTCTGTAAACACCAGATACTAAA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:87e7d4f0268c
|
40 | — | — | — |
|
CATCACACCTTCACGATTTGTCACCTTGATTCTCAAATCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:21c3f0211396
|
40 | — | — | — |
|
ATAATTAATATGCCGGGCCGTACCATCGTAACCTTCAAGT
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:93c0b6039331
|
40 | — | — | — |
|
GAAAACGAAACGGCACTCATGTAACCGAAGTTGGCATGCA
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:b23946552c9c
|
40 | — | — | — |
|
ATGGACCATTATAAGCGGTAATTTCTCCCAAACGTACCGC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:a5a910270e16
|
40 | — | — | — |
|
CACGCGTGAAAAAGTTAAGACTTGTTACTATCTCAATTAG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:1bb3e9c7a978
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAATGTGGCGAAAATCGAACCACCACTCAATCGTCCG
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:dc93639beab1
|
40 | — | — | — |
|
AAAACAGATAGTGACCATAATTAAGAGCACTAACTTAGAC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:3caace2ede10
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGAAAAATTAAATGTCACAACCTGACAATTGAATGCC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:768bdb166bd9
|
40 | — | — | — |
|
TAAATGGTCAATCTACATTGGCACCAAGGCGCCTATCATC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:a9b70d80c04d
|
40 | — | — | — |
|
CATTATATATACGAAATGGGGACGTTGCAGACACCGGAGC
PANAPTA:Q2M1V0:ISX_PAX1:PRJEB66722:R3:bc28d4ac22e7
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final